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      兔皮膚真菌病病原PCR快速診斷技術研究

       我心飛揚695 2016-06-23


       

      摘  要:兔皮膚真菌病近年來在我國各地流行嚴重,其病原菌靠傳統(tǒng)的表型特征鑒定難以區(qū)分,本文從浙江、江蘇等各地發(fā)病的21個兔場各品種兔中通過培養(yǎng)分離純化出17株真菌,在培養(yǎng)特性等表型特征初步鑒定的基礎上,進一步建立了PCR快速診斷技術,通過基因擴增和序列測定,能夠正確作出鑒別診斷,分別鑒定出須癬毛癬菌10株、犬小孢子菌5株和趾間毛癬菌2株,其擴增的基因片段大小分別為692bp、741bp708bp。


      關鍵詞:兔皮膚真菌?。徽婢?/span>PCR;診斷

       

      近年來在全國各地流行的兔皮膚真菌病是我國當前危害養(yǎng)兔業(yè)最為嚴重的皮膚病,發(fā)病率可達30%95%,發(fā)病死亡率可達10%30%,各地兔場均有發(fā)生,各品種兔均能發(fā)病,兔場一旦感染,由于該病的頑固性,便很快傳遍整個兔場,嚴重影響其生長性能及皮毛的質量,從而影響?zhàn)B殖者的經(jīng)濟效益。為此,很多學者開展了對該病的研究,取得了很大的進展,但仍然有許多問題拯待解決,其中病原方面的,由于其直接暴露于空氣中,因此病原復雜,到底是單一的病原真菌還是多病原感染,因此需要一種能及時快速作出診斷的方法,為此我們根據(jù)分離的病原真菌中,在培養(yǎng)特性等表型方面作出初步鑒定的基礎上,設計了引物,進一步建立了PCR快速診斷技術,能夠快速、正確的作出診斷,為該病提供相應的防治技術奠定基礎。

      1  材料和方法

      1.1  皮膚真菌病病原分離鑒定

      1.1.1  皮膚真菌病原分離  赴浙江省的建德、寧波、臨海、嵊州、新昌、嘉善、桐鄉(xiāng)及江蘇等地發(fā)病的兔場,對發(fā)病的獺兔、肉兔、長毛兔等病兔在病變部位采用酒精消毒,在病健交界處用消毒眼科鑷子夾取結痂的皮屑置于TSA培養(yǎng)基上,于28℃、濕度75%的真菌恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),57天后觀察結果,并據(jù)培養(yǎng)情況進一步分離純化。

      2)分離病原真菌表型初步鑒定

      分離純化培養(yǎng)后,觀察菌落的形態(tài)、大小、色彩;進而在顯微鏡下觀察菌體、菌絲、孢子的形態(tài)特征,明確其培養(yǎng)特性、生長特性、形態(tài)特征等表型特征,初步鑒定出其種類。

      2  皮膚真菌病PCR快速診斷技術

      TSA培養(yǎng)基培養(yǎng)分離鑒定的病原真菌,在真菌恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)35天后,用液氮法提取基因組DNA,根據(jù)相關霉菌已知的基因序列設計ITS引物,采用PCR技術擴增出分離菌的基因,優(yōu)化基因組DNA提取和基因擴增條件,建立起皮膚真菌病PCR快速診斷技術。

      2.1  真菌基因組DNA提取方法

      TSA培養(yǎng)基上培養(yǎng)分離鑒定的病原菌,在真菌恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)35天后,用無菌接種環(huán)從固體培養(yǎng)基上挑取菌苔于研缽中,加入少量液氮,用研磨棒稍加研磨,然后在研缽中加入1mL 10%w/v)的Chelex-100 溶液,在旋渦混合器上振蕩5s,沸水浴10min,冷卻至室溫后12,000r/min離心15min,轉移上清置于-20℃凍存?zhèn)溆?,上清即可作?/span> PCR的模板。

