黃柏與黃連同樣含較多的小檗堿，故其藥理作用亦大體相似，參見黃連條。但含量較黃連低，并含有其他成分，作用亦有些差異。
　　1.抗菌作用：
　　黃柏抗菌有效成分為小檗堿，故其藥理作用與黃連大體相似，但含量較黃連低。體外試驗對金黃色葡萄球菌、肺炎球菌、白喉桿菌、草綠色鏈球菌、痢疾桿菌（宋內(nèi)氏除外）、溶血性鏈球菌、腦膜炎球菌、霍亂弧菌、炭疽桿菌均有效或有較強的抑制作用；對枯草桿菌、百日咳桿菌、破傷風(fēng)桿菌亦有抑制作用；對H37Rv、鳥型結(jié)核桿菌無直接抑制作用，但可使菌數(shù)減少，但濃度達1%時呈現(xiàn)抑菌作用。在用豚鼠接種人型結(jié)核菌（H37Rv）作實驗治療時，口服或注射的療效均很差。對接種牛型結(jié)核菌的豚鼠，黃柏提取物的鹽酸結(jié)晶物肌肉注射時，有一定療效。黃柏對結(jié)核病人的臨床癥狀及X線檢查有好轉(zhuǎn)，且優(yōu)于黃連。在試管中，黃柏煎劑或浸劑對常見的致病性真菌有不同程度的抑菌作用。其水煎劑不能殺死鉤端螺旋體（劑量需較黃連大I倍）。在體外對陰道滴蟲也有弱的作用。據(jù)報道，黃柏酸堿法提取物制成1：1黃柏液，用灌腸法可治療菌痢，一般2-4天可痊愈。黃柏理療液用直流電導(dǎo)入治療慢性前列腺炎，總有效率達97.3%。
　　2.抗真菌作用：
　　關(guān)黃柏和川黃柏的乙醚浸提物對新型隱球菌和紅色發(fā)癬菌具有較強的抑菌作用，其作用比制霉菌素強，但對白色念珠菌的抑制作用比制霉菌享弱。
　　3.鎮(zhèn)咳作用：
　　黃柏果實的揮發(fā)具有鎮(zhèn)咳作用，其鎮(zhèn)咳成分主要為香葉烯。并從揮發(fā)油中分得小檗堿和5，5'－二甲基糠醛醚。
　　4.降壓作用：
　　黃柏對麻醉動物靜脈注射或腹腔注射，可產(chǎn)生顯著而持久的降壓作用，頸動脈注射較靜脈注射的更強，因此降壓可能是中樞性的。對季銨型的黃柏堿加以改變而合成的叔胺型的化合物名昔羅匹林（Xylopinin）亦可引起迅速、顯著之降壓；在Ⅰ-Ⅱ頸椎間切斷脊髓則降壓消失，因而也證明降壓屬中樞性的。此外，昔羅匹林有較強的抗腎上腺素樣作用，對壓迫頸動脈、窒息、電刺激大內(nèi)臟神經(jīng)引起的升壓反應(yīng)及注射腎上腺素或電刺激頸上交感神經(jīng)節(jié)引起的瞬膜收縮反應(yīng)均受到抑制。
　　5.抗滴蟲作用：
　　黃柏煎劑，10%濃度與滴蟲液1：1混和培養(yǎng)，對陰道毛滴蟲有抑制作用。
　　6.抗肝炎作用：
　　黃柏煎劑6.25-100%體外試驗，對乙型肝炎抗原有抑制作用。黃柏堿對慢性肝炎有一定作用。
　　7.對免疫功能的影響：
　　黃柏煎劑，100%濃度，0.3ml/只灌胃，連續(xù)7天，能增加小鼠脾空斑形成細(xì)胞數(shù)。
　　8.抗?jié)冏饔茫?br>　　黃柏提取物（去小檗堿）100mg/kg 皮下注射，100、1000mg/kg 灌胃或皮內(nèi)注射，對乙醇、阿斯匹林或幽門結(jié)扎誘發(fā)的大鼠胃潰瘍有抑制作用。
　　9.其它作用：
　　黃柏堿和昔羅匹林對中樞神經(jīng)系統(tǒng)有抑制作用，小鼠的自發(fā)活動、各種反射均受到抑制；給予未麻醉家兔昔羅匹林，腦電波可出現(xiàn)振幅慢波。黃柏堿有輕度的箭毒樣作用，對蛙腹直肌緊張度無影響，但能抑制由乙酰膽堿引起的收縮反應(yīng)。對離體兔腸，黃柏粉可增強其振幅，黃柏酮可增強其張力及振幅；黃柏內(nèi)酯則抑制腸管。在帶有胰瘺的家兔身上，黃柏有促進胰腺分泌的作用。黃柏內(nèi)酯在接近致死量（0.05-0.1g/kg）時，可降低兔血糖，黃柏酮無此作用。據(jù)稱黃柏酮有保護血小板的作用。黃柏對孑孓（10ppm在18小時內(nèi)可殺死62%）、家蠅有殺滅作用。此外，還有利尿、健胃、外用促進皮下溢血吸收等作用。
黃柏在高心病特效驗方高心湯中的藥理作用：清熱燥濕，瀉火除蒸，解毒療瘡。用于濕熱瀉痢，黃疸，帶下，熱淋，腳氣，痿辟，骨蒸勞熱，瘡瘍腫毒，濕疹瘙癢。鹽黃柏滋陰降火。用于陰虛火旺，盜汗骨蒸。