經(jīng)過近幾年的臨床實踐,無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測(NIPT)技術已在全世界范圍內(nèi)得到廣泛應用,其對于21三體、18三體及13三體綜合征檢測的高靈敏度和高特異性,受到了臨床醫(yī)生和孕婦的一致認可。隨著技術的發(fā)展和臨床實踐的深入,NIPT的檢測范圍已逐步擴展到染色體微缺失/微重復等亞染色體水平的結構異常的檢測。 染色體結構異常所導致的疾病種類較多,綜合發(fā)病率也較高,部分患病胎兒宮內(nèi)表型并不明顯,難以通過唐氏篩查、B超等傳統(tǒng)產(chǎn)前檢查手段發(fā)現(xiàn)異常。但攜帶此類染色體異常的胎兒出生后,往往具有嚴重的生長發(fā)育和智力異常,并且合并多種疾病或臟器損傷,難以治愈。這使得包括染色體微缺失/微重復在內(nèi)的其他類型染色體異常的產(chǎn)前檢測成為臨床新需求。 安諾優(yōu)達作為衛(wèi)計委首批高通量測序技術臨床應用試點單位,一直致力于推動NIPT技術的發(fā)展和臨床轉化。針對新的臨床需求點,安諾優(yōu)達擴充了NIPT的檢測范圍,在NIPT檢測過程中,如發(fā)現(xiàn)其他染色體異常,均會以補充報告的形式通知受檢者和臨床醫(yī)生(受檢者自愿知情),并將為受檢孕婦再免費贈送NGS染色體異常檢測,從而為臨床選擇合適的診療方案的提供參考。 案例 1 范某,41歲,女,末次月經(jīng)2015.12.19,G3P1,自然受孕單胎。NT值在正常范圍內(nèi),中孕期唐氏篩查顯示21三體、18三體均為低風險。 孕21+3周就診,考慮高齡因素,建議產(chǎn)前診斷?;颊吲c家屬優(yōu)先選擇無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測。當日抽取孕婦外周血10ml送檢安諾優(yōu)達。 NIPT檢測結果:胎兒21三體、18三體、13三體均為低風險(圖1)。
補充報告:dup(12)(p13.33p11.1),提示12號染色體短臂存在31Mb左右的重復(圖2)。 圖2. NIPT檢出12號染色體短臂片段重復結果 超聲未見異常,孕24周,征得患者及家屬意見進行羊水穿刺進一步診斷。核型分析結果:46,XN(正常) 同時進行了基因芯片分析,AffymetrixCyoScan750K Array結果顯示:arr12p13.33p11.1(173,786-34,835,641)×3,,12號染色體短臂存在34.66M片段重復。 此外,由于分辨率有限,核型分析無法檢出一些微小的片段缺失或重復,安諾優(yōu)達針對報出其他染色體異常的受檢孕婦,均免費贈送NGS染色體異常檢測,為孕婦提供雙重保障。 安諾優(yōu)達免費進行的NGS羊水染色體異常檢測結果顯示12號染色體12p13.33-12p11.11存在34.75M的片段重復(圖3)。 圖3. 羊水NGS檢出12號染色體短臂片段重復結果 NIPT血漿檢測結果與胎兒羊水的芯片及NGS檢測結果一致。 案例 2 趙某,36歲,女,末次月經(jīng)2015.11.22,G2P1,自然受孕單胎,孕15+4周就診,鑒于高齡因素,孕婦及其家屬要求進行無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測。當日抽取孕婦外周血10ml送檢安諾優(yōu)達。 NIPT檢測結果:胎兒21三體、18三體、13三體均為低風險。 圖4. 高通量基因測序產(chǎn)前檢測臨床報告單結果 補充報告:del(3)(q27.3q26.33),提示3號染色體長臂存在4Mb左右的缺失(圖5)。 