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      小技巧 | PCR引物不好設(shè)計(jì)怎么辦?

       teszsz 2017-03-17

             

            很多時(shí)候我們需要對某DNA片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增進(jìn)行下一步測序,但經(jīng)常會發(fā)現(xiàn)有些引物不理想,可能是位于序列重復(fù)區(qū),可能是有引物二聚體,可能是有很多非特異的擴(kuò)增產(chǎn)物,在這里游俠向大家推薦一個(gè)網(wǎng)站。

      http://www./order/genome-database/searchResults,選擇primer design。


      有三種方式:

      第一種是直接輸入目標(biāo)信息,可以是基因名稱,SNP編號或DNA序列

      第二種是直接輸入基因組位點(diǎn)(hg38),如果你的突變位點(diǎn)是hg19,可以通過liftOver進(jìn)行轉(zhuǎn)換http://genome./cgi-bin/hgLiftOver,

      第三種是直接上傳vcf或bed文件。

      我們直接輸入rs671,結(jié)果如下


      是的,可以直接訂購哦,只要88元人民幣,真是良心價(jià)!事先聲明游俠沒有收廣告費(fèi),為了測試一下真實(shí)實(shí)力,我們輸入了脊肌萎縮癥SMN1基因上那個(gè)獨(dú)特的c.C840T突變,果然沒有讓我失望,它沒有設(shè)計(jì)出來,不過游俠認(rèn)為這對于一般的驗(yàn)證是足夠了,性價(jià)比不錯(cuò)。

      感謝良培基因的譚灝文博士提供上述網(wǎng)站。


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