      2.2  引物設計

      根據(jù)基因庫已知的序列設計以下通用引物:

      TCCGTAGGTGAACCTGCGG ITS1   5’-3’

      TCCTCCGCTTATTGATATGC ITS4    5’-3’

      2.3  rDNA-ITS PCR反應體系及操作程序

      50 μl 反應體系:2 μl DNA原液,25 μl 2×EasyTaq PCR Super Mix 溶液,引物各2 μl20umol/L),ddH2O19 μl。反應在PE-9600 PCR 儀上進行,程序為:95℃變性 3min;94℃變性1min,55℃復性 1min,72℃延伸 1.5min;進行35 個循環(huán),72℃延伸10min。反應完成后,取5 μlPCR 產(chǎn)物在 2%瓊脂糖凝膠100V 電泳,260nm 紫外燈下觀察結果,并對PCR產(chǎn)物送檢測序。

      3  結果

      3.1  皮膚真菌病病原分離及表型初步鑒定結果

      在浙江省的建德、寧波、臨海、嵊州、新昌、嘉善、桐鄉(xiāng)及江蘇等發(fā)病的21個兔場中,分別從肉兔、獺兔、長毛兔等各品種病兔中分離到真菌17株,分屬于須癬毛癬菌10株、犬小孢子菌5株和趾間毛癬菌2株。其中分離到最多的致病菌是須癬毛癬菌(又稱石膏樣毛癬菌),幾乎每個兔場中均能分離到,其次為犬小孢子菌和趾間毛癬菌。見圖1。


      3.1.1  須癬毛癬菌表型特征  須癬毛癬菌表型特征主要為:恒溫箱中培養(yǎng)72h后,TSA瓊脂上能看到培養(yǎng)基表面長出雪花狀菌落,至第6天長出霉菌樣菌落。菌落大小直徑約0.5lcm,呈不規(guī)則形態(tài),菌落頂部呈白色粉末狀,菌落扁平微隆起,邊緣呈輻射狀向外生長;菌落背面呈棕褐色;菌落下層致密,質地較硬。

      用接種環(huán)挑取菌落,置于少許生理鹽水的玻片上,于顯微鏡下觀察,可見多量的菌絲和孢子,有的成串,呈粟粒樣;菌絲細長有節(jié),有的呈螺旋狀,菌絲上有小梗;小分生孢子多量,單個或成叢,形態(tài)近乎圓形或橢圓形;大分生孢子很少。根據(jù)這些表型特征,初步鑒定為須癬毛癬菌。

      3.1.2  犬小孢子菌表型特征  犬小孢子菌表型特征主要為:恒溫箱中培養(yǎng)72小時后,TSA瓊脂上能看到培養(yǎng)基表面長出雪花狀的菌落,至第6天長出大菌落,生長非常迅速,菌落直徑大于5cm,呈不規(guī)則圓形,菌落中部比周邊低,周邊蓬松上翹,并呈羽毛飄逸狀往周邊生長,正面呈白色羽毛狀;菌落背面也呈白色。根據(jù)菌落的表型特征,初步鑒定為犬小孢子菌。

      3.1.3  趾間毛癬菌  TSA培養(yǎng)基上28℃、濕度75%的真菌恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),57天后觀察菌落,大小直徑約0.5lcm,呈規(guī)則圓形,饅頭狀隆起,菌落頂部孢子呈粉紅色粉末狀,與周邊色差分明,個別菌落上摻雜著黑色孢子的顏色;菌落周邊主要為菌絲,呈白色;菌落背面呈白色;根據(jù)菌落的表型特征,初步鑒定為趾間毛癬菌。

      由上可見,雖然能從菌落的大小、生長形態(tài)、顏色等基本表現(xiàn)作出初步判斷,但由于有些真菌的生長形態(tài)等表型特征非常相似,相互間很難作出正確的區(qū)分,因此要作出正確的鑒定,必須從分子生物,特別是采用PCR的技術,對分離菌作出最終的鑒定。