圖5. NIPT檢出3號染色體長臂片段缺失結果 22周系統(tǒng)B超顯示胎兒食道閉鎖,且胎兒眼眶橫切面均顯示胎兒右側眼眶較小,內(nèi)可見晶狀體回聲。征得患者及家屬意見在23周時進行羊水穿刺進一步診斷。 核型分析結果:46,XN。 圖6. 核型分析結果 圖7. 羊水NGS檢出3號染色體長臂片段缺失結果 安諾優(yōu)達同步提取羊水基因組DNA,進行NGS檢測,結果顯示該樣本在3q26.33-3q27.3存在7.4Mb(GRCh37:Chr3:179160005-186560004)缺失,缺失片段與小眼畸形綜合征3(Microphthalmia syndromic 3)有關,羊水NGS檢測結果與NIPT檢測結果一致,均顯示缺失片段與小眼畸形綜合征3有關。 結論 作為NGS領域最成功的臨床轉化應用,NIPT憑借其精準的檢測結果已被廣泛應用于21三體、18三體、13三體綜合征的檢測。全基因組覆蓋、低檢測成本以及非侵入性取樣,使得檢測染色體微缺失/微重復等亞染色體水平的結構異常成為NIPT臨床轉化的下一個熱點。時隔三年,國際產(chǎn)前診斷協(xié)會(ISPD)于去年對NIPT最新臨床指南進行了突破式的更新,明確指出NIPT可以針對已研究清楚的染色體微缺失/微重復綜合征進行檢測。此外,歐洲人類遺傳協(xié)會(ESHG)和美國人類遺傳學協(xié)會(ASHG)聯(lián)合制定了NIPT責任建議書,并發(fā)表于《歐洲人類遺傳學雜志》。建議書中明確指出,為受檢者提供適當?shù)念A測信息及非指導性的咨詢應作為NIPT篩查的一部分,其中,預測信息便包括NIPT所發(fā)現(xiàn)的其他染色體異常信息。這也預示著,NIPT即將迎來亞染色體水平檢測新時代。 無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測是一種有效篩查胎兒染色體異常的方法。目前,其他染色體異常的檢測數(shù)據(jù)積累尚不足,其檢測的靈敏度尚未得到大規(guī)模的臨床樣本驗證,因此其結果更需要結合其他臨床信息,進一步診斷。 安諾優(yōu)達旨在為孕婦提供更優(yōu)質(zhì)服務 安諾優(yōu)達作為國家衛(wèi)計委首批高通量測序臨床應用試點單位,是國內(nèi)最早進入NIPT領域的企業(yè)之一,致力于為大眾提供更優(yōu)質(zhì)的生育健康服務。 目前,安諾優(yōu)達已對現(xiàn)有無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測進行全面升級,為臨床醫(yī)生呈現(xiàn)更多的檢測信息,覆蓋更廣的疾病范圍,有效提高臨床對出生缺陷的檢出能力。同時,考慮到傳統(tǒng)核型分析分辨率的局限性,安諾優(yōu)達將為檢測出其他染色體異常的受檢孕婦免費贈送NGS染色體異常檢測(全面覆蓋23對染色體非整倍性異常以及0.1Mb以上的片段缺失或重復突變,同時可檢測低至5%的嵌合體),為孕婦提供雙重保障。 總部位于北京,是中國基因組行業(yè)的知名企業(yè),國家發(fā)改委首批基因檢測技術應用示范中心、國家衛(wèi)計委首批高通量測序臨床應用試點單位、國家高新技術企業(yè)、北京市發(fā)改委“精準醫(yī)療與基因工程北京市工程實驗室”、中關村高新技術企業(yè),擁有博士后科研工作站。 公司專注于新一代基因組學技術在人類醫(yī)學健康和生命科學研究兩大領域的產(chǎn)業(yè)化應用,建立了領先的高通量測序平臺和高性能計算平臺,并先后和美國illumina公司及阿里云達成戰(zhàn)略合作,形成了強大的Bio-IT 基礎和產(chǎn)業(yè)化服務能力。 |
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