2016年3月，ACMG發(fā)表了一篇題為《在不育人群中進(jìn)行擴(kuò)展性攜帶者篩查：臨床決策的頻率如何受到影響？》的文章^[1]。通過對(duì)2011年至2014年在不孕不育中心進(jìn)行擴(kuò)展性攜帶者篩查的所有患者數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，評(píng)估了檢測(cè)結(jié)果為陽性的總體比例以及同時(shí)為同一遺傳病攜帶者的夫婦數(shù)量。

ACMG發(fā)表文章及摘要

結(jié)果顯示，在6643名檢測(cè)個(gè)體中 (3738對(duì)夫婦)，共有1666名個(gè)體為至少一種疾病的攜帶者。這3738對(duì)夫婦中，有8對(duì)夫婦是同一種遺傳病的攜帶者或檢測(cè)結(jié)果顯示他們有生育患兒的風(fēng)險(xiǎn)。8對(duì)夫婦中的3對(duì)均為囊性纖維化攜帶者。即在這3738對(duì)夫婦中，擴(kuò)展性攜帶者篩查影響臨床護(hù)理決策高達(dá)8次。

作者最后得出結(jié)論，在大量的臨床樣本數(shù)據(jù)中，擴(kuò)展性攜帶者篩查影響了不孕不育患者的臨床決策，占0.21%。這項(xiàng)研究ACMG力求在單次、大量的不孕不育人群的臨床實(shí)踐中提供擴(kuò)展性攜帶者篩查影響臨床實(shí)踐決策頻率的數(shù)據(jù)，希望為不孕不育患者和臨床醫(yī)生提供關(guān)于生育風(fēng)險(xiǎn)、選擇接受孕前咨詢和篩查等方面的有價(jià)值的信息。

無獨(dú)有偶，早在2015年9月，華大基因與歐洲最大輔助生殖中心Igenomix，就在《Fertility and Sterility》雜志合作發(fā)表了高通量測(cè)序技術(shù)在輔助生殖領(lǐng)域中進(jìn)行隱性遺傳病攜帶者篩查的臨床應(yīng)用相關(guān)文章^[2]。

華大基因研究成果

這項(xiàng)研究首次用大量臨床樣本證實(shí)擴(kuò)展性攜帶者篩查在輔助生殖中的重要作用：擴(kuò)展性攜帶者篩查可應(yīng)用于準(zhǔn)備用自己的配子進(jìn)行輔助生殖手術(shù)的夫婦；同時(shí)也適用精子和卵子捐獻(xiàn)項(xiàng)目，避免一些嚴(yán)重的單基因病。

細(xì)心的讀者可能發(fā)現(xiàn)2篇文章數(shù)據(jù)上有些差異。ACMG的文章中檢出陽性攜帶率為25.1%，夫婦是同一種遺傳病的攜帶者或檢測(cè)結(jié)果顯示他們有生育患兒的風(fēng)險(xiǎn)比例為0.21%。而華大基因的陽性攜帶率高達(dá)84%，夫婦檢出攜帶有同一遺傳病的致病基因突變的比例約為5%。華大基因的數(shù)據(jù)明顯高于ACMG，這是何故？

其實(shí)2篇文章在檢測(cè)方法、分析疾病位點(diǎn)數(shù)等均有不同。ACMG進(jìn)行的擴(kuò)展性攜帶者篩查樣本，53.8%采用Integrated Genetics公司的117種疾病檢測(cè)， 42.4%來自Counsyl 公司的V1.0，采用基因分型的方法檢測(cè)102種疾病的400+位點(diǎn)，只有少數(shù)3.8%采用Counsyl 公司的V2.0芯片，該芯片采用測(cè)序方法檢測(cè)102種疾病的10000+個(gè)位點(diǎn)。而華大基因的所有樣本均采用測(cè)序同時(shí)補(bǔ)充GAP-PCR、QPCR和片段分析的方法，檢測(cè)626種疾病的8000+位點(diǎn)，致病突變檢出率自然較高。下圖是截取自Counsyl 公司官方微博上關(guān)于其檢測(cè)V1.0和V2.0比較示意圖。不難看出，測(cè)序方法能檢出更多的致病突變。

Sequencing vs. Genotyping: 

Counsyl公司V1.0和V2.0產(chǎn)品對(duì)比示意圖

題圖引自：https://blog./tag/counsyl-2-0/