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      IBM

       泥盆紀(jì)的魚石螈 2017-08-24

      “基因地理工程”是通過分析大量現(xiàn)代人的 DNA 樣本而重建人類遷移歷史的里程碑工程。該工程于 2005年 4月啟動,由 IBM 與國家地理學(xué)會共同創(chuàng)建了一個由我們共同遺傳資源組成的綜合知識庫,這種獨(dú)特資源將持續(xù)增強(qiáng)我們對人類歷史的了解。

      “基因地理工程”:包含我們的歷史

      在我們每個人身體內(nèi)部,DNA 都攜帶著從 60,000 年前出現(xiàn)在非洲的最早人類祖先中遺傳而來的記錄。由于微小的變異傳給了以后的各代人,人類從共同祖先開始的遷移歷史可以從活體 DNA 中發(fā)現(xiàn)的“血統(tǒng)標(biāo)記”而重建—如果可以從全球范圍內(nèi)收集到足夠的樣本量,而且有用于分析這些樣本的技術(shù)。

      項(xiàng)目主管 Spencer Wells 博士說:“有史以來最偉大的歷史書是我們的 DNA 中隱藏的記錄?!?/p>

      作為“基因地理工程”的主要協(xié)作者,IBM 提供了全公司的專業(yè)資源,包括計(jì)算生物中心,并提供了先進(jìn)的技術(shù),用于建立并分析第一個全球基因圖譜和變異數(shù)據(jù)庫。IBM 新成立的技術(shù)小組與項(xiàng)目組合作,共同開發(fā)了用于記錄現(xiàn)場收集到的樣本的軟件。IBM 基金會為 IBM 在該項(xiàng)目中的工作提供資金。

      Ajay Royyuru 博士是位于紐約州約克高地的 Thomas J. Watson 研究中心內(nèi) IBM 計(jì)算生物中心的高級經(jīng)理。他負(fù)責(zé)領(lǐng)導(dǎo) IBM 參與的這個項(xiàng)目,包括分析海量基因數(shù)據(jù)的新方法。他說:“我們不僅在這些數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)讓人震驚的血統(tǒng)圖譜,而且 IBM 研究小組正在開發(fā)全新的 DNA 分析方法,為獲得以前根本無法實(shí)現(xiàn)的洞察力打開了大門?!?/p>

      國家地理學(xué)會負(fù)責(zé) DNA 的采集。這一工作由全球的 11 個地區(qū)中心協(xié)調(diào),其中每個中心由當(dāng)?shù)氐囊晃谎芯繂T負(fù)責(zé)管理。這項(xiàng)工程向現(xiàn)場的小組征求樣本,并特別注重與當(dāng)?shù)厝说暮献?。由于現(xiàn)代社會使更廣的遷移和更大范圍的基因標(biāo)記組合成為可能,可能幫助追溯人類起源的獨(dú)特 DNA 庫會隨著每一代人而逐步減小。因此,在每個地區(qū)居住的社區(qū)對于確定過去一千年中產(chǎn)生的基因差異至關(guān)重要。

      “基因地理工程”最初預(yù)訂的期限為五年,但現(xiàn)在已經(jīng)運(yùn)作多年,并在 2011年之后還將繼續(xù)分析工作—而且其獨(dú)特的數(shù)據(jù)庫將提供給研究人員使用,并在多年來作為進(jìn)一步研究的資源。盡管人類遷移的整體歷程已經(jīng)明確,但“基因地理工程”正在添加細(xì)節(jié),以加深我們對祖先走出非洲的長途跋涉過程的了解。例如,有些基因標(biāo)記指出,最早的人類可能已經(jīng)分為單獨(dú)的人群,并在幾千年后再次聚居在一起。在中東地區(qū)發(fā)現(xiàn)的歐洲 DNA 簽名的痕跡可追溯到 11 至 13世紀(jì)之間的十字軍東征期間。

      除了最初征求的 100,000 名參與者之外,“基因地理工程”還向公眾開放。超過 395,000 人通過購買工具包而加入到這個工程中,他們分別提交了一份 DNA 樣本以供分析,用于發(fā)現(xiàn)他們自己的基因血統(tǒng),而且結(jié)果以在線方式匿名發(fā)布。這個工程鼓勵公眾參與者允許他們的結(jié)果以自愿和匿名方式加入到全球數(shù)據(jù)庫中。

      這些人包括 Ajay Royyuru 以及其他 14,500 名 IBM 員工。他說,他的結(jié)果“提醒我思考并再次肯定了我堅(jiān)信的事實(shí),也就是我們現(xiàn)在看到的所有多樣化人群—包括語言、階級、宗教等—在歷史進(jìn)程中是最近才出現(xiàn)的,而且與各自顯現(xiàn)的明顯差異相比,這個地球上的人具有更密切的相互關(guān)聯(lián)。”

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