▎藥明康德/報道

每年全世界有超過1400萬患者被診斷患上癌癥，其中大多數(shù)患者在確診時腫瘤已經(jīng)處于晚期或已經(jīng)擴散。這時無論是手術(shù)還是藥物治療的效果都不佳。如果可以提早診斷，就有望提高癌癥生存率。

基于分析血液循環(huán)細(xì)胞DNA(cell-free DNA，cfDNA)的液體活檢(liquid biopsy)正在逐漸成為新一代癌癥的診斷方法。該技術(shù)的原理是癌癥患者的cfDNA中含有腫瘤細(xì)胞釋放的循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA, ctDNA)。與高通量測序技術(shù)(NGS)和先進算法相結(jié)合，研究人員已經(jīng)能夠通過ctDNA檢測確定腫瘤中的基因變異。但是這一手段目前大多被用于分析晚期癌癥患者的腫瘤。早期腫瘤釋放到血液中的ctDNA片段數(shù)目非常稀少，對液體活檢技術(shù)的應(yīng)用產(chǎn)生限制。

▲循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）是腫瘤細(xì)胞釋放到血液中的DNA片段，有可能反應(yīng)整個腫瘤基因組，因此具有臨床應(yīng)用潛力。(圖片來源：維基百科)

近期，約翰霍普金斯大學(xué)(Johns Hopkins University)醫(yī)學(xué)院的研究人員開發(fā)出一種稱為靶向錯誤矯正測序(targeted error correction sequencing, TEC-Seq) 的超級敏感的ctDNA檢測方法，有望解決癌癥無創(chuàng)早期檢測的難題。這項研究發(fā)表在近期的《Science Translational Medicine》雜志上。

TEC-seq 是基于腫瘤組織的檢測原理開發(fā)出的ctDNA的檢測方法。它對結(jié)直腸癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌等癌癥類型中最常出現(xiàn)58種致癌基因進行深度測序和分析。這58個基因片段總長只有80930個堿基對，但是測序深度達到30000X。除了深度測序以外，研究人員還對測序流程做出了一系列改進來提高檢測的靈敏度。其中包括：優(yōu)化測序庫的生成和靶向片段的捕捉，通過加入少量外源條形碼(barcode)最大化獨特ctDNA在測序庫中的呈現(xiàn)可能，以及在后期分析時過濾掉測序錯誤和其它原因?qū)е禄蜃儺悺?/span>