1926年，為了紀(jì)念孫中山先生，廣州革命政府決定將國立廣東大學(xué)改名中山大學(xué)，當(dāng)時，中山大學(xué)校務(wù)委員會的主任、副主任分別是戴季陶、朱家驊。這兩個湖州人就職之始即銳意整頓，決心將中山大學(xué)辦成國內(nèi)一流的高校。他們對魯迅評價很高，為了聘請這位現(xiàn)代文壇的“巨子”，多次函電敦促“竭力羅致”，終于如愿以償請來魯迅。朱家驊1925年在北京大學(xué)任過德文系主任等職，和同在北大任教的魯迅相識。對于朱家驊在中山大學(xué)的一系列改革整頓，魯迅也持肯定意見。事實(shí)上，魯迅答應(yīng)南下來中山大學(xué)任教，很大程度上是沖著朱家驊的面子。
    中山大學(xué)在聘請魯迅擔(dān)任文學(xué)系主任兼教務(wù)主任的同時，也聘請了傅斯年擔(dān)任文學(xué)院院長兼哲學(xué)系主任。傅斯年和顧頡剛是同窗好友，而傅又把魯迅視為“文科進(jìn)行之障礙”。于是，傅斯年在中大剛立足，即致電在當(dāng)時史學(xué)界已小有名氣的顧頡剛，要他去中山大學(xué)開辦“中國東方語言歷史科學(xué)研究所”，其目的是想把魯迅擠走。魯迅素來就與顧頡剛不睦，聽說顧頡剛要來，馬上發(fā)表聲明：顧來魯走。后來，魯迅、傅斯年都提出辭職，魯迅辭職是因?yàn)轭欘R剛要來，傅斯年是抗議魯迅不同意校方聘請顧頡剛。中山大學(xué)為此召開全校師生代表會議，表決結(jié)果是主張三人都留下。
    為了平息這場風(fēng)波，當(dāng)時實(shí)際主政中大的朱家驊煞費(fèi)苦心，他一面允許魯迅請假離校（但不同意辭職），一面安排顧頡剛?cè)ソ阋粠閷W(xué)校圖書館購買圖書。這樣一來，魯迅看不到顧頡剛，也就不再堅持辭職了。而顧頡剛是個書呆子，讓他去買舊書，他也就樂不思“粵”了。在朱家驊的苦心斡旋下，兩位勢不兩立的學(xué)界名流才得以在一個學(xué)校相安無事地共處了一個階段。此事的成功應(yīng)歸因于朱家驊的開闊心胸和協(xié)調(diào)能力。
    1927年7月魯迅辭職后，在江浙一帶云游購書的顧頡剛就可以回中山大學(xué)了。朱家驊任命顧頡剛為圖書館中文舊書整理部主任，主持整理他所購的12萬冊書，對愛書如命的顧頡剛來說，這個職務(wù)顯然是樁美差。
    擔(dān)任中大校長的同時，朱家驊還兼任浙江省建設(shè)廳長。在杭州朱家驊聽到不少有關(guān)顧頡剛購書的情形，曾親耳聽一位與自己沾親帶故的湖州書商說過：“我們送顧先生書他都不要，自己要的書也花錢買，這是為公家辦事的人從來沒有過的。”朱家驊因此對顧頡剛印象頗好，他隔幾個月去中大一次，處理校務(wù)，顧頡剛向他申請設(shè)備費(fèi)、印刷費(fèi)，他無不批準(zhǔn)。在朱家驊的支持下，顧頡剛在中大作出了許多成績。
    在中山大學(xué)工作期間，顧頡剛給朱家驊留下了很好的印象。此后，顧頡剛遇到麻煩，總要到朱家驊那里尋求幫助，而后者也是盡力為他排憂解難。
    1933年，顧頡剛和幾位同事在北京成立了一個發(fā)行機(jī)構(gòu)名曰“三戶書社”，專門出版通俗讀物，內(nèi)容是宣傳抗戰(zhàn)。1935年，有人向當(dāng)局舉報，說該社里的人都是共產(chǎn)黨，陳立夫以此為由要將該社查封。顧頡剛便于1936年1月帶了該社所出的出版物到南京去找朱家驊。關(guān)于此事，顧頡剛女兒顧潮女士在自己的文章中說得很清楚，“其時朱先生任交通部長，他翻了這些小書后，稱贊父親的工作，并表示支持；但他又說，因父親不是國民黨員，黨內(nèi)不能信任，遂問父親能否入黨？父親為維護(hù)通俗讀物社起見，就答應(yīng)了。于是他加入了國民黨，不過未曾辦入黨手續(xù)，也未曾與北平市黨部有所接洽，只是以后接到朱家驊所寄入黨證書，成了特別黨員。朱氏幫父親平定了風(fēng)波，不久又在中央黨部里弄到2萬元，匯寄北平，作為該社工作經(jīng)費(fèi)。”
    朱家驊關(guān)照過顧頡剛，顧頡剛也幫過朱家驊的忙。1941年，顧頡剛在成都有穩(wěn)定的工作，有不錯的薪水，而朱家驊連連電邀，要顧頡剛?cè)ブ貞c主編《文史雜志》。與朱家驊見面后，顧頡剛問朱家驊辦《文史雜志》的原因，朱家驊說：“抗戰(zhàn)以來，物價日高，一班大學(xué)教授生活困難。政府正替他們想辦法，辦這個雜志就是辦法的一種，要使能寫文章的文學(xué)院教授們得到些稿費(fèi)作生活的補(bǔ)助。”顧頡剛又問：“為什么一定要我來呢？”朱家驊答：“這個刊物雖是黨部辦的，卻是純學(xué)術(shù)性。以前盧逮曾主編，但他沒有學(xué)術(shù)地位與號召力，決不能編好，所以非請你來不可。”顧頡剛“因感念過去朱氏在中山大學(xué)與自己的交誼，以及對自己辦通俗讀物和邊疆研究兩項工作的支持；且十年來已不專治學(xué)，為時代需要犧牲自己亦無不可，便同意了。”
    朱家驊雖身在官場，但他所結(jié)交的好友中絕大部分為學(xué)術(shù)思想界正直的知識分子，而絕少官場中的官僚，他和顧頡剛的交往就是一個例子。