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      Nature | 末端炔基氨基酸生物合成通路的發(fā)現(xiàn)

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-03-22

            生物正交反應(yīng)通過使用生物體內(nèi)缺乏的反應(yīng)功能團,利用它們之間專一性反應(yīng)實現(xiàn)選擇性地原位標(biāo)記。但是許多原本被認為生物體內(nèi)不存在的官能團,例如氰基,烯基,炔基等逐漸在植物、真菌和微生物中被發(fā)現(xiàn)。本文報道了一條獨特的細胞通路,可以產(chǎn)生末端連有炔基的氨基酸衍生物,該通路可用于非天然氨基酸的原位標(biāo)記。

           首先作者基于對產(chǎn)生β-炔基絲氨酸的兩種菌S. cattleya和Streptomyces catenulae和其它不產(chǎn)生該氨基酸的26種對照組Streptomyce spp.進行基因簇序列比較,發(fā)現(xiàn)四種獨特的基因簇,并進行功能預(yù)測分析,猜測βes基因簇可能是目標(biāo)基因簇。接下來,作者將該基因簇內(nèi)的6個蛋白基因(βesA-E)逐一敲除并檢驗發(fā)現(xiàn)β-炔基絲氨酸和其前體β-炔基丙氨酸含量發(fā)生變化,從而驗證了該猜想。

            在確定基因簇后,作者通過使用非靶標(biāo)比較代謝組學(xué)檢測besA-E各基因敲除后的代謝成分變化,結(jié)合蛋白體外純化的in vitro檢測,最終確定如圖所示的代謝途徑。由圖可知,賴氨酸由BesD催化在4位發(fā)生氯取代反應(yīng),經(jīng)BesC催化,發(fā)生非典型的甲醛氨基消除反應(yīng),再經(jīng)過BesB催化消去氯代后生成β-炔基丙氨酸,在經(jīng)過BesA、BesE催化等反應(yīng)后生成β-炔基絲氨酸。

           作者將該體系與非天然氨基酸插入偶聯(lián),通過在同一E.Coil中表達BesB、C、D(產(chǎn)生β-炔基丙氨酸)和PraRS、GloEL-GroES(非天然氨基酸插入)從而實現(xiàn)了在蛋白質(zhì)組中原位β-炔基丙氨酸的插入。

            綜上,作者揭示了一條生物體內(nèi)合成末端炔基氨基酸衍生物的生物途徑,并將其應(yīng)用在非天然氨基酸原位表達插入體系中。

      本文作者:YS

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