達爾文在1859年發(fā)表的“物種起源”一書中表達了生物進化論的主要理論“用進廢退、物競天擇、適者生存”，是對生命起源和發(fā)展的一種假說。這一理論是對當(dāng)時流行的神學(xué)論主張的“人是上帝創(chuàng)造的”的批判。有趣的是，在1828年～1831年達爾文在英國劍橋大學(xué)攻讀神學(xué)，正是他的神學(xué)老師推薦他參加一次航海旅行，他在船上種植植物，發(fā)現(xiàn)了植物的趨光性，也就是向著陽光生長的奧秘，這使他對自然環(huán)境對生物的影響產(chǎn)生了濃厚的興趣。

生物進化論中一個重要的內(nèi)容是進化，也就是現(xiàn)有的物種是從別的物種進化來的，一個物種可以變成新的物種，也就是比如靈長類，人、猩猩、猴子都有一個共同的祖先，我們都是從某一個共同的物種進化來的。而這個共同的祖先已經(jīng)不存在，因為他們已經(jīng)進化成了人等其他物種。生物進化論的另一個內(nèi)容是進化的動力是自然選擇，是自然迫使物種不斷進化。

這個理論其實非常籠統(tǒng)和寬泛，如果非要說漏洞，一個漏洞是達爾文當(dāng)時沒有把物種之間的相互影響，也就是物種的共生和寄生考慮進去，達爾文的進化論更多的是側(cè)重自然力迫使物種向某一方向進化，也就是進化是有方向性的，是自然環(huán)境確定了進化的方向。但有這樣一種可能，那就是進化是偶然或者突發(fā)事件導(dǎo)致的，是兩個或多個物種碰撞融合產(chǎn)生了新物種，不一定是有方向的，是突然發(fā)生的。

有科學(xué)證據(jù)表明某些物種進化的源動力來自于兩種以上物種的共生，比如人和病毒。達爾文想不到這一點很正常，因為在達爾文時代人們還不知道有病毒這么個物種，也不知道人類的胎盤形成是因為人類祖先感染了一個逆轉(zhuǎn)錄病毒造成的。我在以往的回答“病毒有沒有可能與生物構(gòu)成共生關(guān)系？”中有闡述，我們?nèi)祟惢蛑械?%都是病毒片段，如果在歷史上的某一個時間，我們的祖先沒有感染病毒，病毒沒有整合到人類的卵細胞中并一代一代遺傳下來，也就不會有人類的存在了。

研究發(fā)現(xiàn)這些病毒片段在黑猩猩和猴子身上也存在，但人類的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒和大猩猩的更加接近，所以可能是不同的病毒感染了我們的祖先，整合到基因組的不同位置導(dǎo)致了進化的不同方向。所以進化不一定是有特定方向的，也不一定是一個物種定向的進化成某一新物種，而可能是一些突發(fā)事件，以及兩種以上物種的共生和融合產(chǎn)生了新的物種。

圖片展示了各種不同的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒（ERV）是如何通過感染可能導(dǎo)致了靈長類的進化。

(https://www./viro/research/retroviral-persistence-in-humans/human-endogenous-retroviruses/research-topics/index.html)