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      《Nature》子刊最新論文:CRISPR基因編輯技術(shù)導致小鼠體內(nèi)上百種非目標基因突變

       昵稱jKeLdh92 2017-05-31


      近年來,CRISPR技術(shù)被越來越多的人認為是癌癥的“控制中心”,可以用來修復導致失明的基因突變、治療生物的遺傳疾病、甚至通過編輯人類胚胎基因來找出導致不孕和流產(chǎn)的原因。

       

      圖丨蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中編號為5AXW的金黃色葡萄球菌的Cas9蛋白晶狀結(jié)構(gòu)

       

      近日,Nature 子刊 Nature Methods 發(fā)表的一篇文章則表明,基因編輯技術(shù)有可能會在引起基因組內(nèi)數(shù)百種尚不確定的基因突變。

       

      我們一致認為,CRISPR 引起的偏靶突變這一發(fā)現(xiàn)具有非常嚴重的潛在危害,其中包括單核苷酸突變和基因組非編碼區(qū)域的突變。”論文聯(lián)合作者、哥倫比亞大學醫(yī)學中心的 Stephen Tsang 博士說。

       

       

      眾所周知,CRISPR-Cas9 基因編輯技術(shù)憑借其快速和高精確度的特點,被科學家視為了解基因在疾病中作用的重要途徑。與此同時,基因編輯技術(shù)由于可以刪除或修復有缺陷的基因,所以它也為基因治療帶來了新的希望。


      世界上首例將 CRISPR 應用于人體的治療案例目前正在中國進行,而歐美國家也會很快跟上。甚至有專家認為,目前中美在該領(lǐng)域的競爭將日趨白熱化,有點類似當初冷戰(zhàn)時期的美蘇太空競賽,只不過這次的主題換成了生物醫(yī)療。

       

      然而,看似前景無可限量的 CRISPR 技術(shù)卻也遭到了質(zhì)疑。研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了該技術(shù)在用于活體生物時可能產(chǎn)生副作用的證據(jù),而且其導致的非目標基因突變有可能將遠遠超出我們的想象。

        

      圖丨CRISPR-Cas9 基因編輯技術(shù)說明

       

      在之前的研究中,Tsang 博士和他的研究團隊對兩只 CRISPR 基因編輯的小鼠做了全基因組測序,并進行了健康程度比對。他們試圖找到 CRISPR 引起的突變,包括合成 DNA 和 RNA 最基本的單核苷酸分子。

       

      他們發(fā)現(xiàn),CRISPR基因編輯技術(shù)確實成功修復了小鼠體內(nèi)導致失明的基因,但這兩只小鼠體內(nèi)卻出現(xiàn)了超過 1500 個單核苷酸位點變異(SNVs),以及超過 100 個大片段序列插入與缺失(InDels)。

       

      “研究者們經(jīng)常會使用一些計算機算法來預測非目標 DNA 突變,然而小鼠體內(nèi)發(fā)生的這些突變從來沒有被預測到”,Tsang 研究團隊的報告指出。


      圖丨截選自Nature Methods的實驗結(jié)果數(shù)據(jù)對比


      在上面圖表的前兩行,即全基因組測序單核苷酸位點變異(WGS SNVs)與全基因組測序大片段序列插入與缺失(WGS indels),已經(jīng)說明了 CRISPR 基因編輯小鼠體內(nèi)產(chǎn)生的非目標突變。

       

      巴蘇克博士表示:“雖然我們對 CRISPR 依舊保持樂觀,但作為醫(yī)生,我們知道任何一種新的療法都會有潛在的副作用,而對于 CRISPR,我們也必須要找出它的副作用是什么?!?/span>

       


      但與眾多科學實驗一樣,小鼠體內(nèi)發(fā)生的突變不一定意味著人體實驗無法開展,只是現(xiàn)在的當務(wù)之急是要確定這類突變是否會在更大規(guī)模、更復雜的樣本中出現(xiàn),比如人體。

       

      目前,研究人員也在積極改進 CRISPR 系統(tǒng)中基因切割酶和將酶引導到正確基因的 RNA 的部分,以此來提高基因編輯的效率。

       

      Tsang 博士進一步補充道:“我希望,我們的研究結(jié)果可以促使其他人使用全基因組測序來作為判斷他們所研究的 CRISPR 技術(shù)的脫靶效應,進而篩選出最安全、最準確的基因編輯技術(shù)?!?/span>

       

      據(jù)《自然》雜志早些時候的報道,2016 年 10 月 28 日,由腫瘤學家盧鈾教授領(lǐng)導的四川大學的研究團隊在華西醫(yī)院將經(jīng)過基因編輯的細胞注入到了一名參與臨床試驗的肺癌患者體內(nèi)。

       

      中國科學家主導的人體試驗原本計劃于 2016 年 8 月進行,但由于培養(yǎng)被編輯的細胞所需要的時間超出了最初的預期,所以才一直拖到十月底。不過中國在 CRISPR 技術(shù)上的應用上的步伐已經(jīng)遠遠走在了美國前面。


      圖丨四川大學華西醫(yī)院腫瘤學家盧鈾教授


      美國的首次 CRISPR 人體試驗目前還處于計劃階段。雖然在 2016 年初,美國的研究人員就已經(jīng)獲準進行此項試驗,并且獲得了科技大亨肖恩·帕克(Sean Parker)的投資,但估計一直要等到 2017 年晚些時候,這項試驗才會在賓夕法尼亞大學進行。


      圖丨賓夕法尼亞大學腫瘤細胞免疫療法專家 Carl June


      正如賓夕法尼亞大學腫瘤細胞免疫療法專家、美國首例CRISPR人體實驗科學顧問Carl June所說:“我認為在生物醫(yī)學領(lǐng)域上將爆發(fā)一場新的‘美蘇太空競賽’,不過這次的競爭雙方將是中國和美國。不過競爭也是很重要的,因為它通常有助于提高最終技術(shù)的可靠性。


      參考資料:

      https://www./turns-out-crispr-gene-editing-can-cause-hundreds-of-unexpected-mutations

      https:///pub_releases/2017-05/cumc-cge052617.php

      https:///news/2017-05-crispr-gene-hundreds-unintended-mutations.html

      https:///news/2017-04-accurate-dna-method.html


      -End-


       


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