熱心腸報名 2019中國腸道大會正式報名入口 小程序

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2018年，全球腸道領(lǐng)域的研究又取得了突飛猛進(jìn)的進(jìn)展。我們通過“熱心腸日報”又解讀了2800多篇高水平的腸道研究論文。

這其中，影響因子超過15分的就有接近700篇，來自Cell、Nature、Science的文章有近150篇，來自JAMA、NEJM、Lancet的文章有近100篇。

這絕對是腸道科學(xué)研究的大豐收！

我們向所有取得突破的科學(xué)家表示祝賀，并堅信在2019年我們依然能夠看到腸道科學(xué)領(lǐng)域的持續(xù)高產(chǎn)。

廣告：我們特別歡迎你在2019年蒞臨中國腸道大會，共慶腸道科學(xué)的巨大成就，共謀中國腸道產(chǎn)業(yè)的發(fā)展大計：

今天，我們特別發(fā)出四個榜單，分別介紹2018中國腸道研究十大成果、全球腸道研究十大人物、最受關(guān)注的50篇腸道綜述和100篇腸道論文。

我們充分利用了“熱心腸日報”的后臺數(shù)據(jù)，對2800多篇文章進(jìn)行了多維度的加權(quán)評分，在充分考慮雜志影響力、閱讀數(shù)、轉(zhuǎn)發(fā)和討論數(shù)等客觀數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上，也請熱心腸日報的主編和幾位編輯進(jìn)行了充分討論，并最終形成了榜單。

本榜單僅代表熱心腸生物技術(shù)研究院基于自身數(shù)據(jù)所做的優(yōu)選，存在主觀因素影響客觀性的可能，僅供參考。歡迎你在文末留言提出批評、建議和意見。

本篇發(fā)布“最受關(guān)注的100篇腸道論文”。

趙立平+彭永德+張晨虹等：膳食纖維治療2型糖尿病，多虧關(guān)鍵腸道菌

Science[IF:41.058]

① 2型糖尿病患者隨機分成兩組，均用阿卡波糖治療，U組（16例）為常規(guī)治療組，W組（27例）接受同等熱量的高膳食纖維營養(yǎng)干預(yù)；② 相比U組，W組的糖化血紅蛋白等指標(biāo)改善得更快更好，該臨床效果可經(jīng)糞菌移植在小鼠中重現(xiàn)；③ 治療過程中患者腸道菌群結(jié)構(gòu)改變，高膳食纖維富集了由15株乙酸和丁酸產(chǎn)生菌組成的功能群，抑制了吲哚和硫化氫產(chǎn)生菌；④ 這組菌尤其增加丁酸生成，促進(jìn)GLP-1和PYY分泌改善血糖，其豐度和多樣性與臨床治療效果顯著相關(guān)。

Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type 2 diabetes
03-09, doi: 10.1126/science.aao5774 

Nature：對菌群的影響，環(huán)境大于宿主基因！

Nature[IF:41.577]

① 腸道菌群沒有顯著的家族遺傳傾向，宿主的遺傳背景對腸道菌群結(jié)構(gòu)影響甚微；② 居住在一起但沒有親緣關(guān)系的人群，擁有高度相似的腸道基因結(jié)構(gòu)；③ 飲食、藥物和生活方式相關(guān)因素影響了>20%的人群個體間菌群差異；④ 相較于只考慮人體遺傳背景的計算模型，將菌群數(shù)據(jù)納入統(tǒng)計指標(biāo)可以顯著提高對體質(zhì)狀況的預(yù)測精確性，如預(yù)測血糖和肥胖癥等；⑤ 通過改變菌群來改善治療效果的方法有望在人群中推廣，而不用考慮宿主的遺傳背景。

Environment dominates over host genetics in shaping human gut microbiota
02-28, doi: 10.1038/nature25973 

Cell：可溶性膳食纖維+壞菌群，可引發(fā)小鼠肝癌！

Cell[IF:31.398]

① 長期吃富含可溶纖維的飼料（ICD），可使腸道菌群失調(diào)的T5KO等免疫缺陷小鼠發(fā)生膽汁淤積、肝臟炎癥和黃疸型肝癌（HCC），而不可溶纖維無此作用；② ICD誘導(dǎo)的HCC依賴于腸道菌群，可通過菌群轉(zhuǎn)移令野生型小鼠發(fā)??；③ 長期吃富含菊粉的高脂飼料，可使野生型小鼠發(fā)生菌群失調(diào)和HCC，增加T5KO小鼠HCC發(fā)病率，伴隨腸道中纖維發(fā)酵菌和變形菌門增多；④ 抑制腸內(nèi)發(fā)酵生成SCFA、削減發(fā)酵細(xì)菌、不吃可溶纖維，或抑制膽汁酸再吸收，可預(yù)防上述HCC。

Dysregulated Microbial Fermentation of Soluble Fiber Induces Cholestatic Liver Cancer
10-18, doi: 10.1016/j.cell.2018.09.004 

Cell：抗生素治療后，益生菌干預(yù)不利于菌群復(fù)原

Cell[IF:31.398]

① 在小鼠和健康受試者中，分析混合益生菌干預(yù)和自體糞菌移植（aFMT）如何影響抗生素擾動后的腸道菌群和腸轉(zhuǎn)錄組恢復(fù)；② 抗生素顯著促進(jìn)了人益生菌在人體腸粘膜的定殖，但該作用在小鼠中較輕；③ 與無干預(yù)的自發(fā)性恢復(fù)相比，益生菌明顯推遲了宿主的糞便和腸粘膜菌群的重建及宿主轉(zhuǎn)錄組的恢復(fù)，且使其難以完全復(fù)原；④ 而aFMT可使菌群和人體腸轉(zhuǎn)錄組在幾天內(nèi)近乎完全復(fù)原；⑤ 體外實驗中，益生菌誘導(dǎo)的菌群抑制作用與乳桿菌屬分泌的可溶因子有關(guān)。

Post-Antibiotic Gut Mucosal Microbiome Reconstitution Is Impaired by Probiotics and Improved by Autologous FMT
09-06, doi: 10.1016/j.cell.2018.08.047 

Lancet：2800萬人數(shù)據(jù)，滴酒不沾最健康

Lancet[IF:53.254]

① 2800萬人數(shù)據(jù)顯示，飲酒造成2016年全球2.2%女性和6.8%男性死亡，是第7大致死/殘/病風(fēng)險因素；② 15-49歲人群中，飲酒是主要風(fēng)險因素，造成3.8%的女性和12.2%的男性死亡，相關(guān)死亡原因主要是結(jié)核病、交通事故和自我傷害，50歲以上人群中，癌癥是飲酒相關(guān)死亡的主要原因；③ 適度飲酒（<10克酒精 ）與缺血性心臟病、糖尿病和缺血性中風(fēng)風(fēng)險降低相關(guān)，但后二者未達(dá)統(tǒng)計學(xué)顯著；④="" 全因死亡和癌癥風(fēng)險與飲酒量正相關(guān)；⑤="">

Alcohol use and burden for 195 countries and territories, 1990–2016: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2016
08-23, doi: 10.1016/S0140-6736(18)31310-2 

Science：高血糖惡化腸道感染

Science[IF:41.058]

① 肥胖不是腸道屏障紊亂的必要條件，高血糖更可能是引起腸道屏障損傷、加重腸道感染的元兇；② 小鼠實驗中，葡萄糖和雙向葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白GLUT2直接參與高血糖對表皮細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄重編程，改變細(xì)胞間緊密連接和粘著連接的完整性，增加了腸道屏障通透性；③ 高血糖引起的腸道屏障損傷導(dǎo)致微生物產(chǎn)物進(jìn)入體內(nèi)，促進(jìn)病原菌增殖及病灶轉(zhuǎn)移，惡化腸道感染狀況；④ 人體數(shù)據(jù)顯示，進(jìn)入體內(nèi)的微生物產(chǎn)物含量與血糖水平相關(guān)，與體重指標(biāo)、代謝疾病等無關(guān)。

Hyperglycemia drives intestinal barrier dysfunction and risk for enteric infection
03-08, doi: 10.1126/science.aar3318 

Nature: 非抗生素藥物同樣影響腸道細(xì)菌

Nature[IF:41.577]

① 比對1079種市售藥物對代表性腸道共生細(xì)菌的影響，發(fā)現(xiàn)24%以人體為靶位的藥物對腸道細(xì)菌有抑制作用；② 抗精神病藥物的抗菌作用尤為典型，指示這類藥物對腸道共生菌的影響可能是一種藥物機理；③ 人靶標(biāo)藥物影響共生菌，造成的副作用與抗生素的抑菌效果類似，這一結(jié)果與現(xiàn)有人群薈萃分析結(jié)果一致；④ 人靶標(biāo)藥物與抗生素效果的一致性，指示共生細(xì)菌中存在廣譜的藥物耐受機制；⑤ 非抗生素類藥物對腸道菌耐藥性的影響，值得深入研究。

Extensive impact of non-antibiotic drugs on human gut bacteria
03-19, doi: 10.1038/nature25979 

Nature子刊：住院病人發(fā)生血液感染，腸道可能是源頭

Nature Medicine[IF:32.621]

① 開發(fā)一款生物信息學(xué)工具StrainSifter，可在菌株水平將血流感染（BSI）致病菌與潛在感染源進(jìn)行精準(zhǔn)匹配，用該方法比對30例造血細(xì)胞移植患者的BSI致病菌和糞便菌群；② 由大腸桿菌和肺炎克雷伯氏菌引起的BSI，可在患者感染前的腸道菌群中鑒定出一致的菌株，提示其感染源可能是腸道；③ 部分由典型非腸道致病菌引起的BSI，患者的腸道菌群中也可鑒定出一致的菌株；④ 這些發(fā)現(xiàn)對“環(huán)境或皮膚接觸是住院患者BSI感染源”的認(rèn)知提出挑戰(zhàn)。

Precision identification of diverse bloodstream pathogens in the gut microbiome
10-15, doi: 10.1038/s41591-018-0202-8 

Cell子刊：低碳水飲食迅速改變菌群改善脂肪肝

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 短期低碳水飲食（LCD）干預(yù)為肥胖的非酒精性脂肪肝患者帶來多種代謝益處，用多組學(xué)法分析；② LCD顯著減少脂肪生成、增強β-氧化（血清β-羥基丁酸濃度大幅上升），使肝臟脂肪含量急劇下降；③ LCD誘導(dǎo)腸道菌群快速轉(zhuǎn)變，25個菌屬豐度顯著變化，產(chǎn)葉酸的鏈球菌屬和乳球菌屬迅速增多，伴隨著血清葉酸水平上升，或與脂代謝、氧化應(yīng)激和炎癥的改善相關(guān)；④ 肝臟中基因表達(dá)改變，脂肪酸合成通路下調(diào)、葉酸介導(dǎo)的碳代謝和脂肪酸氧化通路上調(diào)。

An Integrated Understanding of the Rapid Metabolic Benefits of a Carbohydrate-Restricted Diet on Hepatic Steatosis in Humans
02-07, doi: 10.1016/j.cmet.2018.01.005 

Lancet：13萬人數(shù)據(jù)，多吃乳制品與死亡率降低相關(guān)

Lancet[IF:53.254]

① 一項納入21個國家（包括發(fā)達(dá)國家和中國在內(nèi)的發(fā)展中國家）13.6萬人的大型隊列研究，中位隨訪時間9.1年，分析牛奶、酸奶、奶酪和黃油等乳制品的攝入與死亡率和心血管疾病的關(guān)聯(lián)；② 與不吃乳制品相比，每天攝入>2份乳制品，則總死亡率下降17%、非心血管死亡率下降14%、心血管死亡率下降23%、主要心血管疾病風(fēng)險下降22%、中風(fēng)風(fēng)險下降34%，攝入全脂乳制品則風(fēng)險進(jìn)一步下降；③ 每天攝入>1份牛奶和酸奶也與死亡率和心血管疾病風(fēng)險降低相關(guān)。

Association of dairy intake with cardiovascular disease and mortality in 21 countries from five continents (PURE): a prospective cohort study
09-11, doi: 10.1016/S0140-6736(18)31812-9 

NEJM：特定的鼠李糖+瑞士乳桿菌，無助于兒童胃腸炎治療

New England Journal of Medicine[IF:79.258]

① 在加拿大6個急診科，886名3-48月大兒童在確診胃腸炎后，連續(xù)5天(2次/天)攝入4X10^9 cfu 的鼠李糖乳桿菌R0011(95%)和瑞士乳桿菌R0052(5%)二聯(lián)制劑或安慰劑；② 入組14天內(nèi)，試驗組和安慰劑組中仍發(fā)生中重度胃腸炎的兒童占比分別為26.1%(108/414)和24.7%(102/413)；③ 兩組之間的腹瀉(52.5h vs 55.5h)和嘔吐(17.7h vs 18.7h)中位持續(xù)時間、計劃外到醫(yī)療機構(gòu)就醫(yī)的比例(30.2% vs 26.6%)、報告不良反應(yīng)的比例(34.8% vs 38.7%)均無顯著差異。

Multicenter Trial of a Combination Probiotic for Children with Gastroenteritis
11-22, doi: 10.1056/NEJMoa1802597 

Nature：精準(zhǔn)消滅腸道特定細(xì)菌，改善結(jié)腸炎！

Nature[IF:41.577]

