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      針對(duì)FFPE樣本的NGS檢測解決方案 | 知識(shí)分享

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-04-08

      引言

      疾病研究和病理分析中,由于通過手術(shù)、穿刺等方式獲取的組織樣本離開機(jī)體后,很快就會(huì)發(fā)生死亡及組織腐敗,喪失原有正常的結(jié)構(gòu)和功能。因此,離體的組織要經(jīng)固定、石蠟包埋、切片及染色等步驟以避免細(xì)胞組織死亡,進(jìn)而進(jìn)行形態(tài)結(jié)構(gòu)分析及免疫或分子分析等。

      福爾馬林固定石蠟包埋( Formalin Fixed andParaffin Embedde,F(xiàn)FPE)成為病理學(xué),法醫(yī)病理學(xué)等進(jìn)行樣本保存的最主要手段。對(duì)組織樣本進(jìn)行FFPE的保存,有助于研究人員更加全面地了解經(jīng)多年保存后的病理標(biāo)本中所包含的遺傳機(jī)制和病理成因。目前,全球約有2-4億FFPE組織樣本,這些組織樣本已經(jīng)是疾病診斷和科學(xué)研究的最為寶貴的的生物學(xué)資源之一。

      隨著基因組學(xué)檢測技術(shù)的快速發(fā)展,尤其新一代測序技術(shù)(NGS)的飛速發(fā)展,在細(xì)胞分子水平提供了前所未有的檢測能力,研究人員可以使用這一技術(shù)手段,重新開啟FFPE樣本寶藏的大門,尋找疾病與基因關(guān)系,進(jìn)而去解釋疾病的未解之謎。然而,在FFPE組織標(biāo)本的制備和貯存過程中,組織經(jīng)福爾馬林固定、石蠟包埋后很容易引起DNA的交聯(lián)和降解,研究人員很難獲得足量的高質(zhì)量的DNA樣本,這也對(duì)新的檢測技術(shù)提出新的要求。

      本期研發(fā)部同事針對(duì)FFPE樣本核酸易降解、組織消化徹底極易影響DNA得率、脫蠟試劑殘留干擾后續(xù)實(shí)驗(yàn)等情況,做了詳細(xì)文獻(xiàn)分享,歡迎大家一起探討學(xué)習(xí)!

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      參考文獻(xiàn)

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