一、 實驗?zāi)康?br>掌握堿法小量提取質(zhì)粒DNA。
二、 實驗內(nèi)容 質(zhì)粒DNA的小量提取。
三、 實驗原理 所有分離質(zhì)粒DNA的方法都包括三個基本步驟:培養(yǎng)細菌擴增質(zhì)粒;收集和裂解細菌;分離和純化質(zhì)粒DNA。將細菌懸浮液暴露于高pH值的強陰離子洗滌劑中,會使細胞壁破裂,將質(zhì)粒DNA釋放到上清液中。堿性溶劑使堿基配對完全被破壞,閉環(huán)質(zhì)粒DNA雙鏈由于處于拓撲纏繞狀態(tài)而不能彼此分開。當pH值恢復(fù)到中性時,重新形成完全天然地超螺旋結(jié)構(gòu)。在裂解過程中,細菌蛋白質(zhì)、破裂的細胞壁和變性的染色體DNA會相互纏繞成大型復(fù)合物,與PDS一起沉淀。離心除去變性劑,從上清液中回收復(fù)性的質(zhì)粒DNA。
四、 實驗方法與步驟 ㈠細菌培養(yǎng)和收集 將帶有pUC19質(zhì)粒的大腸桿菌接種在LB固體培養(yǎng)基(含100μg/ml Amp)中,37℃培養(yǎng)12~24小時。在超凈工作臺中用無菌的牙簽挑取平板培養(yǎng)基上的單菌落接種到25ml LB液體培養(yǎng)基(含100μg/ml Amp)中,37℃振蕩培養(yǎng)(220rpm)約18小時至對數(shù)生長后期(OD600=0.6)。 ㈡堿法小量提取質(zhì)粒DNA

1、 將菌液倒入1.5ml的微量離心管中,于4℃12000rpm離心30秒,棄去上清液,將剩余的培養(yǎng)物貯存于4℃。重復(fù)3次,以得到較多的細菌沉淀(視具體情況而定)。 2、 將微量離心管開口倒置在衛(wèi)生紙上,使離心管底部的液體流盡。 3、 加入100μl用冰預(yù)冷的溶液I,在渦旋振蕩器上劇烈振蕩,將沉淀徹底懸浮,然后室溫放置5分鐘。 4、 加入200μl現(xiàn)配的溶液II,蓋緊管口,輕輕快速顛倒離心管(不要振蕩,以避免DNA斷裂),使混合物混勻,冰浴2~5分鐘。 5、 加入150μl預(yù)冷的溶液III,蓋緊管口,溫和顛倒混勻,使粘稠地細菌裂解物均勻地分布于溶液III中,冰浴2~5分鐘。 6、 4℃,12000rpm離心10分鐘。將上清液轉(zhuǎn)入另一只1.5ml離心管中,加入0.6倍體積的異丙醇,室溫放置10分鐘。 7、 4℃,12000rpm離心10分鐘。棄去上清液,在沉淀中加入TE緩沖液500μl,充分溶解。 8、 加入等體積氯仿:異戊醇(24︰1),上下顛倒混勻約30次。4℃,12000rpm離心10分鐘。 9、 取上部水相,移入新的離心管,加入2倍體積預(yù)冷的無水乙醇(也可同時加入1/10倍體積的醋酸鈉),震蕩混勻,室溫放置10分鐘沉淀雙鏈DNA,然后4℃,12000rpm離心10min。 10、 棄去上清液,將離心管倒置于衛(wèi)生紙上,使離心管底部的液體流盡后,加 入預(yù)冷的1ml 70%乙醇。 11、棄去上清液,將離心管倒置于衛(wèi)生紙上,使液體流盡,置DNA濃縮干燥儀中干燥5~10分鐘。 12、將沉淀溶于30μl TE緩沖液,置-20℃保存?zhèn)溆谩?br>
五、 場地、設(shè)備與器材 微量移液器,微量離心管(eppendorf管),離心管架、臺式高速離心機、恒溫振蕩搖床、渦旋振蕩器、電泳儀、瓊脂糖平板電泳槽、恒溫水浴鍋、紫外分光光度計、DNA濃縮干燥儀。
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