這是首次報道精準(zhǔn)編輯特定細(xì)菌可改善腸道炎癥：① 在腸道炎癥性疾病中，往往伴隨著率屬于變形菌門腸桿菌科的兼性厭氧菌過度滋生；② 腸桿菌科的細(xì)菌存在一些很特別的鉬輔助因子依賴性呼吸通路，這些通路只在炎癥發(fā)作期間活躍；③ 而在此期間使用鎢酸鹽能選擇性抑制這些通路，從而阻止腸桿菌科細(xì)菌的擴張；④ 而在正常穩(wěn)態(tài)下，鎢酸鹽只會對腸道菌群的結(jié)構(gòu)產(chǎn)生微小改變；⑤ 在結(jié)腸炎小鼠模型中，鎢酸鹽介導(dǎo)的菌群編輯降低了腸道炎癥的嚴(yán)重程度。

Precision editing of the gut microbiota ameliorates colitis
01-03, doi: 10.1038/nature25172 

Nature：芽孢桿菌益生菌清除致病菌的機制

Nature[IF:41.577]

① 分析泰國農(nóng)村的200個健康個體，發(fā)現(xiàn)腸內(nèi)存在芽孢桿菌（主要是枯草芽孢桿菌）的人，腸道和鼻腔中沒有金黃色葡萄球菌定殖；② 小鼠實驗表明，金黃色葡萄球菌需要Agr群體感應(yīng)系統(tǒng)來實現(xiàn)腸道定殖，芽孢桿菌產(chǎn)生的脂肽芬薺素，與Agr群體感應(yīng)中的關(guān)鍵因子AIP有相似結(jié)構(gòu)，可干擾Agr信號轉(zhuǎn)導(dǎo)，從而抑制Agr群體感應(yīng)；③ 給小鼠灌胃枯草芽孢桿菌孢子，可完全消除金黃色葡萄球菌的腸道定殖，而不產(chǎn)生芬薺素的枯草芽孢桿菌無此作用。

Pathogen elimination by probiotic Bacillus via signalling interference
10-10, doi: 10.1038/s41586-018-0616-y 

Science：腸道菌群的傳遞模式

Science[IF:41.058]

① 將來自兩個地區(qū)的野生小鼠，在同一動物房內(nèi)進(jìn)行近交繁殖，對衍生出的17個近交小鼠品系的腸道菌群（5-11代）進(jìn)行追蹤分析；② 腸道菌群的傳遞方式以垂直傳遞為主，個體的菌群組成與其相應(yīng)的野生小鼠祖先更相似；③ 但也存在菌群的水平傳遞，致使不同品系小鼠的腸道菌群組成隨時間趨同；④ 不同腸道菌有不同的傳遞模式，與細(xì)菌的種系發(fā)生和氧耐受情況相關(guān)，大部分菌屬傾向于垂直傳遞；⑤ 傾向于水平傳遞的菌屬多為與感染和住院相關(guān)的致病菌。

Transmission modes of the mammalian gut microbiota
10-26, doi: 10.1126/science.aat7164 

北大姜長濤等：二甲雙胍調(diào)節(jié)菌群-膽汁酸-腸道FXR軸，改善代謝紊亂

Nature Medicine[IF:32.621]

① 2型糖尿病患者經(jīng)二甲雙胍治療后，腸道菌群改變，脆弱擬桿菌顯著減少，腸道中的甘氨熊去氧膽酸（GUDCA）和牛磺熊去氧膽酸（TUDCA）水平上升；② GUDCA和TUDCA是法尼酯X受體（FXR）拮抗劑，二甲雙胍通過抑制脆弱擬桿菌生長、降低該菌的膽鹽水解酶活性，使GUDCA水平升高，以不依賴于腸道AMPK的方式，抑制腸道FXR信號，發(fā)揮改善代謝的作用；③ 高脂喂養(yǎng)的肥胖小鼠口服GUDCA，可抑制腸道FXR信號，并使血液GLP-1上升，改善血糖穩(wěn)態(tài)。

Gut microbiota and intestinal FXR mediate the clinical benefits of metformin
11-05, doi: 10.1038/s41591-018-0222-4 

NEJM：LGG無助于兒童急性胃腸炎治療

New England Journal of Medicine[IF:79.258]

① 在美國10個急診科，943名3-48月大的兒童在確診急性胃腸炎后，連續(xù)5天(2次/天)攝入10^10 cfu 的鼠李糖乳桿菌GG株(LGG)或安慰劑；② 入組14天內(nèi)，試驗組和安慰劑組中Vesikari評分仍≥9(中重度胃腸炎)的兒童分別占11.8%(55/468)和12.6%(60/475)；③ 兩組之間的腹瀉(49.7h vs 50.9h)和嘔吐(均為0h)中位持續(xù)時間、日托缺勤中位天數(shù)(均為2天)、家庭傳染發(fā)生率(10.6% vs 14.1%)均無顯著差異；④ 5日療程的LGG并未帶來對急性胃腸炎治療的額外獲益。

Lactobacillus rhamnosus GG versus Placebo for Acute Gastroenteritis in Children
11-22, doi: 10.1056/NEJMoa1802598 

60萬人數(shù)據(jù)：喝酒越多，預(yù)期壽命越短，心血管病風(fēng)險越高

Lancet[IF:53.254]

① 納入來自19個高收入國家的83項前瞻性研究（包含近60萬飲酒者），分析飲酒與全因死亡率及心血管疾病的關(guān)聯(lián)；② 飲酒量與全因死亡率呈曲線正相關(guān)，最小死亡風(fēng)險對應(yīng)的酒精消耗量為每周100克或以下；③ 飲酒量與高風(fēng)險中風(fēng)、冠心?。ǔ诵募」Ｈ⑿牧λソ?、致命的高血壓疾病、致命的主動脈瘤之間接近線性相關(guān)；④ 飲酒量與低風(fēng)險的心肌梗塞呈對數(shù)線性相關(guān)；⑤ 對比酒精消耗量在0-100克/每周的飲酒者，酒精消耗量越多，40歲時的預(yù)期壽命越低。

Risk thresholds for alcohol consumption: combined analysis of individual-participant data for 599?912 current drinkers in 83 prospective studies
04-14, doi: 10.1016/S0140-6736(18)30134-X 

Cell：未來趨勢——個性化益生菌干預(yù)

Cell[IF:31.398]

① 小鼠和人體中，消化道菌群存在梯度變化，粘膜和腔內(nèi)的菌群存在差異，均不同于糞便菌群；② 益生菌通過消化道后在糞便中仍保持活性，但在小鼠腸粘膜的定殖受原有菌群的定殖抵抗；③ 益生菌在人腸粘膜的定殖情況，有明顯的個體、部位和菌株特異性，可將個體分為“易定殖”和“抗定殖”兩類，并可對粘膜菌群組成/功能和人腸道基因表達(dá)產(chǎn)生短暫而不同的影響；④ 干預(yù)前的宿主和菌群特征，而非干預(yù)期間糞便菌群變化，可預(yù)測益生菌的腸粘膜定殖。

Personalized Gut Mucosal Colonization Resistance to Empiric Probiotics Is Associated with Unique Host and Microbiome Features
09-06, doi: 10.1016/j.cell.2018.08.041 

Science：患者腸道菌群構(gòu)成，顯著影響抗PD-1療法的效果！

Science[IF:41.058]

① 用16S測序、宏基因組測序、定量PCR的綜合方法，分析了42名轉(zhuǎn)移性黑色素瘤患者的糞菌構(gòu)成；② 患者的菌群構(gòu)成和抗PD-1免疫療法的效果之間存在顯著關(guān)聯(lián)，在對療法響應(yīng)較好的患者菌群中，鑒定出長雙歧桿菌、產(chǎn)氣柯林斯菌和屎腸球菌等豐度較高；③ 給無菌小鼠移植這些患者的糞菌，可明顯改善腫瘤控制、增強T細(xì)胞應(yīng)答，獲得更好的抗PD-1療效；④ 菌群構(gòu)成可影響癌癥患者的抗腫瘤免疫，也可作為預(yù)測患者能否響應(yīng)免疫檢查點阻斷療法的生物標(biāo)志物。

The commensal microbiome is associated with anti–PD-1 efficacy in metastatic melanoma patients
01-05, doi: 10.1126/science.aao3290 

Nature：海藻糖大幅增加艱難梭菌變異株的毒力

Nature[IF:41.577]

① 海藻糖與艱難梭菌的轉(zhuǎn)錄抑制因子TreR結(jié)合，抑制蛋白質(zhì)TreA（可將海藻糖代謝為葡萄糖）的基因treA的表達(dá)；② RT027株攜帶單核苷酸遺傳變異，TreR中的一個氨基酸從亮氨酸變成異亮氨酸；③ 海藻糖與TreR的結(jié)合力因此改變，treA大量表達(dá)，RT027利用海藻糖的能力增加500倍以上；④ 通過小鼠研究，發(fā)現(xiàn)海藻糖讓RT027株的毒力大幅增加；⑤ RT078株則通過4個基因組成的基因簇（包括將海藻糖轉(zhuǎn)運到胞內(nèi)的一種滲透酶基因），獲得代謝低濃度海藻糖的能力。

Dietary trehalose enhances virulence of epidemic Clostridium difficile
01-03, doi: 10.1038/nature25178 

周宏偉+馬文軍等：菌群診斷模型不能忽視區(qū)域性

Nature Medicine[IF:32.621]

① 在廣東省內(nèi)隨機選取14個地區(qū)84個社區(qū)，分析7009個受試者的糞便菌群；② 菌群差異與受試者的所在地區(qū)關(guān)聯(lián)最強，遠(yuǎn)超年齡、BMI、血壓等指標(biāo)；③ 菌群診斷模型受區(qū)域化限制，作為參考的健康菌群特征也具有明顯的區(qū)域性，基于一個地區(qū)數(shù)據(jù)得出的代謝疾病診斷模型，在該區(qū)域內(nèi)準(zhǔn)確性較高，但用于另一個地區(qū)時準(zhǔn)確性大幅降低；④ 菌群診斷模型在不同地理尺度上的普適性，在不同代謝疾病間存在差異；⑤ 用菌群模型預(yù)測疾病風(fēng)險時，須注意區(qū)域普適性。

Regional variation limits applications of healthy gut microbiome reference ranges and disease models
08-27, doi: 10.1038/s41591-018-0164-x 

Nature：嬰幼兒腸道菌群發(fā)育的3個階段

Nature[IF:41.577]

① 分析903名兒童3-46月齡的糞便菌群組成，可分為10個聚類；② 早期腸道菌群發(fā)育包括3個階段：發(fā)育期（3-14月）、過渡期（15-30月）和穩(wěn)定期（≥31月），菌群組成和功能與多種因素相關(guān)；③ 母乳喂養(yǎng)對發(fā)育期菌群的影響最大，與雙歧桿菌（尤其是兩歧和短雙歧桿菌）豐度較高相關(guān)，終止母乳導(dǎo)致以厚壁菌門增多為特征的菌群成熟；④ 擬桿菌屬豐度在順產(chǎn)嬰兒中較高，與菌群多樣性較高和成熟較快相關(guān)；⑤ 地理位置和家庭環(huán)境等也是影響菌群的重要因素。

Temporal development of the gut microbiome in early childhood from the TEDDY study
10-01, doi: 10.1038/s41586-018-0617-x 

Science：腸道菌群代謝膽汁酸，影響肝癌免疫監(jiān)視

Science[IF:41.058]

① 抗生素處理小鼠可誘導(dǎo)CXCR6+ NKT細(xì)胞在肝臟募集、增強其生成干擾素-γ的能力，抑制肝臟腫瘤；② 肝竇內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)趨化因子CXCL16（CXCR6配體）調(diào)控NKT細(xì)胞的積累，腸道菌群介導(dǎo)初級膽汁酸向次級膽汁酸的轉(zhuǎn)化，可影響這一過程：初級膽汁酸增加CXCL16表達(dá)，而次級膽汁酸作用相反；③ 給抗生素處理的小鼠喂食次級膽汁酸或定殖代謝膽汁酸的梭菌屬細(xì)菌，可逆轉(zhuǎn)肝臟NKT細(xì)胞積累和抗腫瘤效果；④ 肝癌患者中也存在膽汁酸與CXCL16表達(dá)水平間的關(guān)聯(lián)。

Gut microbiome–mediated bile acid metabolism regulates liver cancer via NKT cells
05-25, doi: 10.1126/science.aan5931 

Lancet：中國人應(yīng)注意減少鈉攝入

Lancet[IF:53.254]

① 納入18個國家、369個社區(qū)的95767人進(jìn)行血壓分析，跟蹤隨訪（中位數(shù)8.1年）255個社區(qū)的82544人進(jìn)行心血管疾病分析；② 中國80%的社區(qū)平均鈉攝入量超過5g/天，而其它國家中84%的社區(qū)平均鈉攝入量為3-5g/天；③ 平均鈉攝入量每上升1g，平均收縮壓上升2.86mm Hg，兩者之間的顯著關(guān)聯(lián)僅存在于鈉攝入量最高的群體中；④ 相比于其它國家，鈉攝入量與中風(fēng)之間在中國受試者中存在顯著關(guān)聯(lián)；⑤ 所有主要心血管事件隨著鉀攝入量的增加而減少。

Urinary sodium excretion, blood pressure, cardiovascular disease, and mortality: a community-level prospective epidemiological cohort study
08-11, doi: 10.1016/S0140-6736(18)31376-X 

Nature：改造菌株+配套營養(yǎng)支持=可精細(xì)調(diào)控的菌株定殖

Nature[IF:41.577]

