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作者：曾阿牛 轉載請注明：解螺旋·臨床醫(yī)生科研成長平臺 提到熱圖，大家可以第一個想到的R語言，有的小伙伴就說了我一看到代碼就頭大，有沒有別的辦法？上次跟大家分享了Graphpad prism繪制柱狀圖與散點圖共存圖，其實Graphpad Prism的功能遠不止這些，它駕馭起熱圖也是妥妥的。 1 使用Graphpad Prism繪制熱圖 使用Graphpad Prism 7.0（win7，64位系統(tǒng)）給大家分享如何繪制熱圖。原始數(shù)據(jù)（不同基因在不同器官中的表達情況）如下： 步驟 1、打開GraphPad Prism 7.0軟件，New table ＆graph，選擇Grouped 選擇Enter and plot a signle Y value for each point,Create 2、輸入數(shù)據(jù)： 在Data Table中輸入數(shù)據(jù)，GoupA——F是不同基因在不同組織（Heart、Lung、liver、Brain……）中的表達情況： 3、進入Graphs下可以看見步驟2輸入的數(shù)據(jù)Data1的圖形，將進入Change Graph Type界面，Graph family為Grouped不需改動，選擇Heat Map，在下面有四種熱圖的配色可以進行選擇和預覽，在此以選定第一個為例，點擊OK 4、可以看見繪制熱圖的基本效果如下如圖： 此時橫坐標顯示為ABCDEF,縱坐標顯示123456，點擊橫坐標，進入Format Graph，Titles＆Labels界面： 將Row Lables和Column Lables分別選擇為對應的Row titles和Column titles，點擊OK。 得到以下圖片： 我們可以發(fā)現(xiàn)Gene1-6相鄰且太過緊密，我們可以進行如下調節(jié)，重新點擊點擊橫坐標，進入Format Graph，Titles＆Labels界面，將Column Labels中的Column titles的角度由水平改為Angled（45 degrees），點擊OK。
最終效果如下，導出圖片即可。
問題環(huán)節(jié) 問題1：如何更改熱圖顏色配置？ 雙擊熱圖進入進入Format Graph界面，可以看見此時的顏色配置為Colormap
Colormap下除了Rainbow還有以下幾種配色方式可以進行選擇。
Single gradient，從A顏色到B顏色，一般為從最小值到最大值。
Double gradient，從A顏色到B顏色再到C顏色。
Grayscale顯示為灰度效果。
Categorical不同范圍的值顯示為不同顏色：
問題2：如何顯示下圖的邊界：
雙擊熱圖，進入Format Graph界面，將Cell borders勾上，顏色可以自行選擇，線寬為1/2pt，點擊OK即可。
2 Excel制作熱圖 除了Graphpad Prism，其實Excel也可以對付 heatmap，使用Excel 2010或以上版本，上菜！ 步驟 原始數(shù)據(jù)如下：
1、在Excel中選中要做熱圖的全部數(shù)據(jù) (只選擇數(shù)值部分)，然后在開始菜單中，執(zhí)行以下操作：“條件格式”--“色階”--“其他規(guī)則”
2、選中“其他規(guī)則”后，彈出如下的窗口。默認為“雙色刻度”，可改為“三色刻度”
3、選中三色刻度后，設置最小值、中間值、最大值的類型和顏色
注意：此處顏色選擇也可以在第一步色階里直接選擇自己喜歡的。另外，建議將類型都改為“數(shù)字”，好處是可以自定義最小值、中間值、最大值的數(shù)值大小。當然你的數(shù)據(jù)應在你設置的最小值，最高值范圍內(nèi)。例如此處數(shù)據(jù)范圍84-116，故可設置最小值為80，最大值120，中間值可設為兩者的中位數(shù)100。
此外，將預覽后面的色條截取到Excel表格中。 截取效果如下：
4、上圖中。若覺得色條長度過長，可以在選中色條進行調整，選中后會出現(xiàn)小方塊，則可以調節(jié)色條的寬度、長度。
5、此外，為了美觀，可以將Excel中的邊框去除。 選中目標—鼠標右鍵—選中“設置單元格格式”—彈出對話框—選中 “填充”—選中背景顏色為無色即可。例如上面例子:
同理，將行的表格邊框去除，最終，得到如上效果。 6、可見，若覺得上面的數(shù)字放在上面不美觀，可以進行如下操作去除數(shù)字。 選中數(shù)字目標區(qū)域—鼠標右鍵—設置單元格格式—選中“數(shù)字”—選中分類中的“自定義”—在類型輸入兩個分號（；；）--點擊確定 圖解繼續(xù)用上面例子說明如下：
7、最后，可得到如下效果圖，到此熱圖的制作就完成了。（另外，可根據(jù)具體情況調節(jié)行高、列高）
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