育種最基本的根據(jù)是遺傳學(xué)，這一點非常容易理解，也就是大家常說的龍生龍鳳生鳳。其次是自然界的優(yōu)勝劣汰法則，育種就是將優(yōu)良的品質(zhì)保持下去而將劣質(zhì)的品質(zhì)拋除的過程。雜交育種即讓同一物種不同品種的個體之間相交，把分散在不同品種間的優(yōu)良性狀集中到一個新的品種上，這就是常說的雜種優(yōu)勢。育種就是在雜交后代中選留符合育種目標(biāo)的個體進(jìn)一步培育，直至獲得優(yōu)良性狀穩(wěn)定的新品種。

拿小麥育種來說，如果有兩個品種，一個品種穗大、品質(zhì)好、產(chǎn)量高，但是易倒伏、抗病能力差，另外有一個品種產(chǎn)量極低、品質(zhì)差，但是根系發(fā)達(dá)、抗倒伏、抗病性強(qiáng)，能不能將二者的優(yōu)勢互補(bǔ)呢？從理論上講，這兩種小麥品種如果能夠雜交，就能夠從中選出既具高產(chǎn)量、高品質(zhì)，又具根系發(fā)達(dá)、抗病性、植株矮化的新品種。我們先將這兩個品種進(jìn)行雜交，然后將雜交后收獲的種子播下去，種出來的第二代小麥可能就出現(xiàn)了很多分化，有的長的比兩個親本長得好，有的差；再選擇其中長得好的優(yōu)勢種群選出來，再播種再收獲，如此反復(fù)，直到種出的種子都保持高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病、抗倒伏等優(yōu)良性狀保持穩(wěn)定為止。這樣的種子即是我們用于大田推廣的優(yōu)良品種。

這種育種方式是最基本最基礎(chǔ)的方法，簡單點兒說，育種過程是先雜交后自交。小麥的花是兩性花，即一朵小花中既有雄蕊又有雌蕊。小麥?zhǔn)菄?yán)格自花授粉作物，而且花非常小，這就意味著實現(xiàn)小麥人工雜交的工作量非常大。在實際操作中，要根據(jù)確定的雜交組合在母本的群體中選擇典型、健壯的主莖穗，并去掉發(fā)育不良的小花，然后將保留的小花去雄（即取出雄蕊），然后將父本的花粉授到母本，這樣就完成了育種的第一步：雜交。同樣是禾本科的水稻育種通過人工去雄的方式則很難獲得雜交種，主要原因是水稻花的結(jié)構(gòu)與小麥不同，去雄難以實現(xiàn)，即使能夠去雄獲得的種子也往往發(fā)育不良，不能獲得優(yōu)良的種子。因此袁隆平院士發(fā)現(xiàn)的水稻雄性不育植株成為水稻育種史上的一個里程碑。

玉米育種與小麥恰恰相反，是先自交后雜交，其共同點是要通過連續(xù)多年的自交來選育優(yōu)良的基因純合體，不同的是小麥育種是先雜合后純合，玉米育種是先純合后雜合。玉米的花是單性花，即一朵花中只有雌蕊或只有雄蕊。玉米是異花授粉作物，其異花授粉率為20%-50%，因此玉米的雜交相比小麥要簡單得多。育種時，要同時制備父本和母本的自交系，經(jīng)過幾年的純合后，將兩個自交系在一起種，一行父本，兩行母本，再將母本的雄穗去掉，授上父本的花粉，母本即產(chǎn)生第一代單交種。這就是我們大田推廣的雜交一代（F1）。

所以說小麥種可以留種，今年收獲的種子種下去，來年收獲的還是同樣的種子。玉米種則不能留種，今年收獲的種子種下去，不但長得參差不齊，籽粒形狀也不同，單產(chǎn)也會降低。

總之，所有的育種方法都離不開這些基本原理，要么先雜交要么先自交，自交是為了獲得控制某種性狀的基因的純合體，雜交則要體現(xiàn)親本間的優(yōu)勢互補(bǔ)?，F(xiàn)代育種由于采用了更先進(jìn)的物理、化學(xué)處理方法，大大加快了育種的進(jìn)程