數(shù)以百計的不同細菌類型生活在我們人類腸道中，幫助我們消化食物。這些細菌的代謝過程不僅對我們的健康非常重要，而且由于它們本身也十分復雜，因此會帶來許多出乎人意料的影響。

想知道它們在我們體內做什么嗎？在這一方面，來自盧森堡大學系統(tǒng)生物醫(yī)學中心 (LCSB)的研究人員走出了重要的一步：他們在計算機上模擬了人類腸道細菌群落，也就是微生物組的復雜性。研究人員收集了773種菌株代謝已知數(shù)據，由此研發(fā)出了針對每一種菌株的計算機模型—— AGORA ，利用這一模型，研究人員能模擬微生物代謝過程，分析它們對其它微生物和宿主代謝的影響。

生活在人類腸道中的多種細菌不僅幫助我們消化食物，而且也為我們帶來了寶貴的維生素，甚至影響我們代謝藥物的方式。這些細菌的代謝過程對我們的健康至關重要，因此在許多疾病中也扮演了關鍵作用。

但迄今為止我們對它們的了解并不多，Ines Thiele研究組為此構建了一個目前最大規(guī)模的，包含773個不同腸道微生物的計算機模型，捕捉每種細菌的代謝。

“AGORA 基于一種細菌代謝模型比較重建的新概念。因此比較于以往的模型，這種方法能分析更多數(shù)目的細菌菌株。利用AGORA 和其它數(shù)據庫，我們能系統(tǒng)分析腸道微生物中的代謝相互作用，以及這些相互作用如何受到外部的影響，譬如飲食和宿主代謝，”Thiele說。

文章第一作者Stefania Magnusdottir補充道，通過收集已知實驗和基因組數(shù)據，我們可以描繪每一種微生物的代謝，發(fā)現(xiàn)它們的代謝過程，和人體飲食對微生物之間相互作用的影響，由此構建個體微生物組模型。

“利用我們的模型，可以有針對性的檢索具有重要功能的代謝途徑，分析這些代謝進程出錯，為何會啟動疾病。AGORA模型也能幫助我們分析宿主-微生物組相互作用對特殊疾病的影響， 或者利用它們進行個體精準治療，”另外一位作者Ronan Fleming博士說。

Thiele認為，高精度分析并不是研究本身的目的，“我們希望能了解在改變飲食的時候，微生物如何調控人體代謝，這將能讓我們掌握如何預防，甚至治療疾病，比如說通過發(fā)現(xiàn)能將疾病腸道微生物組改變成健康微生物組功能的膳食補充劑。”