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根據(jù)近幾年來(lái)的大量研究證實(shí)，腸道菌群能夠影響人體生理和心理健康的方方面面。盡管如此，依然有很多細(xì)菌仍未被科學(xué)家們“定義”。近日，一項(xiàng)新研究發(fā)現(xiàn)了大約2000種過(guò)去未知的腸道細(xì)菌。

這項(xiàng)發(fā)表在《Nature》上的新研究發(fā)現(xiàn)了1952種新腸道細(xì)菌，這些細(xì)菌是科學(xué)家以前從未在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)過(guò)的。

該研究團(tuán)隊(duì)由位于歐洲生物信息學(xué)研究所(EMBL-EBI)和Wellcome Sanger研究所的研究人員組成。他們使用計(jì)算分析評(píng)估了來(lái)自世界各地參與者的腸道微生物組樣本。

研究通訊作者、EMBL-EMI的Rob Finn解釋說(shuō)：“計(jì)算方法使得我們能夠發(fā)現(xiàn)尚未在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)的細(xì)菌。使用宏基因組分析遺傳物質(zhì)重建細(xì)菌基因組有點(diǎn)類似在把成百上千的拼圖打亂混到一起后再對(duì)它們進(jìn)行重新拼接，而且我們并不知道最終的完整圖片是什么樣的，甚至混在一起的拼圖可能還會(huì)缺失，這使得該任務(wù)更加艱巨?！?/p>

然而，F(xiàn)inn繼續(xù)說(shuō)道：“現(xiàn)在研究人員可以利用一系列計(jì)算工具來(lái)補(bǔ)充甚至是指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)工作，以取得關(guān)于人類腸道的新發(fā)現(xiàn)。”

一種新方法

研究團(tuán)隊(duì)從11850份不同腸道微生物組樣本中重建了92143個(gè)基因組。這使得他們發(fā)現(xiàn)了在此之前不為人知的1952種新腸道細(xì)菌。

Finn解釋說(shuō)，很多細(xì)菌物種都“保持低調(diào)”，研究人員只在腸道內(nèi)發(fā)現(xiàn)了數(shù)量非常少的細(xì)菌，或者它們無(wú)法在腸道以外的環(huán)境定植。

這使得研究人員無(wú)法將這類細(xì)菌列入他們已知的腸道細(xì)菌名單。因此研究團(tuán)隊(duì)決定采用一種新方法，與各種計(jì)算方法相結(jié)合，試圖繪制出更全面的人類微生物組圖譜。

研究第一作者Alexandre Almeida說(shuō)：“計(jì)算方法使得我們能夠了解很多定植于人體腸道中的細(xì)菌類型，包括它們是如何進(jìn)化的，及其在微生物組環(huán)境中可能發(fā)揮的作用?！?/p>

打造“穩(wěn)固的藍(lán)圖”

Almeida解釋說(shuō)：“在這項(xiàng)研究中，我們利用了最全面的胃腸道細(xì)菌公共數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)識(shí)別以前從未見(jiàn)過(guò)的細(xì)菌種類。我們使用的分析方法是高度可復(fù)制的，可以在未來(lái)被應(yīng)用于更大型的、更多樣化的數(shù)據(jù)集，從而取得進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)?！?/p>

在未來(lái)，研究人員希望，這種類似的研究將進(jìn)一步幫助他們理解人體腸道，有助于開(kāi)發(fā)出治療各種疾病更好的療法。

該研究的共同作者、Wellcome Sanger研究所的Trevor Lawley說(shuō)：“像這樣的研究正在幫助我們創(chuàng)建所謂的人類腸道藍(lán)圖，在未來(lái)，它可以幫助我們更好地了解人類健康和疾病，甚至可以指導(dǎo)胃腸道疾病的診斷和治療。”

與此同時(shí)，該團(tuán)隊(duì)指出，這項(xiàng)研究讓他們更加意識(shí)到在腸道細(xì)菌的研究方面還存在很大差距。他們強(qiáng)調(diào)，除了居住在歐洲和北美洲的細(xì)菌外，他們對(duì)其他地域人體腸道細(xì)菌種類了解得相對(duì)較少。

Finn說(shuō)：“我們?cè)跉W洲和北美人口的數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)現(xiàn)了很多相同的細(xì)菌類型。然而，我們?cè)谶@項(xiàng)研究中獲得的少數(shù)南美和非洲的數(shù)據(jù)集顯示，在以前的種群中不存在顯著的多樣性?！?/p>

Finn補(bǔ)充說(shuō)：“這表明，如果我們想對(duì)人體腸道的構(gòu)成有一個(gè)真正全面的了解，那么從代表性不足的人群中收集數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的?！?/p>

他呼吁研究人員繼續(xù)關(guān)注更加多樣化的人群。

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