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      (文章篇)S4E09: 做microRNA研究,提升文章檔次的三個(gè)錦囊。

       op1116 2016-07-31

      大家好,今天我們介紹這篇文章:MicroRNA-143 Activation Regulates Smooth Muscle and Endothelial Cell Crosstalk in Pulmonary Arterial Hypertension.Circ Res(IF 11.0). 2015 Oct 23;117(10):870-83. (全文下載鏈接:http://pan.baidu.com/s/1nvkw6ed 密碼:ytw9),并在文后總結(jié)部分給大家提升文章檔次的三個(gè)錦囊。

      首先我們看文章的機(jī)制圖:


      在PASMC(肺動(dòng)脈平滑肌細(xì)胞)中,肺動(dòng)脈高壓發(fā)生相關(guān)信號(hào)通路通過(guò)激活miR-143/145啟動(dòng)子活性調(diào)節(jié)miR-143/145的表達(dá)。 在血管重構(gòu)過(guò)程準(zhǔn)哦功能,MiR-143-3p作為旁分泌信號(hào)來(lái)介導(dǎo)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、調(diào)控凋亡。在PAH(肺動(dòng)脈高壓)進(jìn)展過(guò)程中,PASMC分泌包含miR-143-3p的外泌體,并被轉(zhuǎn)運(yùn)到PAEC(肺動(dòng)脈內(nèi)皮細(xì)胞)誘導(dǎo)細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)和血管生成。

      這篇文章的內(nèi)容包括三部分:

      1. MiR-143在PAH動(dòng)物模型、病人樣本中高表達(dá),而且miR-143/145的表達(dá)激活是由于其啟動(dòng)子上游區(qū)域含PAH相關(guān)信號(hào)通路中轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)所導(dǎo)致;


      2. MiR-143體外功能:影響PASMC的運(yùn)動(dòng)和凋亡;而MiR-143敲除或者抑制后改良了缺氧導(dǎo)致的PAH表型;


      3. MiR-143通過(guò)PASMC分泌的外泌體傳遞到PAEC,并調(diào)節(jié)PAEC的運(yùn)動(dòng)和血管形成能力。

      我們先看一下PASMC與PAEC的共培養(yǎng)體系(與Transwell非常像):


      作者分別用共培養(yǎng)體系和來(lái)源于PASMC的培養(yǎng)基,來(lái)評(píng)估含MiR-143的外泌體從PASMC分泌到PAEC,并對(duì)PAEC運(yùn)動(dòng)能力的影響。



      然后評(píng)估PASMC來(lái)源的外泌體中miR143對(duì)PAEC運(yùn)動(dòng)和血管形成能力的影響。



      最后總結(jié)一下,這篇文章有幾個(gè)關(guān)鍵詞:microRNA;外泌體;肺高血壓;轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),這篇文章之所以能發(fā)11分,我們有哪些亮點(diǎn)可供參考,以幫我們提升文章的檔次:

      1. 不走下游走上游:作者選microRNA143/145簇(cluster)作為關(guān)鍵分子,對(duì)microRNA的經(jīng)典套路來(lái)說(shuō),一般會(huì)從下游著手,比如預(yù)測(cè)靶基因,然后在PASMC中驗(yàn)證microRNA143/145在PASMC中的功能(運(yùn)動(dòng)、凋亡),然后通過(guò)熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)證明microRNA143/145對(duì)靶基因的調(diào)控;而作者呢,則反其道而行之,研究microRNA上游的因子對(duì)表達(dá)的調(diào)控,此為亮點(diǎn)一;當(dāng)然,對(duì)microRNA啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的分析驗(yàn)證、以及對(duì)甲基化等其他可能調(diào)控microRNA表達(dá)因素的排除也是我們學(xué)習(xí)的地方;

      2. 引入熱點(diǎn):外泌體,在通過(guò)PASMC驗(yàn)證了microRNA143的功能后,作者進(jìn)一步研究了外泌體中的microRNA143在PASMC與PAEC細(xì)胞通訊中的作用,在對(duì)外泌體進(jìn)行大小、電鏡、Marker等方式進(jìn)行鑒定后,通過(guò)共培養(yǎng)體系、條件性培養(yǎng)基兩方面驗(yàn)證外泌體在PASMC與PAEC細(xì)胞通訊中的作用,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和方法都很經(jīng)典,所以做microRNA研究的小伙伴,除了常規(guī)實(shí)驗(yàn)外,可以考慮外泌體作為加分點(diǎn)哦!

      3. 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表型逆轉(zhuǎn)考慮到動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的復(fù)雜性,體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的表型有一定概率在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)難以重復(fù),不可否認(rèn),作者通過(guò)體內(nèi)動(dòng)物模型實(shí)驗(yàn)對(duì)microRNA143的進(jìn)行了干預(yù),并逆轉(zhuǎn)了PH的表型,這是本文加分的第三點(diǎn)。

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