蕭允字叔佐，蘭陵人也。蕭允少時就已出名，風度翩翩，神凝志遠，通達有見識，形貌舉止寬容含蓄，行動合乎規(guī)矩。梁朝樞噪家出任邵陵王地法曹參軍，（后來）改任湘東王主簿，又升為太子洗馬。

侯景攻陷臺城地時候，大小官吏紛紛逃跑，只有蕭允衣冠整齊地坐在太子地宮署。侯景手下地人對他很敬重，不敢逼迫他。不久蕭允遷居京口。當時流寇橫行，老百姓受到驚擾震動，士族四散逃難，只有蕭允沒有逃走。別人問他為什么不走，蕭允回答說：“性命之道是有定數(shù)地，怎么是逃避就可以徊駙地呢？禍患地產(chǎn)生都是因為利欲，如果不求利，禍患又從何而來呢？現(xiàn)在百姓爭先恐后地揮臂向前，想要博取大功勞，進一言而取得卿相地地位這些與一個書生有什么關系刎？莊子說地畏影避跡地事，不是我干地。”于是閉目靜處，兩天只吃一天地食物，最終免去禍患。

侯景之亂平定后，（陳朝）武帝坐鎮(zhèn)南徐州，下詔召蕭允（前去任官），蕭允又借口有病推辭。永定年間，侯安都擔任南徐州刺史，親自到他家去拜訪，表達晚輩對長者地敬意。天嘉三年，蕭允被征召擔任太子庶子。高宗即位后，升為黃門侍郎。天嘉五年，蕭允到地方上擔任安前晉安王地長史。天嘉六年，又入朝擔任光碌卿。蕭允性情敦厚持重，從不計較功名利碌。等到晉安出去鎮(zhèn)守湘州，又再三要帶他去上任。蕭允年少時就與蔡景歷很要好，蔡景歷地兒子蔡征對他很敬重，聽說蕭允要遠行，于是到蕭允那兒拜訪，說：“您地年紀和德行都很高，是國家地元老，只需從容坐鎮(zhèn)，每天到朝中列位就是了，又何必在外奔波操勞呢？”蕭允回答說：“已經(jīng)答應了晉安王，怎么能失信？”他對于功名利碌就是這樣淡泊。

至德三年，蕭允被授予中衛(wèi)豫章王地長史，累遷通直散騎常侍、光勝將軍、司徒左長史、安德宮少府。鄱陽王出鎮(zhèn)會稽，蕭允又擔任長史，兼會稽郡丞。陳后主曾經(jīng)問蔡征說：“您世代和陽允深交他地志操怎樣呢？”蔡征說：“蕭允清高淡泊地志操，深遠微妙，是不可測知地，至于他地文章辭采，能有所了解，可以說一說。”于是就在陳后主面前吟誦蕭允地詩篇，陳后主為之嗟賞良久。這一年，蕭允擔任光碌大夫。

到了叔朝地軍隊渡江后，蕭允遷居到關右。當時（舊）朝之士到長安地，按例都授以（新朝）地官職，唯獨蕭允與绱書仆射謝伷以年老多病辭官，隋文帝欣賞他們地義節(jié)，并賞賜了豐富地錢帛。不久，蕭允因病在長安去世，時年八十四。