① 向擬桿菌株中轉(zhuǎn)化可利用紫菜聚糖的罕見基因位點，使之能利用紫菜聚糖作為碳源；② 通過喂食紫菜聚糖，在小鼠腸道中形成一種獨有的代謝生態(tài)位，以供這種改造的外源菌株獨享，使該菌株可以在含有不同腸道菌群的小鼠中成功植入；③ 調(diào)節(jié)紫菜聚糖的喂食劑量，可精細(xì)調(diào)控該菌株在小鼠腸道內(nèi)的豐度，且該效果可逆；④ 這種靶向的膳食營養(yǎng)支持，足以使改造的外源菌株與已在小鼠結(jié)腸隱窩內(nèi)定殖的同基因型菌株競爭，并取代后者。

An exclusive metabolic niche enables strain engraftment in the gut microbiota
05-09, doi: 10.1038/s41586-018-0092-4 

Science：宿主分泌的IgA可促進(jìn)腸道細(xì)菌定殖

Science[IF:41.058]

① 腸道共生菌脆弱擬桿菌可在結(jié)腸上皮粘膜成群聚集，附著于上皮細(xì)胞頂部的多糖包被，該現(xiàn)象需要細(xì)菌的CCF系統(tǒng)參與；② CCF可感應(yīng)源于宿主的特定聚糖，并調(diào)節(jié)細(xì)菌表面特定的莢膜多糖的轉(zhuǎn)錄，以促進(jìn)與宿主的免疫球蛋白A（IgA）結(jié)合；③ 脆弱擬桿菌可激活宿主的適應(yīng)性免疫，誘導(dǎo)分泌IgA，對其在腸道粘膜的穩(wěn)定定殖和聚集、與其它細(xì)菌競爭生態(tài)位而言，是必須的；④ IgA既可幫助清除病原體保護(hù)腸道屏障，也有助于某些細(xì)菌在腸道黏膜定殖。

Gut microbiota utilize immunoglobulin A for mucosal colonization
05-18, doi: 10.1126/science.aaq0926 

Nature：腸道菌群的色氨酸代謝物參與大腦炎癥調(diào)控

Nature[IF:41.577]

① 在多發(fā)性硬化（MS）小鼠模型（EAE）中，小神經(jīng)膠質(zhì)生成TGFα和VEGF-B調(diào)控星形膠質(zhì)細(xì)胞；② TGFα經(jīng)星形膠質(zhì)細(xì)胞的ErbB1受體，抑制其病理活性和EAE進(jìn)展，而VEGF-B可激活星形膠質(zhì)細(xì)胞的FLT-1信號并惡化EAE；③ 人體中VEGF-B和TGFα參與了小神經(jīng)膠質(zhì)對星形膠質(zhì)細(xì)胞的調(diào)控，CD14+細(xì)胞中TGFα和VEGF-B的表達(dá)水平與MS病變階段相關(guān)；④ 飲食色氨酸經(jīng)腸道共生菌群代謝，其衍生物經(jīng)芳香烴受體參與小神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞對星形膠質(zhì)細(xì)胞的調(diào)控、抑制CNS炎癥。

Microglial control of astrocytes in response to microbial metabolites
05-16, doi: 10.1038/s41586-018-0119-x 

Science：腸道致病共生菌的易位可觸發(fā)自身免疫病

Science[IF:41.058]

① 在單一定殖鶉雞腸球菌（一種腸道致病共生菌）的小鼠及自身免疫易感小鼠模型中，鶉雞腸球菌易位至肝臟及其它組織中，誘導(dǎo)自身抗體產(chǎn)生并造成小鼠死亡；② 抗生素處理可抑制組織中鶉雞腸球菌的生長、清除致病性自身抗體及T細(xì)胞，降低小鼠的死亡率；③ 從自身免疫病患者的肝臟組織中獲得鶉雞腸球菌的特定DNA，制成靶向疫苗并進(jìn)行肌肉注射，可抑制小鼠的死亡；④ 小鼠及人的肝細(xì)胞與鶉雞腸球菌共同培養(yǎng)，可誘導(dǎo)自身免疫促進(jìn)因子的產(chǎn)生。

Translocation of a gut pathobiont drives autoimmunity in mice and humans
03-09, doi: 10.1126/science.aar7201 

Nature子刊：腸道菌群靶向藥，有望防治心血管疾病

Nature Medicine[IF:32.621]

① 一些腸道菌能將飲食膽堿等物質(zhì)轉(zhuǎn)化成三甲胺（TMA），再被肝臟代謝為氧化三甲胺（TMAO），可增加動脈粥樣硬化風(fēng)險；② 針對細(xì)菌產(chǎn)生TMA的關(guān)鍵酶CutC/D，開發(fā)了兩種不影響共生菌的生存能力，卻能使CutC/D永久失活的強效抑制劑；③ 小鼠口服后，這種抑制劑選擇性的在腸道共生菌中積累，可幾乎完全抑制高膽堿食物造成的TMA和TMAO生成，減少血小板聚集和血栓形成；④ 并逆轉(zhuǎn)高膽堿食物誘導(dǎo)的菌群變化，增加Akk菌；⑤ 未觀察到明顯毒副作用。

Development of a gut microbe–targeted nonlethal therapeutic to inhibit thrombosis potential
08-06, doi: 10.1038/s41591-018-0128-1 

JAMA：糖尿病人每周2天大幅少吃，控血糖效果媲美長期控?zé)崃?/strong>

JAMA[IF:44.405]

① 納入137名2型糖尿病患者，隨機分為2組，分別進(jìn)行間斷性及持續(xù)性能量限制；② 間斷性限制組每周在不連續(xù)的2天只攝入500-600kcal能量（其他時間每天攝入約2100 kcal正常飲食），持續(xù)性限制組每天攝入1200-1500kcal能量，持續(xù)1年；③ 兩組的平均HbA1c水平及體重均表現(xiàn)出相似的下降，前者達(dá)到等效標(biāo)準(zhǔn)；④ 在試驗結(jié)束后，兩組之間的空腹血糖水平、脂質(zhì)水平、總服藥量均無顯著差異；⑤ 兩組之間在治療前兩周中出現(xiàn)的低血糖或高血糖事件無顯著差異。

Effect of Intermittent Compared With Continuous Energy Restricted Diet on Glycemic Control in Patients With Type 2 DiabetesA Randomized Noninferiority Trial
07-20, doi: 10.1001/jamanetworkopen.2018.0756 

賴信志等：冬蟲夏草多糖的益生機制

Gut[IF:17.016]

① 口服中國被毛孢（冬蟲夏草菌的無性階段）菌絲及從中分離的高分子量多糖組分（H1），顯著改善高脂飲食（HFD）喂養(yǎng)小鼠的肥胖和代謝紊亂；② H1改善腸道菌群和腸道完整性，減少代謝內(nèi)毒素、炎癥、胰島素抵抗和血脂異常；③ 與肥胖負(fù)相關(guān)的新霉素敏感菌介導(dǎo)H1的抗肥胖作用，包括H1選擇性促進(jìn)的古氏副擬桿菌，給HFD小鼠口服該菌減少了小鼠的體重增長和代謝紊亂；④ H1和古氏副擬桿菌或是治療肥胖和2型糖尿病的新型益生元/菌。

Gut commensal Parabacteroides goldsteinii plays a predominant role in the anti-obesity effects of polysaccharides isolated from Hirsutella sinensis
07-14, doi: 10.1136/gutjnl-2017-315458 

Nature子刊：96株腸道菌的體外培養(yǎng)和代謝分析

Nature Microbiology[IF:14.174]

① 選擇有代表性的96株腸道菌（常見人體腸道共生菌、益生菌、致病菌等），分析在19種培養(yǎng)基中的生長特性；② 76個菌株能在至少一種成分確定的培養(yǎng)基中生長，使得準(zhǔn)確評估這些細(xì)菌的生物合成能力成為可能，mGAM和M4培養(yǎng)基或許最適合培養(yǎng)腸道菌；③ 不同菌株的生物合成能力和種系發(fā)生未必匹配，即分類學(xué)上接近的細(xì)菌，對培養(yǎng)基的偏好可存在很大差異，反之亦然；④ 氨基酸和短鏈脂肪酸可抑制多種腸道菌，鑒定出多個降解/利用粘蛋白的菌種。

Nutritional preferences of human gut bacteria reveal their metabolic idiosyncrasies
03-19, doi: 10.1038/s41564-018-0123-9 

Science：在家族性息肉病人腸道里，有兩種細(xì)菌促癌！

Science[IF:41.058]

① 對家族性腺瘤性息肉?。‵AP）患者的結(jié)腸黏膜進(jìn)行活組織檢查，發(fā)現(xiàn)存在pks+大腸桿菌和腸毒性脆弱擬桿菌（ETBF）組成的細(xì)菌生物被膜，及兩種菌產(chǎn)生的促腫瘤毒素的共表達(dá)；② 在小鼠模型中，相較于定殖單一菌株，pks+大腸桿菌和ETBF共同定殖可顯著增加腫瘤數(shù)量和死亡率；③ ETBF可降解粘液層，增加粘附于結(jié)腸粘膜的pks+大腸桿菌，后者釋放colibactin導(dǎo)致結(jié)腸上皮細(xì)胞發(fā)生DNA損傷；④ 兩種菌共定殖可誘導(dǎo)結(jié)腸IL-17顯著上升，加劇結(jié)腸腫瘤惡化。

Patients with familial adenomatous polyposis harbor colonic biofilms containing tumorigenic bacteria
02-02, doi: 10.1126/science.aah3648 

Nature：腸道細(xì)菌調(diào)節(jié)果蠅運動行為

Nature[IF:41.577]

① 無菌或抗生素處理，導(dǎo)致果蠅運動行為過度活化，比有菌果蠅走得更多更快；② 給無菌果蠅單一定植共生菌短乳桿菌，可使上述行為異?；謴?fù)正常，短乳桿菌表達(dá)的木糖異構(gòu)酶起關(guān)鍵介導(dǎo)作用；③ 木糖異構(gòu)酶可調(diào)節(jié)果蠅糖代謝，降低海藻糖水平，從而降低生成神經(jīng)遞質(zhì)章魚胺（相當(dāng)于去甲腎上腺素）的神經(jīng)元活性，進(jìn)而調(diào)節(jié)果蠅運動行為；④ 激活該神經(jīng)元或補充章魚胺，可消除木糖異構(gòu)酶對果蠅行為的調(diào)節(jié)作用。

A gut microbial factor modulates locomotor behaviour in Drosophila
10-24, doi: 10.1038/s41586-018-0634-9 

Nature：Treg如何調(diào)節(jié)對致病共生菌的免疫耐受

Nature[IF:41.577]

① 將肝螺桿菌定殖于小鼠腸道中，可在野生型小鼠中促進(jìn)對其特異的RORγt+FOXP3+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞（iTreg）分化，而在IL-10缺陷小鼠中主要誘導(dǎo)促結(jié)腸炎的輔助T細(xì)胞17（TH17）；② Treg中轉(zhuǎn)錄因子c-MAF失活可損害iTreg的分化和功能（如IL-10的生成），導(dǎo)致肝螺桿菌特異的炎性TH17積聚，促發(fā)結(jié)腸炎；③ 腸道菌群誘導(dǎo)的T細(xì)胞中，iTreg可約束炎性TH17，使宿主對致病共生菌建立免疫耐受，減少結(jié)腸炎，c-MAF對調(diào)控腸道內(nèi)iTreg-TH17的平衡不可或缺。

c-MAF-dependent regulatory T cells mediate immunological tolerance to a gut pathobiont
02-07, doi: 10.1038/nature25500 

Cell：與糖尿病相關(guān)的菌群代謝物，損傷胰島素信號

Cell[IF:31.398]

① 丙酸咪唑（ImP）是腸道菌群產(chǎn)生的組氨酸衍生代謝物，在2型糖尿?。═2D）患者血液中的含量較高；② 在體外模擬發(fā)酵實驗中， T2D患者糞菌發(fā)酵產(chǎn)生的ImP濃度更高；③ 鑒定出能生成ImP的42個菌株，其中67%的豐度在T2D患者中較高；④ 注射ImP可降低小鼠胰島素受體（IRS）水平及其磷酸化水平，導(dǎo)致糖耐受損傷；⑤ ImP通過激活p38γ促進(jìn)p62磷酸化，使mTORC1活化，影響IRS，導(dǎo)致胰島素信號受損，T2D患者肝臟中p62和mTORC1活化水平上升。

Microbially Produced Imidazole Propionate Impairs Insulin Signaling through mTORC1
10-25, doi: 10.1016/j.cell.2018.09.055 

Nature：利用超聲波實時監(jiān)控細(xì)菌在腸道的分布

Nature[IF:41.577]

① 在細(xì)菌中表達(dá)'聲學(xué)響應(yīng)基因'，它編碼的氣囊中空結(jié)構(gòu)組件能散射聲波并產(chǎn)生超聲波可探測到的回聲；② 壓力脈沖可讓氣囊破裂，超聲波信號就此消失，這可在追蹤含氣囊的細(xì)胞的位置時改善信號監(jiān)測質(zhì)量；③ 研究者構(gòu)建了兩種不同類型的氣囊，它們在不同的壓力脈沖水平下破裂，這使得通過超聲波可以區(qū)分出攜帶這兩種氣囊的細(xì)胞；④ 將表達(dá)不同氣囊的細(xì)菌菌株植入小鼠，可實現(xiàn)對它們的非侵入性體內(nèi)時空監(jiān)測，可了解它們在小腸或結(jié)腸的實時動態(tài)分布。

Acoustic reporter genes for noninvasive imaging of microorganisms in mammalian hosts
01-03, doi: 10.1038/nature25021 

