1. RNA制備的關鍵是要抑制細胞中的RNA分解酶和防止所用器具及試劑中的RNA分解酶的污染。EP管及Tip頭都要用0.1%處理(0.1% DEPC浸泡過夜后高壓蒸氣滅菌)。用于RNA實驗的試劑須使用DEPC水處理滅菌后的玻璃容器盛裝使用的無菌水須用0.1%的DEPC處理后再進行高溫高壓滅菌。最好在超凈臺內操作。 

2、提取時操作帶一次性手套、口罩等小心、細致、晃動及每次移液要輕在操作過程中避免講話等。這樣做的唯一目的就是兩個：一是小心RNAse的污染降解RNA二是動作過度暴力破壞RNA的完整性。 

3、電泳液需新鮮配制。電泳槽和模具需預先進行處理。 

4. 一般RNA電泳應該是做甲醛變性電泳但是一般的瓊脂糖電泳也可以需要上樣量稍微大些并且跑電泳的時間越短越好(這樣也是為了減少外界RNAse對RNA的降解)跑完電泳立刻觀察。 

5、需要用EB染色，Genefinder染色效果不好，其對雙鏈DNA的效果好。 

6、器材的處理盡量使用一次性塑料器皿，若用玻璃器皿，應在使用前按下列方法進行處理。 

（1）用0.1% DEPC焦碳酸二乙酯水溶液在37℃下處理12小時。 

（2）然后在120℃下高壓滅菌30分鐘以除去殘留的DEPC。RNA實驗用的器具建議專門使用，不要用于其它實驗。