自主創(chuàng)新是貫穿《規(guī)劃綱要》全篇的主線(xiàn)，是在新的歷史條件下我國(guó)科技發(fā)展的指導(dǎo)思想，涉及科技以至國(guó)家未來(lái)的發(fā)展方向。

但是，在規(guī)劃綱要戰(zhàn)略研討前期，還是有很多不同意見(jiàn)：一些經(jīng)濟(jì)學(xué)家強(qiáng)調(diào)主要是發(fā)揮比較優(yōu)勢(shì)，依靠引進(jìn)技術(shù)。科技界內(nèi)部也是眾說(shuō)紛紜。“這樣的意見(jiàn)實(shí)在出乎我的意料，”徐冠華說(shuō)，“但是中國(guó)知識(shí)分子確實(shí)有著強(qiáng)烈的國(guó)家責(zé)任感和執(zhí)著追求真理的精神。面對(duì)中國(guó)未來(lái)發(fā)展的嚴(yán)峻挑戰(zhàn)和對(duì)自主創(chuàng)新涵義的全面理解，大家在激烈的爭(zhēng)論中最終統(tǒng)一了認(rèn)識(shí)。”

改革開(kāi)放以來(lái)，我國(guó)經(jīng)濟(jì)一直保持著高速增長(zhǎng)的態(tài)勢(shì)，取得了舉世矚目的巨大成就。但企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新能力弱、部分產(chǎn)業(yè)空心化，“8億件襯衫換一架波音飛機(jī)”式的發(fā)展已成為中國(guó)經(jīng)濟(jì)的增長(zhǎng)之痛。同時(shí)受資源、能源、環(huán)境等因素的制約，“高投入、高消耗、高污染和低附加值”的傳統(tǒng)經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)方式的弊病日益顯現(xiàn)。

我國(guó)經(jīng)濟(jì)數(shù)據(jù)的深入分析表明：如果不能大幅度增加科技對(duì)經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)的貢獻(xiàn)率，就不能夠?qū)崿F(xiàn)未來(lái)15—20年經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)的目標(biāo)，全面建設(shè)小康社會(huì)將成為一句空話(huà)。依靠科技進(jìn)步和科技創(chuàng)新來(lái)支撐、引領(lǐng)經(jīng)濟(jì)社會(huì)的協(xié)調(diào)發(fā)展，促進(jìn)經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)方式由要素驅(qū)動(dòng)的粗放型轉(zhuǎn)向創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)的集約型，就成為我國(guó)經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展戰(zhàn)略的必然選擇。

“經(jīng)過(guò)了這幾年的發(fā)展，又經(jīng)歷了2008年以來(lái)的國(guó)際金融危機(jī)，在自主創(chuàng)新這個(gè)問(wèn)題上大家有了更多、更新的共識(shí)?！?/p>

其實(shí)，徐冠華對(duì)自主創(chuàng)新的思考很早就開(kāi)始了。1995年以來(lái)，他長(zhǎng)期負(fù)責(zé)國(guó)家高新區(qū)的工作。那時(shí)候，幾乎每個(gè)月他都要選擇去幾個(gè)高新區(qū)調(diào)研。每次回來(lái)都感覺(jué)充滿(mǎn)信心，自稱(chēng)去“充電”。因?yàn)樗倳?huì)看到高新區(qū)內(nèi)一批批具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的高技術(shù)企業(yè)迅速成長(zhǎng)，看到一個(gè)個(gè)高新技術(shù)的企業(yè)孵化基地和產(chǎn)業(yè)化基地迅速崛起，充滿(mǎn)了自主創(chuàng)新的活力。但他也看到一些高新區(qū)走單純招商引資的道路，瀕臨發(fā)展的盡頭。2001年，他提出了高新區(qū)“二次創(chuàng)業(yè)”的口號(hào)和實(shí)現(xiàn)“五個(gè)轉(zhuǎn)變”的要求，核心是要實(shí)現(xiàn)從注重招商引資和優(yōu)惠政策的外延式發(fā)展向主要依靠科技創(chuàng)新的內(nèi)涵式發(fā)展轉(zhuǎn)變。2002年，他提出調(diào)整以跟蹤和模仿為主的科技發(fā)展思路，大力加強(qiáng)原始創(chuàng)新和集成創(chuàng)新，實(shí)現(xiàn)科技創(chuàng)新戰(zhàn)略的轉(zhuǎn)變。同年5月，他在北京科技產(chǎn)業(yè)博覽會(huì)上再次強(qiáng)調(diào)，“要努力實(shí)現(xiàn)從以跟蹤模仿為主向以自主創(chuàng)新為主的深刻轉(zhuǎn)變?！?/p>

現(xiàn)在，自主創(chuàng)新已深入人心，國(guó)家高新區(qū)已成為具有活力的高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)基地和技術(shù)創(chuàng)新基地，并在這次國(guó)際金融危機(jī)中經(jīng)受了嚴(yán)峻的考驗(yàn)，成為實(shí)施自主創(chuàng)新戰(zhàn)略進(jìn)程中的一面旗幟。

正是在工作中不斷發(fā)現(xiàn)問(wèn)題、獨(dú)立思考、勇于創(chuàng)新的習(xí)慣，使得徐冠華對(duì)我國(guó)科技戰(zhàn)略和政策的認(rèn)識(shí)不斷升華提高。在談到《規(guī)劃綱要》的精神實(shí)質(zhì)時(shí)，徐冠華反復(fù)強(qiáng)調(diào)自主創(chuàng)新思想的極端重要性。他說(shuō)，“現(xiàn)在有的同志對(duì)《規(guī)劃綱要》的理解有簡(jiǎn)單化和片面化的傾向。他們往往把綱要單純地理解為一些優(yōu)先領(lǐng)域、重點(diǎn)項(xiàng)目、重大專(zhuān)項(xiàng)。這是一種誤解?！薄熬V要的核心問(wèn)題還是要解決對(duì)科技工作的認(rèn)識(shí)，以及科技和經(jīng)濟(jì)的關(guān)系問(wèn)題——這個(gè)又集中體現(xiàn)在規(guī)劃的指導(dǎo)方針上?！薄白灾鲃?chuàng)新、重點(diǎn)跨越、支撐發(fā)展、引領(lǐng)未來(lái)”，這是規(guī)劃綱要的指導(dǎo)方針。徐冠華說(shuō)，“這16個(gè)字中核心是頭四個(gè)字——自主創(chuàng)新，這是對(duì)科技工作的基本要求，對(duì)科技和經(jīng)濟(jì)結(jié)合認(rèn)識(shí)的深化，也是科技和經(jīng)濟(jì)結(jié)合的一個(gè)基本體現(xiàn)?！?/p>