Nature：小腸細(xì)菌移位可在遺傳易感個體中誘發(fā)白血病

Nature[IF:41.577]

① TET2缺陷可造成部分個體發(fā)生白血病前期骨髓增生（PMP）；② 造血細(xì)胞特異敲除Tet2的小鼠中，存在小腸屏障功能障礙，小腸細(xì)菌（如某些乳桿菌）移位，促炎性IL-6增多；③ Tet2-/-小鼠特定髓系祖細(xì)胞高表達(dá)IL-6受體，被IL-6激活而大量擴增，促進(jìn)PMP發(fā)病；④ 無癥狀的Tet2-/-小鼠中，誘導(dǎo)腸道屏障損傷或系統(tǒng)性微生物信號（如TLR2激動劑），均可促發(fā)PMP；⑤ 抗生素可逆轉(zhuǎn)PMP、無菌Tet2-/-小鼠不會發(fā)病，說明微生物信號在PMP疾病進(jìn)展中的重要性。

Microbial signals drive pre-leukaemic myeloproliferation in a Tet2-deficient host
05-16, doi: 10.1038/s41586-018-0125-z 

Science：腸內(nèi)分泌細(xì)胞與迷走神經(jīng)形成突觸，直接向大腦匯報

Science[IF:41.058]

① 小鼠的部分腸內(nèi)分泌細(xì)胞表達(dá)突觸相關(guān)黏附蛋白，可與迷走神經(jīng)節(jié)神經(jīng)元形成突觸，該神經(jīng)上皮回路僅通過一個突觸，將小腸/結(jié)腸的腸腔與腦干相連；② 腸內(nèi)分泌細(xì)胞合成谷氨酸作為神經(jīng)遞質(zhì)，可將感應(yīng)到的糖信號以毫秒級速度傳遞至迷走神經(jīng)元，而這些細(xì)胞釋放的激素膽囊收縮素作用于迷走神經(jīng)的速度則慢得多；③ 將這些形成突觸的腸內(nèi)分泌細(xì)胞命名為neuropod細(xì)胞，這些細(xì)胞通過突觸信號，可將食物/營養(yǎng)等信息迅速告知大腦。

A gut-brain neural circuit for nutrient sensory transduction
09-21, doi: 10.1126/science.aat5236 

JAMA：超重成年人飲食減肥，低脂還是低碳水？

JAMA[IF:44.405]

① 對609名超重志愿者隨機進(jìn)行低脂或低碳水化合物飲食干預(yù)，為期12個月，共481人完成研究；② 低脂（HLF）和低碳水化合物（HLC）飲食的平均宏量營養(yǎng)素分布為：碳水化合物48% vs 30% 、脂肪29% vs 45% 、蛋白質(zhì) 21% vs 23% ；③ 12個月后，HLF和HLC組體重分別減少5.3kg和6.0kg，效果類似；④ 基因型和胰島素分泌的個體差異不影響膳食的干預(yù)作用，表明無法作為個性化膳食的指導(dǎo)依據(jù)；⑤ 出現(xiàn)18種不良或嚴(yán)重不良事件，平均分布在兩個干預(yù)組。

Effect of Low-Fat vs Low-Carbohydrate Diet on 12-Month Weight Loss in Overweight Adults and the Association With Genotype Pattern or Insulin Secretion: The DIETFITS Randomized Clinical Trial
02-20, doi: 10.1001/jama.2018.0245 

Nature：幼年期先天免疫對菌群塑造的長期影響

Nature[IF:41.577]

① 腸上皮細(xì)胞表達(dá)的先天免疫受體中，鞭毛蛋白受體——Toll樣受體5（TLR5）在小鼠出生頭2周內(nèi)高度表達(dá)，之后迅速降低，提示TLR5在這一時期可能有重要作用；② TLR5與其銜接蛋白MYD88以及下游的抗細(xì)菌c型外源凝集素REG3γ，可選擇性的抑制鞭毛細(xì)菌在新生小鼠腸道內(nèi)定殖，促進(jìn)非鞭毛細(xì)菌定殖；③ 新生兒期是TLR5塑造小鼠腸道菌群的關(guān)鍵時期，TLR5的早期高表達(dá)對菌群組成的影響持續(xù)至成年后；④ 生命早期因素塑造腸道菌群，對菌群組成有長期作用。

Neonatal selection by Toll-like receptor 5 influences long-term gut microbiota composition
08-08, doi: 10.1038/s41586-018-0395-5 

Nature：斷奶前后，不同淋巴細(xì)胞接力塑造腸道菌群

Nature[IF:41.577]

① 分節(jié)絲狀菌等腸道共生菌通過IL-22和IL-23誘導(dǎo)3型天然淋巴細(xì)胞（ILC3）和腸上皮細(xì)胞（IEC）中STAT3磷酸化（pSTAT3）；② 隨著斷奶期腸道共生菌迅速增殖，適應(yīng)性免疫的CD4+T細(xì)胞發(fā)育成熟，這種短暫的早期pSTAT3特征隨即消失、ILC3活性被抑制，與菌群的非炎性共生得以建立；③ 天然淋巴細(xì)胞和適應(yīng)性淋巴細(xì)胞通過不同方式控制腸道菌群增殖；④ 缺少適應(yīng)性免疫時，ILC3持續(xù)活化并分泌IL-22，使小腸上皮細(xì)胞脂質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白表達(dá)減少，脂代謝受損。

Innate and adaptive lymphocytes sequentially shape the gut microbiota and lipid metabolism
01-22, doi: 10.1038/nature25437 

趙方慶等：孕期健康可塑造新生兒的初始菌群

Gut[IF:17.016]

① 分析486名孕婦和新生兒出生時多個身體部位的樣本（口腔、咽喉、腸道等）；② 新生兒樣本中有豐富的細(xì)菌類群，不同部位菌群各有特征，提示新生兒的菌群定植應(yīng)發(fā)生在出生前；③ 患妊娠期糖尿?。℅DM）的孕婦及其新生兒的菌群明顯改變，二者間存在一致的變化趨勢，不同部位的菌群結(jié)構(gòu)差異降低，某些細(xì)菌與口服糖耐量試驗結(jié)果強相關(guān)；④ GDM新生兒胎便的菌群均勻度降低、代謝功能通路減少、某些病毒豐度上升；⑤ GDM改變孕婦及新生兒出生時的菌群。

Dysbiosis of maternal and neonatal microbiota associated with gestational diabetes mellitus
05-14, doi: 10.1136/gutjnl-2018-315988 

Gut：LGG保護(hù)小腸上皮減輕放療損傷的機制

Gut[IF:17.016]

① 鼠李糖乳桿菌GG（LGG）釋放脂磷壁酸（LTA），后者激活小腸隱窩周圍的巨噬細(xì)胞的TLR2通路，誘導(dǎo)趨化因子CXCL12的表達(dá)；② 固有層中COX-2+ 間充質(zhì)干細(xì)胞（MSC）表達(dá)CXCR4，可結(jié)合CXCL12，從而激活這些MSC向腸隱窩上皮干細(xì)胞附近遷移；③ 這些MSC釋放的PGE2可保護(hù)上皮干細(xì)胞，減少輻射誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡；④ LGG誘導(dǎo)的MSC預(yù)遷移，使輻射損傷的修復(fù)得以迅速開啟；⑤ 接受腹部放療的小鼠中，LGG保護(hù)正常腸隱窩，但對移植的腫瘤組織無保護(hù)效果。

Lactobacillus rhamnosus GG protects the intestinal epithelium from radiation injury through release of lipoteichoic acid, macrophage activation and the migration of mesenchymal stem cells
06-22, doi: 10.1136/gutjnl-2018-316226 

Nature：生酮飲食或有助于抗癌

Nature[IF:41.577]

① PIK3CA突變和PTEN功能缺失突變常見于人類癌癥，PIK3CA編碼酶p110α；② 靶向抑制p110α?xí)茐亩喾N組織中的葡萄糖代謝，導(dǎo)致短暫的高血糖癥，引發(fā)全身性葡萄糖-胰島素反饋；③ PI3K抑制劑導(dǎo)致的葡萄糖-胰島素反饋足以激活腫瘤中的PI3K-mTOR信號通路；④ 通過飲食或藥物的方法可防止這種葡萄糖-胰島素反饋，顯著提高PI3K抑制劑的抗癌功效、減小毒性；⑤ 這一發(fā)現(xiàn)有助于提高研發(fā)中的p110α抑制劑的藥物療效，對治療多種癌癥類型均具有啟示作用。

Suppression of insulin feedback enhances the efficacy of PI3K inhibitors
07-04, doi: 10.1038/s41586-018-0343-4 

Cell子刊：小腸保護(hù)肝臟少受果糖“荼毒”

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 使用同位素示蹤和質(zhì)譜，在小鼠體內(nèi)對果糖中的碳原子進(jìn)行追蹤，發(fā)現(xiàn)飲食中的果糖主要是在小腸中代謝，需要己酮糖激酶參與；② 攝入低劑量果糖時，約90%可被腸道清除，轉(zhuǎn)化為葡萄糖以及乳酸等有機酸；③ 高劑量果糖可使小腸的代謝能力飽和，小腸無法清除的果糖被肝臟和腸道菌群代謝；④ 果糖攝入可快速誘導(dǎo)腸道中與果糖吸收和代謝相關(guān)的基因表達(dá)，通過喂食強化，可提高小腸對果糖的代謝能力；⑤ 小腸或可保護(hù)肝臟，減少果糖對肝臟的毒性。

The Small Intestine Converts Dietary Fructose into Glucose and Organic Acids
02-06, doi: 10.1016/j.cmet.2017.12.016 

Nature：早發(fā)1型糖尿病的早期菌群特征

Nature[IF:41.577]

① 納入783名有1型糖尿?。═1D）遺傳風(fēng)險的白人兒童，分析糞便宏基因組的縱向變化，并進(jìn)行巢式病例對照分析；② 對照兒童菌群中，與細(xì)菌發(fā)酵和短鏈脂肪酸生物合成相關(guān)的基因含量更高，但未鑒定出具有普遍性的與胰島自身免疫或 T1D顯著相關(guān)的菌群成員；③ 嬰兒腸道菌群發(fā)育呈現(xiàn)動態(tài)變化和個體差異，出生第一年內(nèi)以雙歧桿菌屬（兩歧/短/長雙歧桿菌）或變形菌門為優(yōu)勢菌；④ 含有利用人乳寡糖基因的長雙歧桿菌菌株，特異存在于母乳喂養(yǎng)嬰兒中。

The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study
10-24, doi: 10.1038/s41586-018-0620-2 

Nature子刊：免疫檢查點抑制劑相關(guān)結(jié)腸炎可用糞菌移植治療

Nature Medicine[IF:32.621]

① 使用免疫檢查點抑制劑（ICI）進(jìn)行癌癥治療后發(fā)生難治性ICI相關(guān)結(jié)腸炎的兩位患者，接受來自同一健康供體的糞菌移植（FMT），分別在1次和2次FMT后達(dá)到癥狀的完全緩解；② FMT后，患者結(jié)腸粘膜處的T細(xì)胞組成發(fā)生改變（CD8+細(xì)胞毒性T細(xì)胞明顯減少，而CD4+FoxP3+T細(xì)胞增多/保留），可能是FMT療效的潛在機制；③ 患者的腸道菌群在FMT后很快變得與供體類似，之后與供體的相似度減少，但仍不同于FMT之前的菌群；④ 需擴大樣本驗證該方法的有效性。

Fecal microbiota transplantation for refractory immune checkpoint inhibitor-associated colitis
11-12, doi: 10.1038/s41591-018-0238-9 

Nature：琥珀酸讓脂肪產(chǎn)熱，或能幫助減肥

Nature[IF:41.577]

① 琥珀酸是三羧酸循環(huán)的中間產(chǎn)物，暴露于寒冷環(huán)境可激活脂肪產(chǎn)熱，其代謝特征是琥珀酸的積累；② 琥珀酸積累獨立于腎上腺素信號，足以提升褐色脂肪的生熱呼吸；③ 給小鼠靜脈注射琥珀酸，可快速激活褐色脂肪產(chǎn)熱，該作用需要琥珀酸脫氫酶，通過琥珀酸氧化啟動活性氧生成，從而驅(qū)動生熱呼吸；④ 通過飲水給食用高脂飲食的小鼠補充琥珀酸，可增加系統(tǒng)循環(huán)中的琥珀酸，驅(qū)動依賴于UCP1的褐色脂肪產(chǎn)熱，從而使小鼠抵抗飲食誘導(dǎo)的肥胖和血糖問題。

Accumulation of succinate controls activation of adipose tissue thermogenesis
07-18, doi: 10.1038/s41586-018-0353-2 

Nature子刊：色氨酸代謝平衡影響腸道菌群介導(dǎo)的代謝健康

Nature Medicine[IF:32.621]

① 高脂飲食顯著增加小鼠腸道的吲哚胺2,3-加雙氧酶（IDO）活性，促進(jìn)色氨酸分解代謝為犬尿氨酸，限制了腸道菌群的吲哚-3-乙酸等色氨酸代謝產(chǎn)物生成；② 敲除編碼IDO的基因Ido1或用藥物抑制IDO活性，可改善高脂飲食喂養(yǎng)小鼠的胰島素敏感性、腸粘膜屏障、內(nèi)毒素和慢性炎癥、肝臟和脂肪組織的脂代謝；③ 上述益處與腸道菌群變化和IL-22水平上升有關(guān)，用抗體中和IL-22可消除敲除Ido1的益處；④ 肥胖和糖尿病患者中也存在同樣的色氨酸代謝變化。

