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      科研小白血淚之細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)總結(jié)

       小夢(mèng)想在努力 2019-01-02

      為什么說BMJ是一本神奇的雜志?對(duì)于做腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)的“科研民工”而言,細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)是再熟悉不過了。但是再簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)也會(huì)栽跟頭,這不,因?yàn)榇中拇笠?,我前后做了兩周多的無用功,在此,基于自己失敗的教訓(xùn),給大家做一點(diǎn)總結(jié)。

       

      我為什么會(huì)選擇做細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)?

       

      1)一定程度上模擬了體內(nèi)細(xì)胞遷移的過程;

      2)適合研究細(xì)胞與胞外基質(zhì)(ECM)、細(xì)胞與細(xì)胞之間相互作用引起的細(xì)胞遷移。

      3)與包括活細(xì)胞成像在內(nèi)的顯微鏡系統(tǒng)兼容,可用于分析細(xì)胞間的相互作用。

      4)簡(jiǎn)單、便宜。(重中之重)



      要準(zhǔn)備哪些材料?

       

      做細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn),基本上不需要額外買設(shè)備,準(zhǔn)備:細(xì)胞樣品、6孔板(基于個(gè)人實(shí)驗(yàn)需要)、marker筆、直尺、槍頭、試劑、無血清培養(yǎng)基、PBS,所有需要的器材都要滅菌,超凈工作臺(tái)紫外線消毒至少30min。

       

      該實(shí)驗(yàn)一般適用于上皮,纖維樣細(xì)胞系,本身有遷移能力,且較強(qiáng);有極性,方便測(cè)量,觀察;對(duì)無血清有較強(qiáng)的忍受力。

       

      操作步驟?

       

      1)我習(xí)慣于在六孔板背面每隔1cm畫上一條直線,方便之后鏡下觀察每個(gè)區(qū)域。每個(gè)孔加入5*105個(gè)細(xì)胞(可以根據(jù)牛鮑計(jì)數(shù)板確定自己合適的稀釋倍數(shù))

       

      注:數(shù)量以過夜貼壁能鋪滿為宜,適當(dāng)調(diào)整;數(shù)量少時(shí)可培養(yǎng)一段時(shí)間至鋪滿板底。這就第一個(gè)坑,第一次做這個(gè)實(shí)驗(yàn)的時(shí)候,并沒有理解鋪滿到底有多滿,一定要等到細(xì)胞鋪滿,彼此之間沒有空隙,否則會(huì)影響后續(xù)數(shù)據(jù)分析。

       

      2)待細(xì)胞鋪滿后,用200ul槍頭垂直于孔板和線制造細(xì)胞劃痕,盡量保證各個(gè)劃痕寬度一致, 人工槍頭制造劃痕難以保證劃痕寬度的一致性,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,這也是該方法最大的缺陷,有條件的同學(xué)可以選擇culture Insert(如下圖),將細(xì)胞接種于Dish中間的Insert,培養(yǎng)。細(xì)胞長滿Insert 區(qū)域后用鑷子移除Insert即可產(chǎn)生500um寬度的劃痕

       

      不過我查了一下價(jià)格,有一丟丟小貴,所以還是選擇了槍頭代替,其實(shí)多練幾次,效果也是不錯(cuò)的,捂臉說到底還是為了省錢。



      3)吸掉舊培養(yǎng)基,用無菌PBS沖洗細(xì)胞3次,去除劃下的細(xì)胞后,再加入無血清培養(yǎng)基,根據(jù)需要設(shè)加實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組。

       

      注:沖洗時(shí)溫柔,貼壁加入,避免沖掉單層細(xì)胞,反復(fù)多次沖洗,盡量洗掉所有的細(xì)胞碎片,否則會(huì)影響拍照效果。

       

      4)放入37度5%CO2培養(yǎng)箱,培養(yǎng)。按0,6,12,24小時(shí)拍照(觀察時(shí)間根據(jù)個(gè)人實(shí)驗(yàn)需要)。一般為上述時(shí)間,時(shí)間太久,細(xì)胞繁殖,假陽性。

       

      注:這是第二個(gè)坑,一般情況下,大家都會(huì)設(shè)置對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組,實(shí)驗(yàn)組都是加了各種抑制或促進(jìn)細(xì)胞增長的藥物,建議不要把觀察時(shí)間設(shè)置的太長,因?yàn)楹苋菀自斐杉?xì)胞污染死亡或者過度增殖造成的假陽性結(jié)果。

       

      5)圖像數(shù)據(jù)分析。我習(xí)慣于用Image Pro Plus進(jìn)行分析,其實(shí)ImageJ也是可以的。打開軟件,點(diǎn)擊file→open,選擇你需要處理的圖片(HUVEC人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞)。

       

      選擇區(qū)域之前,可以先對(duì)圖片處理一下,加強(qiáng)細(xì)胞的輪廓。點(diǎn)擊process→filters→edge→sobel→點(diǎn)擊apply,效果如圖所示。



      中間黑色的劃痕區(qū)域可以用描繪工具中的魔棒工具來選擇。點(diǎn)擊irregular AOI→NEW AOI,圈選中間黑色的劃痕區(qū)域。



      接下來開始測(cè)量,除了測(cè)量面積之外,還可以測(cè)量外框長度,也就是劃痕的長度,也就是圖片的整體高度。點(diǎn)擊count/size→measure→select measurements→Box Height(這就是劃線的長度)。



      點(diǎn)擊edit→convert AOI(s) to Object(s) →view→meaurement data。



      劃痕的平均寬度=Area/Box Height,例如圖中數(shù)據(jù)654727/1200≈545.61

       

      注:一個(gè)要注意的問題,隨著細(xì)胞的不斷遷移,劃痕會(huì)不斷縮小,在計(jì)算不同時(shí)間點(diǎn)劃痕寬度的縮小時(shí),不要計(jì)算其相除的比例值,而是要計(jì)算想減的差值。

       

      好了,今天就策到這里,希望對(duì)大家有幫助。 



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