芝加哥，2149年。嚴(yán)重的環(huán)境問(wèn)題和人口問(wèn)題導(dǎo)致地球不再適宜人類(lèi)居住，人們不戴呼吸機(jī)就不能外出，幾十年來(lái)都沒(méi)有人見(jiàn)過(guò)藍(lán)天白云。主人公Jim SHannon是個(gè)警察，他的妻子Elizabeth是個(gè)醫(yī)生。他們一共生了三個(gè)孩子：Josh、Maddy和Zoe。問(wèn)題是，根據(jù)未來(lái)的法令，一個(gè)家庭只允許存在兩個(gè)孩子，多生一個(gè)即視為違法，家長(zhǎng)將面臨處罰。負(fù)責(zé)計(jì)劃生育的警察在Jim家中發(fā)現(xiàn)了Zoe，Jim為保護(hù)孩子大打出手，結(jié)果被判入獄。

離開(kāi)新紀(jì)元殖民地返回營(yíng)地。他們?cè)谕局锌吹搅薙kye等人乘坐的運(yùn)輸車(chē)，決定偷走車(chē)上的能量塊。可是沒(méi)等他們得手，一群可怕的鞭尾龍襲擊了他們。Skye、Josh等人準(zhǔn)備啟程回家時(shí)發(fā)現(xiàn)了這可怕的事情，趕緊躲進(jìn)第六團(tuán)的運(yùn)輸車(chē)。周?chē)谋尬昌堅(jiān)骄墼蕉?，他們?cè)噲D用槍將它們趕走。

新紀(jì)元殖民地遭受一大群翼龍的攻擊，Jim和Taylor必須在事態(tài)失控之前找到解決之道。Elisabeth發(fā)現(xiàn)自己的老情人也在新紀(jì)元殖民地居住，而且可能和她被「選中」有一定的關(guān)系。Syke想讓Josh找到「家」的感覺(jué)，Reynolds表現(xiàn)出保護(hù)Maddy的姿態(tài)。

新紀(jì)元殖民地與附近一個(gè)科學(xué)考察站失去無(wú)線(xiàn)電聯(lián)系，Elisabeth、Jim、Malcolm和Taylor決定到現(xiàn)場(chǎng)去調(diào)查。他們發(fā)現(xiàn)一種神秘的病毒襲擊了該考察站，令人們失去記憶、產(chǎn)生幻想并最終導(dǎo)致死亡。這四人必須團(tuán)結(jié)一致，盡快找到解決之道，否則不僅他們自己性命不保，整個(gè)新紀(jì)元殖民地都會(huì)有危險(xiǎn)。

一個(gè)「第六團(tuán)」的孤兒來(lái)到新紀(jì)元殖民地尋求庇護(hù)，Elizabeth認(rèn)為他們應(yīng)當(dāng)收留她，但Jim卻不信任她。Mira試圖收回一件對(duì)她來(lái)說(shuō)極為珍貴的東西；Taylor懷疑「第六團(tuán)」的間諜就隱藏在高階軍官及平民領(lǐng)袖當(dāng)中；Reynolds首次向Maddy承認(rèn)他喜歡她。

一顆墜毀的流星導(dǎo)致所有高科技設(shè)備失靈，在殖民地引發(fā)了恐慌。與此同時(shí)，Maddy和Reynolds被困在荒郊野外。Elizabeth和Skye必須共同拯救一條生命，Taylor試圖阻止Mira和「第六團(tuán)」乘亂發(fā)動(dòng)突襲。一個(gè)神秘人悄然出現(xiàn)……

Taylor繼續(xù)在新紀(jì)元殖民地內(nèi)部搜尋第六團(tuán)的間諜；Jim無(wú)意中發(fā)現(xiàn)一起陳年謀殺案，Taylor成了頭號(hào)嫌疑人。

第11批「朝圣團(tuán)」抵達(dá)新紀(jì)元殖民地，也帶來(lái)了兇惡的敵人。在Lucas和Mira的幫助下，神秘的鳳凰組織派出大批戰(zhàn)士對(duì)新紀(jì)元殖民地發(fā)動(dòng)攻擊，并開(kāi)展資源掠奪的前期準(zhǔn)備工作。