Genetic deficiency of indoleamine 2,3-dioxygenase promotes gut microbiota-mediated metabolic health
06-25, doi: 10.1038/s41591-018-0060-4 

南方醫(yī)科大學(xué)：過量對乙酰氨基酚引發(fā)肝損傷，菌群可能是關(guān)鍵

Journal of Hepatology[IF:14.911]

① 對乙酰氨基酚（APAP）可引起急性肝損傷，并表現(xiàn)出晝夜變化；② 雄性小鼠每日分別在活動期（ZT12）及休息期（ZT0）結(jié)束時服用兩次APAP，分為2組，其中1組抗生素處理；③ APAP在ZT12時期造成的肝損傷顯著高于ZT0時期，抗生素可減少APAP在ZT12時造成的肝損傷；④ 接受ZT12時期糞便移植的小鼠相對于接受ZT0時期糞便移植的小鼠，肝損傷更為嚴(yán)重；⑤ ZT12及ZT0時期的盲腸菌群及腸道菌群代謝產(chǎn)物均有顯著差異，1-苯基-1,2-丙二酮在ZT12時期更高。

Gut microbiota mediates diurnal variation of acetaminophen induced acute liver injury in mice
03-07, doi: 10.1016/j.jhep.2018.02.024 

Science：細(xì)菌-微電子設(shè)備用于監(jiān)測腸道健康

Science[IF:41.058]

① 可植入消化道的生物微電子設(shè)備（IMBED）,整合了可感知環(huán)境物質(zhì)并產(chǎn)生熒光的細(xì)菌和有熒光讀取功能的微電子設(shè)備，可到達(dá)常規(guī)設(shè)備難以進(jìn)入的區(qū)域進(jìn)行可逆性的物質(zhì)監(jiān)測，并通過無線通信將結(jié)果傳至外部設(shè)備；② 在胃腸道出血模型中，具有血紅素感應(yīng)通路的工程益生菌作為IMBED感受器，該IMBED被植入豬胃部后，可在2小時內(nèi)準(zhǔn)確判斷出食用的緩沖溶液中是否含有血液；③ 感應(yīng)系統(tǒng)可替換，硫代硫酸鹽或AHL感應(yīng)系統(tǒng)有望用于檢測腸道炎癥或菌群變化。

An ingestible bacterial-electronic system to monitor gastrointestinal health
05-25, doi: 10.1126/science.aas9315 

晏向華等：糞菌移植鑒定出可預(yù)防仔豬腹瀉的潛在益生菌

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 斷奶前通過口服移植CM仔豬（抗腹瀉）的糞菌，可顯著減少LY仔豬（易腹瀉）的早斷奶應(yīng)激誘導(dǎo)的腹瀉；② 糞菌移植后，5種細(xì)菌在受體LY仔豬中增多，其中加氏乳桿菌LA39和谷物乳桿菌有抗腹瀉作用，是潛在的預(yù)防動物腹瀉的抗生素替代物；③ 其抗腹瀉作用依賴于細(xì)菌分泌的環(huán)肽乳酸菌素A，該細(xì)菌素與腸上皮細(xì)胞表面的角蛋白19結(jié)合，經(jīng)mTOR增加磷酸二酯酶活性，以降低第二信使cAMP和cGMP的水平，從而增強腸道的液體吸收并減少分泌。

A Microbiota-Derived Bacteriocin Targets the Host to Confer Diarrhea Resistance in Early-Weaned Piglets
12-12, doi: 10.1016/j.chom.2018.11.006 

Nature：用類器官研究大腸癌的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性

Nature[IF:41.577]

① 從3名結(jié)直腸癌患者腫瘤不同部位及正常腸隱窩組織提取細(xì)胞，培養(yǎng)獲得多個單細(xì)胞衍生的3D類器官；② 對這些類器官進(jìn)行DNA測序，表明結(jié)直腸癌細(xì)胞有廣泛的突變多樣性，突變率遠(yuǎn)高于正常結(jié)直腸細(xì)胞；③ 根據(jù)每個類器官的突變情況構(gòu)建系譜樹，同一腫瘤不同部位細(xì)胞衍生的類器官呈現(xiàn)明顯異質(zhì)性；④ 大部分突變是在癌細(xì)胞后續(xù)大量擴增時出現(xiàn)的，但常見的癌癥驅(qū)動突變應(yīng)產(chǎn)生于腫瘤生長早期；⑤ 腫瘤內(nèi)多樣化還體現(xiàn)在DNA甲基化、轉(zhuǎn)錄組和藥物反應(yīng)上。

Intra-tumour diversification in colorectal cancer at the single-cell level
04-11, doi: 10.1038/s41586-018-0024-3 

Nature：口服甘露糖有望改善癌癥治療

Nature[IF:41.577]

① 甘露糖可抑制多種腫瘤生長、增強化療藥物效果，腫瘤小鼠口服甘露糖也有同樣效果，且不影響小鼠體重和健康；② 甘露糖被癌細(xì)胞攝取后，以甘露糖-6-磷酸的形式積累，影響糖酵解、三羧酸循環(huán)、磷酸戊糖途徑和聚糖合成，損害葡萄糖代謝；③ 甘露糖與化療藥物聯(lián)合使用，可降低抗細(xì)胞凋亡的Bcl-2家族的蛋白水平，從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞死亡；④ 腫瘤細(xì)胞對甘露糖的敏感性與磷酸甘露糖異構(gòu)酶（PMI）水平負(fù)相關(guān)，PMI可作為對甘露糖敏感性的標(biāo)志物。

Mannose impairs tumour growth and enhances chemotherapy
11-21, doi: 10.1038/s41586-018-0729-3 

Science：明確鑒定出調(diào)節(jié)腸道真菌以抑制炎癥的吞噬細(xì)胞

Science[IF:41.058]

① 鑒定出CX3CR1+單核吞噬細(xì)胞（MNP），在針對腸道真菌的先天性及適應(yīng)性免疫反應(yīng)的起始中是必需的；② CX3CR1+ MNP表達(dá)抗真菌受體，其介導(dǎo)的抗真菌反應(yīng)的激活需要Syk的參與；③ 缺失CX3CR1+ MNP的小鼠，腸道真菌群落改變，并可能發(fā)生嚴(yán)重結(jié)腸炎，抗真菌治療可緩解癥狀；④ 在克羅恩病患者中，發(fā)現(xiàn)CX3CR1基因中存在一種錯義突變，與抗真菌免疫反應(yīng)的受損相關(guān)；⑤ 研究揭示了腸道真菌與腸道疾病的關(guān)聯(lián)，并為克羅恩病治療提供了新思路。

CX3CR1+ mononuclear phagocytes control immunity to intestinal fungi
01-12, doi: 10.1126/science.aao1503 

Science：C1orf106變異增加IBD風(fēng)險的機制

Science[IF:41.058]

① C1orf106的多態(tài)性與炎癥性腸病（IBD）的風(fēng)險增加相關(guān)；② C1orf106通過調(diào)控cytohesin-1的降解來調(diào)節(jié)黏著連接的穩(wěn)定性，cytohesin-1是一種控制ARF6活化的鳥嘌呤核苷酸交換因子；③ 通過限制cytohesin-1依賴性的ARF6活化，C1orf106可穩(wěn)定黏著連接；④ 敲除C1orf106可導(dǎo)致小鼠腸道上皮細(xì)胞屏障缺陷，這與在IBD患者中觀察到的對腸道病原體易感性增加的表型一致；⑤ IBD風(fēng)險相關(guān)的C1orf106基因變異加速C1orf106的降解并縮短其半衰期，引發(fā)功能障礙。

C1orf106 is a colitis risk gene that regulates stability of epithelial adherens junctions
02-01, doi: 10.1126/science.aan0814 

Cell：源于飲食和腸道菌群的一類物質(zhì)可誘導(dǎo)腸道炎癥

Cell[IF:31.398]

① 鑒定出一類含惡唑化合物（OxC），源于工業(yè)、飲食和腸道共生菌等微生物；② OxC可削弱腸上皮細(xì)胞（IEC）中CD1d的脂質(zhì)抗原呈遞功能，減少IL-10生成，促進(jìn)iNKT介導(dǎo)的結(jié)腸炎癥；③ IEC中，OxC可使吲哚胺2,3-雙加氧酶（IDO1）表達(dá)上調(diào)并增強其活性，將色氨酸轉(zhuǎn)化為犬尿酸和黃尿酸等色氨酸衍生物，使芳香烴受體（AhR）活化，從而抑制CD1d介導(dǎo)的IL-10生成；④ 源于飲食和微生物等的OxC，通過活化IEC中的AhR，觸發(fā)CD1d依賴性的腸道炎癥反應(yīng)。

Dietary and Microbial Oxazoles Induce Intestinal Inflammation by Modulating Aryl Hydrocarbon Receptor Responses
05-17, doi: 10.1016/j.cell.2018.04.037 

Nature：腸道干細(xì)胞需要來自特絡(luò)細(xì)胞的Wnt信號

Nature[IF:41.577]

① 鑒定出腸上皮下的FOXL1+特絡(luò)細(xì)胞（TC）是Wnt蛋白的重要來源，支持腸道干細(xì)胞增殖和上皮更新；② TC是大而罕見的間充質(zhì)細(xì)胞，腸TC表達(dá)PDGFRɑ，胞體延伸形成上皮下叢，支撐從胃到結(jié)腸的全部上皮；③ 這些細(xì)胞高表達(dá)Wnt、SHH、Bmp、TGF-β等關(guān)鍵通路的多種調(diào)節(jié)因子，根據(jù)其在隱窩-絨毛軸中所處的位置來區(qū)分轉(zhuǎn)錄，促進(jìn)局部增殖；④ 抑制小鼠FOXL1+ TC的Wnt分泌，快速阻斷向腸隱窩傳導(dǎo)的Wnt信號，導(dǎo)致腸道干細(xì)胞等無法增殖，腸上皮更新受損。

Subepithelial telocytes are an important source of Wnts that supports intestinal crypts
05-02, doi: 10.1038/s41586-018-0084-4 

Cell：生酮飲食抗癲癇，需要特定腸道菌

Cell[IF:31.398]

① 兩種小鼠模型表明，腸道菌群介導(dǎo)了生酮飲食（KD）的抗癲癇作用；② KD富集特定腸道菌，共定殖其中的Akk菌和糞副擬桿菌，使抗生素處理和無菌小鼠中KD的抗癲癇效果恢復(fù)；③ 移植KD小鼠糞菌或補充這兩種菌，可提高普通飲食小鼠的抗癲癇能力；④ 其抗癲癇作用與結(jié)腸、血清和海馬內(nèi)的代謝譜變化相關(guān)：全身γ-谷氨酰氨基酸減少、海馬內(nèi)GABA/谷氨酸比值升高；⑤ 兩種菌互相促進(jìn)生長，降低了菌群的γ-谷氨酰轉(zhuǎn)肽酶活性，抑制γ-谷氨?；兄诳拱d癇。

The Gut Microbiota Mediates the Anti-Seizure Effects of the Ketogenic Diet
05-24, doi: 10.1016/j.cell.2018.04.027 

付衛(wèi)+湯富酬+喬杰等：單細(xì)胞三重組學(xué)測序解析結(jié)直腸癌

Science[IF:41.058]

① 用單細(xì)胞三重組學(xué)測序技術(shù)，分析結(jié)直腸癌（CRC）原發(fā)和轉(zhuǎn)移瘤約1900個細(xì)胞的基因組、轉(zhuǎn)錄組和甲基化組，對腫瘤細(xì)胞進(jìn)行譜系追蹤；② CRC細(xì)胞DNA甲基化水平普遍低于癌旁正常細(xì)胞，且有很大異質(zhì)性，單個遺傳譜系有一致的DNA甲基化譜，基因表達(dá)水平與啟動子區(qū)DNA甲基化負(fù)相關(guān)、與基因區(qū)DNA甲基化正相關(guān)；③ CRC細(xì)胞的DNA去甲基化程度與癌旁正常細(xì)胞中相應(yīng)基因組區(qū)域的DNA甲基化水平正相關(guān)，染色體的DNA去甲基化與基因組不穩(wěn)定性存在關(guān)聯(lián)。

Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer
11-30, doi: 10.1126/science.aao3791 

Nature子刊：快速鑒定體內(nèi)病原體的生物芯片

Nature Biotechnology[IF:35.724]

① 開發(fā)了一種新型的一次性生物芯片，可對樣本中的病原體DNA或RNA序列進(jìn)行快速擴增、識別和量化；② 可在2小時內(nèi)完成對同一樣本中的多種病原體的鑒定，還能檢測出與耐藥性相關(guān)的病原體基因突變；③ 用該芯片成功識別并量化了某臨床樣本中的多種DNA和RNA呼吸道病毒，與現(xiàn)有的商業(yè)測試結(jié)果一致；④ 還從結(jié)核桿菌樣本中鑒定出位于6個基因中的54個SNP突變，可區(qū)分對藥物敏感的野生型菌株和有耐藥性的菌株；⑤ 該芯片可快速準(zhǔn)確鑒定病原體及其耐藥性。

Multiplexed identification, quantification and genotyping of infectious agents using a semiconductor biochip
07-16, doi: 10.1038/nbt.4179 

Cell：宿主利用共生菌產(chǎn)物，維持自身鐵穩(wěn)態(tài)

Cell[IF:31.398]

