2017年12月19日，國際學(xué)術(shù)權(quán)威刊物自然出版集團(tuán)旗下子刊《Nature Communication》雜志在線發(fā)表了美國加州大學(xué)Mignon L. Loh研究組的一篇研究論文，論文利用表觀遺傳學(xué)揭示惡性兒童白血病患者的差異。同期的另一篇文章鑒定出了幼年型粒-單核細(xì)胞白血病的三種新亞組(JMML)，它們可以預(yù)測病人結(jié)局，包括最有可能發(fā)生疾病自行消退的病人。 幼年型粒-單核細(xì)胞白血病(JMML)是一種惡性兒童癌癥，治療手段有限。目前的JMML臨床和遺傳標(biāo)記沒有解釋與該疾病相關(guān)的不同臨床結(jié)果。DNA甲基化在該疾病中扮演著重要角色。兩項(xiàng)獨(dú)立研究表明，這一表觀遺傳標(biāo)記或有助于解釋不同JMML病人的結(jié)果差異。 Christoph Plass、Daniel Lipka及同事分析了167例JMML樣本的DNA甲基化模式和突變情況，發(fā)現(xiàn)了三個(gè)甲基化水平各不一樣(高、中、低)的亞組。甲基化水平高的病人，臨床結(jié)果差;甲基化水平低的病人，預(yù)后良好;所有三組的突變情況都不一樣，表明在JMML病人中，DNA甲基化機(jī)制的激活與突變模式存在關(guān)聯(lián)。Elliot Stieglitz、Mignon Loh及同事研究了39名病人的DNA甲基化，獨(dú)立鑒定出三個(gè)DNA甲基化亞組，其中高甲基化水平與不良臨床結(jié)果相關(guān)，而低甲基化水平與良好預(yù)后相關(guān);他們在另外40名病人身上驗(yàn)證了這一點(diǎn)。 該研究為根據(jù)DNA甲基化劃分不同JMML患者奠定了基礎(chǔ)，有助于我們進(jìn)一步了解JMML的基礎(chǔ)生物學(xué)機(jī)制。

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原文摘要：

Juvenile myelomonocytic leukemia (JMML) is a myeloproliferative disorder of childhood caused by mutations in the Ras pathway. Outcomes in JMML vary markedly from spontaneous resolution to rapid relapse after hematopoietic stem cell transplantation. Here, we hypothesized that DNA methylation patterns would help predict disease outcome and therefore performed genome-wide DNA methylation profiling in a cohort of 39 patients. Unsupervised hierarchical clustering identifies three clusters of patients. importantly, these clusters differ significantly in terms of 4-year event-free survival, with the lowest methylation cluster having the highest rates of survival. These findings were validated in an independent cohort of 40 patients. Notably, all but one of 14 patients experiencing spontaneous resolution cluster together and closer to 22 healthy controls than to other JMML cases. Thus, we show that DNA methylation patterns in JMML are predictive of outcome and can identify the patients most likely to experience spontaneous resolution.