      4  兔皮膚真菌病原菌PCR快速診斷技術

      TSA培養(yǎng)基培養(yǎng)已分離純化的病原真菌,在真菌恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)35天后,用接種環(huán)無菌挑取菌苔于研缽中,用液氮法提取基因組DNA,根據(jù)設計的通用引物ITS及相應的PCR操作程序,對根據(jù)表型初步鑒定的3種真菌進行PCR擴增,結果見圖2。

      收集擴增后的產(chǎn)物送檢生物公司進行測序,結果如下圖3

      根據(jù)測序結果表明,大小分別為692bp741bp708bp,通過基因BankBLAST軟件進行比對,結果表明分別為須癬毛癬菌、犬小孢子菌和趾間毛癬菌。再與表型鑒定相結合,作出相應的鑒定結果,分別為須癬毛癬菌10株、犬小孢子菌5株和趾間毛癬菌2株。

      研究結果表明,建立的PCR技術能夠快速、敏感、準確地鑒定出兔皮膚真菌病原菌。

      5  結論和討論

      根據(jù)以上結果,分離鑒定的兔皮膚真菌病病原菌,在培養(yǎng)純化后,從形態(tài)、生長特性、色澤、大小等表型特征作出初步的判斷,但由于真菌種類繁多,空氣中本身就有很多非病原真菌的存在,而且很多病原真菌在形態(tài)等表型特性上很相似,單憑表型特征很難進行區(qū)分,如須癬毛癬菌和趾間毛癬菌,菌落形態(tài)非常相似,無法區(qū)分,因此必須采用分子生物學的技術手段才能作出正確的鑒定,本文建立的PCR診斷方法能有效鑒別出須癬毛癬菌、犬小孢子菌和趾間毛癬菌,基因片段大小分別為692bp、741bp708bp。

      從浙江、江蘇等省的21個兔場中共分離出17株菌病原真菌,通過表型判斷及PCR鑒定結果,共鑒定出須癬毛癬菌10株(又稱石膏樣毛癬菌)、犬小孢子菌5株和趾間毛癬菌2株。這個結果與各地學者報道的基本一致,感染最多的是石膏樣毛癬菌,幾乎每個兔場、不同的品種中均能分離到該菌,說明其是主要致病菌,但分離鑒定的其它幾種菌,如犬小孢子菌、趾間毛癬菌報道的很少,其致病性的強程度有待進一步的人工發(fā)病試驗,以證實其致病性及毒力。

      建立的PCR檢測方法能有效鑒定不同的菌屬種類,因此建立的方法是一種準確、快速、敏感的診斷方法。由于真菌孢子的壁比較硬,用常規(guī)提取細菌DNA的方法可行性比較差,我們嘗試過用超聲等提取基因組的方法,結果都不理想,后來改用液氮預處理的方法,結果表明效果良好。

       

      參考文獻:

      [1]韋強 肖琛聞 季權安 劉燕 鮑國連等,兔皮膚真菌病流行病學調(diào)查及病原分離鑒定,中國養(yǎng)兔,2014,2024:25-27.

      [2]劉彥威,劉 娜,兔須癬毛癬菌分類研究進展,動物醫(yī)學進展,2013,34(5)107-109.

      [3]崔麗娜,高淑霞,姜文學,楊麗萍等,山東兔場皮膚真菌病病原rDNA-ITS區(qū)序列測定及分析,中國獸醫(yī)學報,2011,31(12):1749-1754.

      [4]趙長城,訾士魯,李福寶.兔皮膚真菌病的流行病學和診斷.[J]動物醫(yī)學進展,2005,27(1)104-107.

      [5]劉德昊,楊光友,賴松家,.四川地區(qū)兔脫毛癬病的病原學研究.[J]中國預防獸醫(yī)學報,2006,286):622-624.


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