① 通過細(xì)菌突變篩選，發(fā)現(xiàn)大腸桿菌產(chǎn)生的腸桿菌素（Ent，一種鐵載體），能提升宿主線蟲的鐵水平并促進(jìn)其生長；② Ent與線蟲的ATP合成酶α亞基（ATP-1）結(jié)合，促使ATP-1與鐵離子結(jié)合，從而增加宿主鐵攝入、提高線粒體鐵含量，該作用與ATP-1在ATP合成酶復(fù)合體中的功能無關(guān)；③ 該機制在人細(xì)胞中保守；④ 為應(yīng)對細(xì)菌對鐵元素的掠奪，宿主進(jìn)化出反制機制，利用共生菌產(chǎn)物Ent來增加自身的鐵攝入，這種拔河式互作對維持鐵穩(wěn)態(tài)和共生都有重要意義。

Microbial Siderophore Enterobactin Promotes Mitochondrial Iron Uptake and Development of the Host via Interaction with ATP Synthase
08-23, doi: 10.1016/j.cell.2018.07.032 

鄭樹森+李蘭娟+闞全程：菌群標(biāo)志物有望診斷早期肝癌

Gut[IF:17.016]

① 分析健康、肝硬化和肝細(xì)胞癌（HCC）患者的糞便菌群；② 從健康到肝硬化，菌群多樣性下降，而從肝硬化到早期HCC，菌群多樣性上升；③ 與肝硬化患者相比，早期HCC患者的放線菌門增加，芽殖菌和副擬桿菌等13個菌屬富集；④ 與健康個體相比，早期HCC患者中產(chǎn)丁酸的細(xì)菌菌屬減少，生成脂多糖的菌屬增加；⑤ 建立含30個菌群標(biāo)志物的診斷模型，診斷準(zhǔn)確性較高（在75個早期HCC和105個非HCC樣本中AUC=80.64%），并在中國不同地域的患者樣本中得到驗證。

Gut microbiome analysis as a tool towards targeted non-invasive biomarkers for early hepatocellular carcinoma
07-25, doi: 10.1136/gutjnl-2017-315084 

Cell子刊：科學(xué)禁食改善前驅(qū)糖尿病

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 8名前驅(qū)糖尿病男性患者隨機分入早限時進(jìn)食（eTRF）組（每天6小時進(jìn)食期，下午3點前吃晚餐）或?qū)φ战M（每天12小時進(jìn)食期），為期5周，洗脫期7周后兩組交換；② 兩組食物攝入匹配，受試者可維持體重；③ eTRF降低了胰島素水平，改善了胰島素敏感性和β細(xì)胞功能，降低了血壓（但不影響動脈硬化、LDL或HDL膽固醇）和氧化應(yīng)激（但不影響炎癥標(biāo)志物），減少晚上的食欲；④ eTRF與代謝生理節(jié)律吻合，其改善心血管代謝健康的效果不完全依賴于減重。

Early Time-Restricted Feeding Improves Insulin Sensitivity, Blood Pressure, and Oxidative Stress Even without Weight Loss in Men with Prediabetes
05-10, doi: 10.1016/j.cmet.2018.04.010 

Gut：卡姆果提取物改變腸道菌群預(yù)防小鼠肥胖

Gut[IF:17.016]

① 給高脂高糖喂養(yǎng)的小鼠補充卡姆果（亞馬遜流域的一種水果）粗提物（CC），顯著預(yù)防了小鼠肥胖和代謝綜合征（脂肪組織炎癥、糖穩(wěn)態(tài)、脂肪肝）；② 這些效果與小鼠的棕色脂肪組織（BAT）活化和能量消耗增加有關(guān)；③ 伴隨小鼠血液循環(huán)中膽汁酸水平和組成的改變，結(jié)合初級膽汁酸減少、非結(jié)合和次級膽汁酸增加；④ 小鼠補充CC預(yù)防了內(nèi)毒素血癥，改變了腸道菌群（促進(jìn)Akk菌、減少乳桿菌），菌群的變化至少部分介導(dǎo)了CC增加能耗、抑制肥胖的作用。

Treatment with camu camu (Myrciaria dubia) prevents obesity by altering the gut microbiota and increasing energy expenditure in diet-induced obese mice
07-31, doi: 10.1136/gutjnl-2017-315565 

張澤民+歐陽文軍+申占龍：全面剖析結(jié)直腸癌微環(huán)境中的T細(xì)胞

Nature[IF:41.577]

① 基于結(jié)直腸癌（CRC）患者的1.1萬個T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組及T細(xì)胞受體（TCR），對20個T細(xì)胞亞群的組織分布、克隆擴增、遷移和狀態(tài)轉(zhuǎn)化進(jìn)行定量分析；② CD8+效應(yīng)記憶T細(xì)胞可轉(zhuǎn)化為效應(yīng)或耗竭性T細(xì)胞，后兩者呈現(xiàn)高度克隆擴增，TCR影響該轉(zhuǎn)化過程；③ 腫瘤浸潤Treg細(xì)胞多具有獨特TCR，提示其具有識別腫瘤相關(guān)抗原及局部擴增的能力；④ CXCL13+ BHLHE40+ TH1樣細(xì)胞在微衛(wèi)星不穩(wěn)定患者腫瘤中富集并高表達(dá)IGFLR1，可能與較好的免疫檢查點抑制劑應(yīng)答相關(guān)。

Lineage tracking reveals dynamic relationships of T cells in colorectal cancer
10-29, doi: 10.1038/s41586-018-0694-x 

Nature子刊：工程益生菌有望治療苯丙酮尿癥

Nature Biotechnology[IF:35.724]

① 苯丙酮尿癥（PKU）患者無法代謝飲食中的苯丙氨酸（Phe），影響大腦發(fā)育；② 基于益生菌大腸桿菌Nissle開發(fā)了工程菌株SYNB1618，使其在腸道內(nèi)的缺氧條件下可穩(wěn)定表達(dá)Phe代謝酶，將Phe代謝為反式肉桂酸，進(jìn)一步被宿主代謝為馬尿酸（HA）；③ 尿液HA可作為生物標(biāo)志物反映該菌株的體內(nèi)活性；④ 該菌株可使PKU小鼠模型的血液Phe濃度降低38%，并在健康食蟹猴中有效抑制飲食引起的血液Phe水平上升；⑤ 正在進(jìn)行臨床試驗確定該菌株在人體中的有效劑量。

Development of a synthetic live bacterial therapeutic for the human metabolic disease phenylketonuria
08-13, doi: 10.1038/nbt.4222 

Science: 菌群和免疫系統(tǒng)共同促進(jìn)腸道病毒感染

Science[IF:41.058]

① 簇細(xì)胞（tuft cell）是數(shù)量稀少、散點分布的腸道表皮細(xì)胞，特異性表達(dá)諾如病毒的蛋白受體CD300lf，是小鼠腸道內(nèi)諾如病毒感染目標(biāo)；② 以IL-4為代表的2型免疫應(yīng)答細(xì)胞因子可導(dǎo)致簇細(xì)胞增生，促進(jìn)諾如病毒的體內(nèi)感染；③ 腸道共生菌、寄生蟲也可促進(jìn)病毒感染，在菌群被干擾的情況下，細(xì)胞因子可替代菌群發(fā)揮促感染的效果，該替代效應(yīng)有組織特異性；④ 藏匿于簇細(xì)胞內(nèi)部的諾如病毒可逃避免疫監(jiān)視，形成慢性感染和攜帶病毒狀態(tài)。

Tropism for tuft cells determines immune promotion of norovirus pathogenesis
04-13, doi: 10.1126/science.aar3799 

Cell：西式飲食如何使先天性免疫細(xì)胞產(chǎn)生“記憶”

Cell[IF:31.398]

① 缺失Ldlr基因的小鼠喂食西式飲食后產(chǎn)生系統(tǒng)性炎癥，恢復(fù)正常飲食后不久，血清中即難以檢測到炎癥，但髓系細(xì)胞的應(yīng)答及仍在增強；② 西式飲食引起髓系祖細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄及表觀遺傳重編程，促進(jìn)細(xì)胞增殖并增強先天性免疫反應(yīng)；③ QTL分析經(jīng)氧化低密度脂蛋白（oxLDL）訓(xùn)練并受LPS刺激的人單核細(xì)胞，提示炎性小體介導(dǎo)了對先天性免疫的訓(xùn)練；④ 缺失Ldlr及Nlrp3基因的小鼠在西式飲食喂養(yǎng)下無系統(tǒng)性炎癥，提示NLRP3介導(dǎo)了西式飲食對先天性免疫的訓(xùn)練。

Western Diet Triggers NLRP3-Dependent Innate Immune Reprogramming
01-11, doi: 10.1016/j.cell.2017.12.013 

天天吃紅肉，菌群產(chǎn)物TMAO飆升

European Heart Journal[IF:23.425]

① 113名健康成人進(jìn)行一項隨機交叉試驗，分析吃4周紅肉、白肉或非肉類蛋白質(zhì)對氧化三甲胺（TMAO）等代謝物的影響；② 與另兩種飲食相比，紅肉顯著增加了血液和尿液的TMAO含量（均>2倍），降低了TMAO的腎排泄率，但增加了肉毒堿及其2種菌群代謝物的腎排泄；③ 同位素示蹤顯示，與非肉類蛋白質(zhì)相比，紅肉和白肉攝入可使肉毒堿（而非膽堿）生成的三甲胺和TMAO增多；④ 膳食飽和脂肪對TMAO或其代謝物無影響；⑤ 停止吃紅肉后，血液TMAO水平逐漸回落。

Impact of chronic dietary red meat, white meat, or non-meat protein on trimethylamine N-oxide metabolism and renal excretion in healthy men and women
12-10, doi: 10.1093/eurheartj/ehy799 

Cell：短期滲透性腹瀉可引起菌群的長期改變

Cell[IF:31.398]

① 給小鼠服用瀉藥聚乙二醇（PEG）引發(fā)輕度滲透性腹瀉，持續(xù)6天，可引起腸道菌群顯著而長期的改變，該影響呈劑量依賴性；② 菌群變化包括：α多樣性顯著降低、難以完全恢復(fù)，一些高豐度菌消失（如S24-7菌科和γ變形菌綱），伴隨原本占據(jù)同生態(tài)位的低豐度菌的擴張（如擬桿菌科）；③ 宿主腸道生理受損，但停藥后很快恢復(fù)；④ 腹瀉也引起宿主的先天和適應(yīng)性免疫應(yīng)答，有些免疫反應(yīng)長期存在；⑤ 降低環(huán)境干凈程度，有助于消失的菌在腸道內(nèi)重新定殖。

Transient Osmotic Perturbation Causes Long-Term Alteration to the Gut Microbiota
06-14, doi: 10.1016/j.cell.2018.05.008 

于君等：腸道病毒組特征或可用于大腸癌診斷和預(yù)后評估

Gastroenterology[IF:20.773]

① 分析74例結(jié)直腸癌（CRC）患者和92例對照個體的糞便樣本的病毒組；② CRC患者的腸道噬菌體多樣性顯著上升， 22個病毒屬可作為區(qū)分CRC和對照的標(biāo)志物（AUROC=0.802），并用另外3個隊列數(shù)據(jù)進(jìn)行驗證；③ 腸道病毒組特征可區(qū)分早期和晚期CRC，4個標(biāo)志物與患者生存率降低相關(guān)，獨立于腫瘤階段、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等臨床病理指標(biāo)；④ CRC患者糞便樣本中，噬菌體與口腔共生細(xì)菌間的互作發(fā)生改變；⑤ 與CRC相關(guān)的腸道病毒組特征，或可用于CRC診斷和預(yù)后預(yù)測。

Alterations in Enteric Virome Associate With Colorectal Cancer and Survival Outcomes
04-21, doi: 10.1053/j.gastro.2018.04.018 

Science：腸道菌群影響白色念珠菌與宿主的共生演化

Science[IF:41.058]

① 將白色念珠菌在非天然宿主小鼠腸道中進(jìn)行連續(xù)傳代，獲得多個腸內(nèi)演化菌株；② 在抗生素處理的小鼠腸道中演化的菌株，與小鼠的共生適性增加、血液感染性下降，與菌株的基因突變積累有關(guān)，尤其是FLO8基因失活，致使其無法形成菌絲；③ 但在未經(jīng)抗生素處理、腸道菌群完好的小鼠中，無法獲得有上述突變和表型的低毒力菌株；④ 給小鼠定殖低毒力菌株，可通過天然免疫機制，快速刺激IL-6促炎細(xì)胞因子應(yīng)答，增強小鼠對多種致病菌感染的短期抵抗力。

Experimental evolution of a fungal pathogen into a gut symbiont
11-01, doi: 10.1126/science.aat0537 

宋保亮+馬依彤等：靶向LIMA1，減少腸道吸收和血液中的壞膽固醇

Science[IF:41.058]

① 從哈薩克族中鑒定出LIMA1的一個基因變異，與低水平的血漿低密度脂蛋白膽固醇（LDL-C）和小腸膽固醇吸收降低相關(guān)；② 小鼠中LIMA1在小腸中高度表達(dá)，在小鼠腸道中敲除Lima1可減少膽固醇吸收，并對飲食誘導(dǎo)的高膽固醇血癥具有抗性；③ LIMA1與介導(dǎo)膽固醇吸收的NPC1L1和myosin Vb在小腸上皮刷狀緣膜共定位，并與NPC1L1和myosin Vb直接結(jié)合介導(dǎo)二者互作，參與NPC1L1的細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)運，促進(jìn)膽固醇吸收；④ 阻斷LIMA1-NPC1L1互作，可減少膽固醇吸收。

