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      如何用photoshop計算蛋白條帶的灰度值?

       微笑如酒 2016-08-25

      在western blot或者DNA電泳條帶中,經(jīng)常需要半定量統(tǒng)計條帶的灰度值,比較常用的是用ImageJ這個軟件來統(tǒng)計,但是如果不熟悉操作很容易得出錯誤的統(tǒng)計數(shù)據(jù)。本文從原理到操作告訴你如何用photoshop來統(tǒng)計灰度值




      首先進行實際操作之前我們先來理解下什么叫做灰度值


      如上圖所示,灰度值就是從黑到白漸變過程中對應的數(shù)值。0代表黑色,255代表白色。


      上圖所示正常western blot條帶和反向之后的條帶。 上圖的箭頭分別指出了條帶以及背景對應的區(qū)域。在正常條帶中條帶的值約為20,背景值為80;在反向圖片中,條帶的值 約為200,背景值為130。我們習慣了條帶越粗亮灰度值越大,因此我們一般是對其進行反向之后測量。


      在這里一定要去掉背景,至于為什么要去掉背景,在此不多說了(視頻教程里將詳細介紹)請看下面圖片:




      那么接下來開始我們今天的教程:

      1. 打開圖片,因為圖片有點傾斜,我們需要將其擺正,有兩種方法進行拉直,第一種是將圖層旋轉(zhuǎn)(Ctrl+T,然后旋轉(zhuǎn)至其擺正),另外一種是使用標尺工具,在左邊快捷欄中安卓吸管工具不放,選擇標識工具,然后在條帶上面從左邊點按住鼠標不放一直拖動到最右邊,最后點擊拉直圖層即可。




      2. 點擊菜單欄的“窗口”,選擇直方圖,彈出下面面板



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