A LIMA1 variant promotes low plasma LDL cholesterol and decreases intestinal cholesterol absorption
06-08, doi: 10.1126/science.aao6575 

Science：抑制腸道慢性炎癥或能治療腸道息肉

Science[IF:41.058]

① LKB1是一個絲氨酸/蘇氨酸激酶，參與細(xì)胞增殖及代謝，其突變與腫瘤及胃腸息肉發(fā)生相關(guān)；② LKB1雜合子小鼠會自發(fā)性生成胃腸息肉，但如果特異性地在腸上皮細(xì)胞中敲除則無此表型，提示LKB1在非上皮細(xì)胞中有作用；③ 在T細(xì)胞中特異性半敲除LKB1，導(dǎo)致小鼠自發(fā)性胃腸息肉，伴隨免疫細(xì)胞浸潤、STAT3活化，以及IL-6、IL-11和CXCL2等炎癥因子表達(dá)升高；④ IL6缺失和JAK2抑制劑均可有效緩解腸息肉，提示抑制腸道慢性炎癥可作為該病的治療策略。

LKB1 deficiency in T cells promotes the development of gastrointestinal polyposis
07-27, doi: 10.1126/science.aan3975 

Immunity：膳食纖維如何在流感中起保護(hù)作用

Immunity[IF:19.734]

① 菊粉及短鏈脂肪酸等可發(fā)酵膳食纖維在流感引起的病理中起保護(hù)作用，可能機制有兩種；② 一種是：短鏈脂肪酸可通過增加骨髓中的巨噬細(xì)胞前體細(xì)胞（Ly6c-巡邏單核細(xì)胞）而改善造血作用；③ Ly6c-巡邏單核細(xì)胞的增加導(dǎo)致替代性活化的巨噬細(xì)胞（M2巨噬細(xì)胞）的數(shù)量增加，并在呼吸道中減少趨化因子CXCL1；④ CXCL1的減少導(dǎo)致呼吸道中性粒細(xì)胞招募減少，抑制了感染中的組織免疫病理；⑤ 另一種是：短鏈脂肪酸通過提高代謝而增強CD8+ 效應(yīng)T細(xì)胞的功能。

Dietary Fiber Confers Protection against Flu by Shaping Ly6c Patrolling Monocyte Hematopoiesis and CD8 T Cell Metabolism
05-15, doi: 10.1016/j.immuni.2018.04.022 

Science：培養(yǎng)患者的腫瘤類器官，評估腫瘤療效

Science[IF:41.058]

① 71例參與I/II期臨床試驗的晚期、多線復(fù)治結(jié)直腸和胃食管癌患者的110份新鮮活檢標(biāo)本，70%制成患者來源的類器官（PDO）；② 免疫組化、癌癥驅(qū)動基因突變、ddPCR等表型和基因型特征分析提示PDO與患者原發(fā)腫瘤高度相似；③ 腫瘤類器官的分子特征與藥物篩選結(jié)果匹配，PDO可用于確定腫瘤缺陷和改善療效；④ 分析體外類器官和PDO基礎(chǔ)上的原位小鼠腫瘤移植瘤模型，并與臨床試驗受試者的應(yīng)答作比較；⑤ PDO可反映患者的臨床療效，或可用于個性化醫(yī)療。

Patient-derived organoids model treatment response of metastatic gastrointestinal cancers
02-23, doi: 10.1126/science.aao2774 

傅靜遠(yuǎn)等：調(diào)控心血管疾病相關(guān)蛋白的遺傳-菌群互作

Nature Genetics[IF:27.125]

① 納入1264人進(jìn)行全基因組/宏基因組關(guān)聯(lián)研究；② 分析的92種心血管疾病相關(guān)蛋白質(zhì)中，血漿濃度與遺傳和菌群因素相關(guān)的分別為73和41種，其中31種與二者皆相關(guān)；③ 遺傳和菌群因素對蛋白濃度的影響大多存在疊加效應(yīng)，總體上遺傳的影響較大，二者可共同解釋平均17.5%（1%-76.6%）的個體間差異；④ 遺傳因素主要影響免疫相關(guān)蛋白，腸道菌群主要影響代謝和腸道健康相關(guān)蛋白；⑤ 鑒定出影響腸上皮功能、脂代謝和中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能的多個宿主-菌群互作。

Individual variations in cardiovascular-disease-related protein levels are driven by genetics and gut microbiome
09-24, doi: 10.1038/s41588-018-0224-7 

Cell：用飲食改變代謝，與病原體和平共處

Cell[IF:31.398]

① 用半致死劑量的鼠檸檬酸桿菌（CR）感染小鼠，轉(zhuǎn)錄組分析表明，與生病的小鼠相比，無癥狀小鼠中鐵代謝相關(guān)基因表達(dá)上調(diào)；② 通過飲食補充鐵，可使感染1000倍致死劑量CR的小鼠健康存活，但并不影響腸內(nèi)CR數(shù)量；③ 補充鐵誘導(dǎo)小鼠發(fā)生胰島素抵抗，使腸道吸收葡萄糖的能力下降，增加了腸腔內(nèi)供CR代謝的糖，抑制了CR毒力因子表達(dá)，補充糖也有同樣效果；④ 短期補鐵可對毒力弱的CR菌株進(jìn)行選擇，從而導(dǎo)致小鼠與病菌的無癥狀長期共存。

Cooperative Metabolic Adaptations in the Host Can Favor Asymptomatic Infection and Select for Attenuated Virulence in an Enteric Pathogen
08-09, doi: 10.1016/j.cell.2018.07.016 

Cell子刊：在菌株水平追蹤FMT前后的菌群變化

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 分析18位復(fù)發(fā)艱難梭菌感染患者在糞菌移植（FMT）期間和前后的腸道菌群；② 成功建模預(yù)測細(xì)菌在患者中的植入情況，并開發(fā)出用于解析菌株動態(tài)變化的方法Strain Finder；③ FMT后患者的菌群動態(tài)存在較大個體差異，是來自患者、供體和環(huán)境細(xì)菌的復(fù)雜混合，F(xiàn)MT療效或取決于某些特定菌株的植入；④ 細(xì)菌植入情況主要取決于在供體和患者中原來的豐度+細(xì)菌類別，來自供體某菌種的多個菌株以“全或無”的方式定殖；⑤ 這些原理在其他FMT數(shù)據(jù)中得到驗證。

Strain Tracking Reveals the Determinants of Bacterial Engraftment in the Human Gut Following Fecal Microbiota Transplantation
02-14, doi: 10.1016/j.chom.2018.01.003 

林欣+王婷婷等：腸道真菌失調(diào)可促進(jìn)結(jié)腸癌

Immunity[IF:19.734]

① Card9-/-小鼠的炎癥相關(guān)結(jié)腸癌易感性高于野生型小鼠，腫瘤中髓系抑制細(xì)胞（MDSC）聚積；② 缺乏CARD9的巨噬細(xì)胞殺滅真菌的能力受損，導(dǎo)致小鼠腸道真菌增多、真菌群組成改變，熱帶念珠菌的富集促進(jìn)結(jié)腸腫瘤；③ 熱帶念珠菌可將小鼠骨髓細(xì)胞誘導(dǎo)為MDSC，對CD8+和CD4+ T細(xì)胞有強力抑制作用；④ 用氟康唑進(jìn)行抗真菌治療，可減少MDSC積累，抑制Card9-/-小鼠的結(jié)腸癌；⑤ 結(jié)腸癌患者腸道中真菌增多（尤其熱帶念珠菌），與腫瘤內(nèi)MDSC含量正相關(guān)。

The Adaptor Protein CARD9 Protects against Colon Cancer by Restricting Mycobiota-Mediated Expansion of Myeloid-Derived Suppressor Cells
09-18, doi: 10.1016/j.immuni.2018.08.018 

Cell：吃飽就開心的腸-腦軸神經(jīng)獎賞回路

Cell[IF:31.398]

① 通過組合使用攜帶不同分子工具的病毒，建立靶向小鼠腸-腦軸迷走感覺神經(jīng)元的光遺傳學(xué)方法，發(fā)現(xiàn)迷走神經(jīng)在腸-腦軸的神經(jīng)獎賞通路中有關(guān)鍵作用；② 支配上端腸胃的迷走神經(jīng)中，左右分支以不對稱的方式上升至孤束核中的不同區(qū)域；③ 小鼠行為實驗表明，激活右側(cè)（而非左側(cè)）的迷走神經(jīng)感覺神經(jīng)節(jié)，可以誘導(dǎo)中腦黑質(zhì)釋放多巴胺；④ 右側(cè)迷走神經(jīng)節(jié)-孤束核-臂旁核-黑質(zhì)-紋狀體通路，是膽囊收縮素調(diào)節(jié)小鼠攝食行為的途徑。

A Neural Circuit for Gut-Induced Reward
09-20, doi: 10.1016/j.cell.2018.08.049 

Immunity：益生菌LGG如何促進(jìn)小鼠骨生成？

Immunity[IF:19.734]

① 口服鼠李糖乳桿菌GG（LGG）可使小鼠腸道中產(chǎn)生丁酸的梭菌綱豐度上升，提高腸道和血液丁酸濃度，進(jìn)而促進(jìn)骨生成，增加骨量；② 無菌小鼠試驗證實該作用依賴于腸道菌群及其產(chǎn)生的丁酸；③ 補充LGG或丁酸，可使小鼠腸道和骨髓中調(diào)節(jié)性T細(xì)胞（Treg）增多，而減少Treg可消除LGG和丁酸對骨生成的促進(jìn)作用；④ 骨髓中Treg可促進(jìn)CD8+T細(xì)胞中NFAT1-SMAD3轉(zhuǎn)錄復(fù)合體與Wnt10b啟動子結(jié)合，增加Wnt10b分泌，進(jìn)而活化成骨細(xì)胞的Wnt信號通路，刺激骨生成。

The Microbial Metabolite Butyrate Stimulates Bone Formation via T Regulatory Cell-Mediated Regulation of WNT10B Expression
11-13, doi: 10.1016/j.immuni.2018.10.013 

Cell：移民美國，西化的不僅是生活方式，還有腸道菌群

Cell[IF:31.398]

① 收集514名在泰國和美國居住的苗族和克倫族個體的樣本和數(shù)據(jù)，分析移民美國對腸道菌群的影響；② 從非西方國家移民美國，與腸道菌群發(fā)生顯著擾動相關(guān)，包括多樣性降低、原住菌株喪失、降解植物纖維相關(guān)的細(xì)菌酶（如β-葡聚糖酶和糖苷水解酶）減少、優(yōu)勢菌從普氏菌屬向擬桿菌屬轉(zhuǎn)變；③ 這些變化在移民后6-9個月內(nèi)即可檢測到，隨在美國居住時間增長而加劇，在肥胖和二代移民個體中尤為明顯；④ 菌群的變化一定程度上與飲食改變有關(guān)。

US Immigration Westernizes the Human Gut Microbiome
11-01, doi: 10.1016/j.cell.2018.10.029 

Cell：高脂飲食破壞系統(tǒng)代謝節(jié)律的協(xié)調(diào)性

Cell[IF:31.398]

① 分析小鼠8個組織（兩處大腦組織、骨骼肌、褐色和白色脂肪、肝、血、精子）的24小時代謝組動態(tài)變化，繪制節(jié)律性代謝圖譜；② 鑒定出組織特異的節(jié)律性代謝組特征，以及組織內(nèi)和組織間的代謝物/代謝通路間的若干新關(guān)聯(lián)；③ 正常飲食下，代謝物間存在強時空關(guān)聯(lián)性，反映出多組織器官間的交流和協(xié)調(diào)的代謝節(jié)律，這種全局關(guān)聯(lián)性被高脂飲食破壞并重構(gòu)；④ 這些發(fā)現(xiàn)可作為深入研究系統(tǒng)性代謝網(wǎng)絡(luò)、挖掘新的代謝疾病標(biāo)志物和相關(guān)機制的新起點。

Atlas of Circadian Metabolism Reveals System-wide Coordination and Communication between Clocks
09-06, doi: 10.1016/j.cell.2018.08.042 

Cell子刊：李斯特菌如何突破腸道上皮屏障

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 單核細(xì)胞增多性李斯特氏菌等致病菌可突破腸上皮細(xì)胞構(gòu)成的屏障；② 李斯特菌粘附蛋白（LAP）可通過促進(jìn)TNF-α和IL-6的釋放，引起腸上皮屏障功能障礙，促進(jìn)細(xì)菌易位；③ LAP與其表面受體Hsp60相互作用，激活NF-κB信號通路，通過緊密連接蛋白1、閉合蛋白和E-鈣粘蛋白的胞內(nèi)再分布，促進(jìn)肌球蛋白輕鏈激酶（MLCK）介導(dǎo)的上皮屏障開啟；④ 藥物抑制MLCK或NF-κB或敲除MLCK，可抑制小鼠體內(nèi)的接合蛋白錯誤定位及單核細(xì)胞增多性李斯特氏菌易位。

Listeria Adhesion Protein Induces Intestinal Epithelial Barrier Dysfunction for Bacterial Translocation
03-28, doi: 10.1016/j.chom.2018.03.004 

陸五元+邵永平等：特定防御素居然幫助志賀氏桿菌感染宿主！

Immunity[IF:19.734]

① 人腸道α-防御素5（HD5）是一種宿主防御肽，對腸道穩(wěn)態(tài)及先天性免疫十分重要；② 在體內(nèi)及體外實驗中，HD5均可通過提升細(xì)菌的粘附能力，促進(jìn)志賀氏桿菌的感染性，這種促進(jìn)作用依賴于HD5的序列及結(jié)構(gòu)；③ 志賀氏桿菌因缺失菌毛，難以有效地粘附于宿主，但菌毛的缺失促進(jìn)了HD5對志賀氏桿菌粘附能力的提升；④ HD5通過靶向細(xì)菌膜蛋白，促進(jìn)志賀氏桿菌的粘附于感染，可惡化志賀氏桿菌引起的病理表現(xiàn)。

Human Enteric α-Defensin 5 Promotes Shigella Infection by Enhancing Bacterial Adhesion and Invasion
05-29, doi: 10.1016/j.immuni.2018.04.014 

BMJ：低能量飲食的良好減重效果

British Medical Journal[IF:23.259]

① 納入英國的278名肥胖成年人，138名進(jìn)行低能量全飲食替代（TDR），140名進(jìn)行普通護(hù)理，12個月后檢測各指標(biāo)；② TDR減重效果（-10.7kg）比普通護(hù)理（-3.1kg）更明顯，調(diào)整后平均差值為-7.2kg，并可顯著改善心血管和代謝風(fēng)險標(biāo)記物；③ TDR及普通護(hù)理組分別有45%和15%的參與者減重超過10%，以及11%和12%的參與者產(chǎn)生中度或更嚴(yán)重的不良反應(yīng)；④ 在護(hù)士指導(dǎo)下進(jìn)行體重管理+810 kcal/天的低能量全飲食替代方案有益于減重，并改善心血管疾病風(fēng)險。

Doctor Referral of Overweight People to Low Energy total diet replacement Treatment (DROPLET): pragmatic randomised controlled trial
09-26, doi: 10.1136/bmj.k3760 

Science子刊：170萬人數(shù)據(jù)，切闌尾能減少帕金森風(fēng)險？

Science Translational Medicine[IF:16.71]

① 分析近170萬人數(shù)據(jù)，最長追蹤52年，發(fā)現(xiàn)切除闌尾的人群的帕金森病（PD）總體風(fēng)險降低19.3%，累計發(fā)病率減少16.9%，該現(xiàn)象在農(nóng)村人群中更明顯；② 分析849例PD患者記錄發(fā)現(xiàn)，在PD發(fā)病前≥30年時切除闌尾的患者，PD發(fā)病年齡平均推后3.6年；③ 在48例健康成人闌尾樣本中，檢測到神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)含有α-突觸核蛋白聚合物，以及大量與PD病理相關(guān)的α-突觸核蛋白片段；④ 人闌尾組織裂解物，可快速誘導(dǎo)重組α-突觸核蛋白發(fā)生裂解和形成寡聚體。

The vermiform appendix impacts the risk of developing Parkinson’s disease
10-31, doi: 10.1126/scitranslmed.aar5280 

湖南師大等：Imd-NF-κB通路促進(jìn)腸道抗菌免疫同時維持屏障完整性

Immunity[IF:19.734]

① 腸上皮通過細(xì)胞脫落和干細(xì)胞活化而不斷更新，這種更新維持腸屏障完整性；② 在果蠅中，細(xì)菌感染激活的Imd-NF-kB通路，不僅誘導(dǎo)抗菌肽（AMP）的表達(dá)，而且通過不依賴ROS相關(guān)凋亡的機制控制腸上皮細(xì)胞（EC）脫落；③ 細(xì)菌感染下，lmd通路協(xié)同JNK通路特異性誘導(dǎo)EC脫落，并需要降低轉(zhuǎn)錄因子GATAe的表達(dá)；④ 細(xì)胞特異性NF-κB反應(yīng)能夠同時在不同EC群中產(chǎn)生AMP并促進(jìn)EC脫落；⑤ Imd-NF-κB通路介導(dǎo)AMP產(chǎn)生和維持屏障完整性，對腸道抗菌反應(yīng)至關(guān)重要。

Cell-Specific Imd-NF-κB Responses Enable Simultaneous Antibacterial Immunity and Intestinal Epithelial Cell Shedding upon Bacterial Infection
05-08, doi: 10.1016/j.immuni.2018.04.010 

50萬人追蹤10年：咖啡或許促進(jìn)長壽

JAMA Internal Medicine[IF:19.989]

① 追蹤2006至2016年間近50萬英國人的咖啡攝入量與死亡率，評估二者的關(guān)聯(lián)；② 咖啡攝入與全因死亡率負(fù)相關(guān)，以不喝咖啡的人群作為參照，每天攝入咖啡量分別為<1、1、2-3、4-5、6-7和≥8杯對應(yīng)的風(fēng)險比（hr）分別是0.94、0.92、0.88、0.88、0.84和0.86；③ 類似關(guān)聯(lián)存在于不同咖啡種類（速溶、研磨和無咖啡因咖啡）與多種常見死亡原因間，且與影響咖啡因代謝的遺傳因素?zé)o關(guān)；④="">

Association of Coffee Drinking With Mortality by Genetic Variation in Caffeine Metabolism: Findings From the UK Biobank
07-02, doi: 10.1001/jamainternmed.2018.2425 

Cell子刊：每天禁食讓小鼠健康長壽，吃得多也不怕

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 雄性小鼠分為兩組吃不同食物，每組又分為三小組：隨意吃（AL）、熱量限制（CR）、每天一頓但熱量與AL相同（MF）；② CR和MF小鼠都學(xué)會快速消滅食物，因此每天都有禁食期（CR禁食更長），伴隨節(jié)律性的代謝特征；③ 不論吃哪種食物，AL與MF小鼠的體重和胰島素敏感度相似（都不如CR小鼠），但MF和CR均延長小鼠壽命，分別比AL小鼠長11%和28%，并推遲了衰老相關(guān)疾病；④ 進(jìn)食模式對小鼠壽命的影響?yīng)毩⒂谑澄锝M成，延長每日禁食促進(jìn)小鼠健康長壽。

Daily Fasting Improves Health and Survival in Male Mice Independent of Diet Composition and Calories
09-06, doi: 10.1016/j.cmet.2018.08.011 

BMJ：海鮮中的ω-3，或有助于老年健康

British Medical Journal[IF:23.259]

① 一項美國前瞻性隊列研究，納入2622名老年人，平均起始年齡74.4歲，最長隨訪22年，分析基線和隨訪期間共3個時間點的血漿ω-3多不飽和脂肪酸（n3-PUFA）含量與健康老化的關(guān)聯(lián)；② 多變量校正后，血液中有較高水平的來自海產(chǎn)的長鏈n3-PUFA，及其中的二十碳五烯酸和二十二碳五烯酸，均與較高的健康老化可能性相關(guān)；③ 而海產(chǎn)中的二十二碳六烯酸，以及植物中的α-亞麻酸，與健康老化無顯著相關(guān)性；④ 應(yīng)建議老年人增加膳食攝入n3-PUFA。

Serial circulating omega 3 polyunsaturated fatty acids and healthy ageing among older adults in the Cardiovascular Health Study: prospective cohort study
10-17, doi: 10.1136/bmj.k4067 

Cell：慢性便秘，可能是病毒感染損傷了腸道神經(jīng)

Cell[IF:31.398]

① 以神經(jīng)系統(tǒng)為靶的多種黃病毒，可感染小鼠腸道神經(jīng)，導(dǎo)致腸神經(jīng)細(xì)胞的急性損傷和死亡、腸道擴張、腸道運動變慢；② 黃病毒激活的CD8+ T細(xì)胞在腸道感染處浸潤，促進(jìn)上述疾病表型；③ 存活下來的小鼠發(fā)展出慢性腸道運動障礙，可持續(xù)數(shù)月，之后接種與黃病毒無關(guān)的病毒疫苗、暴露于非感染性炎癥刺激物，均可惡化腸道運動障礙；④ 感染嗜神經(jīng)病毒及其引發(fā)的免疫應(yīng)答，可造成腸神經(jīng)系統(tǒng)損傷，引起腸道蠕動障礙，或許是腸易激綜合征等的潛在病因。

Intestinal Dysmotility Syndromes following Systemic Infection by Flaviviruses
10-04, doi: 10.1016/j.cell.2018.08.069 

Cell：又是單細(xì)胞水平！腸絨毛不同區(qū)域的細(xì)胞有不同功能

Cell[IF:31.398]

① 用激光捕獲顯微切割轉(zhuǎn)錄組測序，鑒定出小鼠腸絨毛不同區(qū)域的標(biāo)志性基因，結(jié)合單個腸絨毛細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，對單個腸細(xì)胞在絨毛軸上的定位進(jìn)行空間重構(gòu)；② 腸細(xì)胞功能沿絨毛軸存在多個分區(qū)，從絨毛底部向頂部移動的過程中，腸細(xì)胞經(jīng)歷一系列狀態(tài)轉(zhuǎn)變；③ 隱窩之上的絨毛底部是應(yīng)答菌群的“抗微生物區(qū)”，之后腸細(xì)胞順序性表達(dá)氨基酸、碳水化合物、多肽、脂肪的轉(zhuǎn)運/吸收相關(guān)基因，絨毛頂端細(xì)胞表達(dá)以Cd73為特征的免疫調(diào)節(jié)基因。

Spatial Reconstruction of Single Enterocytes Uncovers Broad Zonation along the Intestinal Villus Axis
09-27, doi: 10.1016/j.cell.2018.08.063 

中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院：新生兒中，髓系抑制細(xì)胞對調(diào)控炎癥反應(yīng)很重要

Nature Medicine[IF:32.621]

① 髓源性抑制細(xì)胞（MDSC）短暫出現(xiàn)于小鼠和人類的新生兒期，可強力抑制T細(xì)胞，此活性由母乳中的乳鐵蛋白觸發(fā)，由一氧化氮、PGE2、S100A9和S100A8蛋白介導(dǎo)；② 新生兒MDSC的轉(zhuǎn)錄組與腫瘤MDSC相似，但其抗微生物基因網(wǎng)絡(luò)表達(dá)上調(diào)，有強效的抗菌活性；③ 小鼠模型中，MDSC可控制新生兒壞死性小腸結(jié)腸炎（NEC）；④ 極低體重嬰兒易得NEC，其體內(nèi)MDSC水平和抑制性活性較低；⑤ MDSC在新生兒中的短暫存在，或?qū)憾ㄖ硯淼难装Y反應(yīng)有重要調(diào)控作用。

Transitory presence of myeloid-derived suppressor cells in neonates is critical for control of inflammation
01-15, doi: 10.1038/nm.4467 

BMJ：適度飲酒與更低的癡呆風(fēng)險相關(guān)？

British Medical Journal[IF:23.259]

① 對9087名35-55歲的受試者進(jìn)行23年的跟蹤隨訪；② 受試者分為3組：戒酒（包括長期戒酒、近期戒酒、偶爾飲酒）、每周攝入1-14單位酒精、每周攝入14單位酒精以上；③ 與每周攝入1-14單位酒精相比，戒酒與癡呆風(fēng)險升高相關(guān)；④ 在每周攝入14單位酒精以上的受試者中，酒精攝入量每增加7個單位，與癡呆風(fēng)險增加17%相關(guān)；⑤ 與每周攝入1-14單位酒精相比，在從中年到老年的過渡期中，長期戒酒、減少飲酒量、長期大量飲酒（葡萄酒）與癡呆風(fēng)險升高相關(guān)。

Alcohol consumption and risk of dementia: 23 year follow-up of Whitehall II cohort study
08-01, doi: 10.1136/bmj.k2927 

廈大林圣彩+林舒勇等：AIDA控制小腸脂肪吸收、預(yù)防肥胖

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 膳食脂肪的小腸吸收效率是個體易患肥胖的一個主要決定因素；② 抑制內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)蛋白降解途徑（ERAD），可使小腸中三酰甘油合成酶含量上升、脂肪吸收增加；③ C2結(jié)構(gòu)域蛋白AIDA與ERAD中E3泛素連接酶HRD1互作，介導(dǎo)了ERAD對三酰甘油合成過程中限速酶（ GPAT3、 MOGAT2和DGAT2）的降解；④ 全身和腸道特異性Aida基因敲除，均使小鼠肥胖，且腸道中的脂肪酸再酯化和脂肪吸收增多、脂肪儲存增加；⑤ AIDA在腸道中控制脂肪吸收、預(yù)防肥胖。

AIDA Selectively Mediates Downregulation of Fat Synthesis Enzymes by ERAD to Retard Intestinal Fat Absorption and Prevent Obesity
04-03, doi: 10.1016/j.cmet.2018.02.021 

Nature子刊：在腸腔內(nèi)形成屏障的生物材料

Nature Materials[IF:39.235]

① 在硫糖鋁的基礎(chǔ)上研發(fā)出一種口服物質(zhì)LuCI（腸腔覆蓋物）；② LuCI干粉加水后可形成糊劑，灌胃后1小時內(nèi)可在大鼠的胃、十二指腸和小腸中形成覆蓋層，持續(xù)數(shù)小時，且該過程可逆；③ LuCI有良好的消化道粘膜相容性，給大鼠連續(xù)6天灌胃LuCI，未對腸道結(jié)構(gòu)產(chǎn)生明顯影響，也未引發(fā)腹瀉和減重；④ 大鼠口服LuCI后可減少后續(xù)的葡萄糖等營養(yǎng)物質(zhì)吸收，或能用于改善糖尿??；⑤ LuCI還可作為給藥載體，保護(hù)口服的蛋白質(zhì)藥物免于被消化液降解。

Therapeutic luminal coating of the intestine
06-11, doi: 10.1038/s41563-018-0106-5