永歷帝在馬吉翔挾持下，從騰越逃入緬甸，從此與李定國、白文選失去聯(lián)系。三月，李定國、白文選相會于木邦（緬甸新維），商議今后去向。李定國認(rèn)為：“緬甸地區(qū)貧苦，大軍進(jìn)入緬甸日后必回發(fā)生禍亂，況且緬甸只是但是你我二人，但是皇帝單獨(dú)去那里說不定到安全了，” 白文選則說：”現(xiàn)在內(nèi)陸都已經(jīng)被清寇占領(lǐng)，繼續(xù)在內(nèi)陸會危險，不如，我隨皇帝去緬甸，你主持外部軍務(wù)大事。“ 兩人意見不和，便各自行動。

磨盤戰(zhàn)役后，李定國余眾不過數(shù)千，勢力窘迫。不久，賀九儀從廣南率萬人來會合，祁三升、魏勇等均率部投歸，軍勢稍振。李定國將大營移孟璉（云南瀾滄），多造印敕，遍結(jié)土司 ，號召共同抗清。沅江土司那嵩起兵響應(yīng)。李定國部堅(jiān)持?jǐn)?shù)月，被清軍攻破，又移營孟艮，招安頭人，耕種納糧如郡縣例 。

吳三桂見無法撲滅大西軍，又采取招降措施，一時農(nóng)民軍中不堅(jiān)定分子紛紛投降。公元1660年（清順治十七年、明永歷十四年）三月，吳三桂用賀九儀妻子勸降，賀九儀剛要去投降竟被李定國殺了 ，從此無人敢言降字。

李定國曾連續(xù)上疏三十余封給永歷帝都石沉大海。直到七月，白文選強(qiáng)攻緬都阿瓦失利回來，白、李才了解真相，原來緬甸扣住了永歷帝，二人決定攻緬搶出永歷帝。九月，兩人分別入緬。至十一月，定國大敗緬軍，提出送還永歷帝，在退兵的的條件。 緬則回答：”你們要攻城，我也不怕，你們大軍來這里，水土不服，將士會的病而死?！?第二年二月，白、李又合兵入緬，緬集眾十五萬，巨象千余頭來戰(zhàn)。二人奮力苦戰(zhàn)，大敗緬軍，渡錫箔江臨金沙江窺緬城，緬甸仍不交出永歷帝。李定國只得派兵造船渡江，五月又被緬兵搗毀船廠。李定國大怒，圍困緬城，不料軍中老幼累累，軍饑疫作，死亡相繼 ，不得已移軍亦渺賴山下。八月，兩人又分兵攻緬，但出師不利，十六舟有五舟被擊沉。在緬甸他們亦得知吳三桂已大舉攻緬，緬殺害永歷從官四十余人，白文選部情緒低落。是月中旬，張國有、趙得勝劫持白文選欲降清，離開李定國。李定國子嗣興準(zhǔn)備堵截，李定國不忍雙方自相殘殺，命放還，率本部獨(dú)進(jìn)洞烏。

十二月，李定國又準(zhǔn)備再度攻緬，忽聞緬王已獻(xiàn)永歷帝于吳三桂憤懣欲絕說道：‘勢既不敵，追無能為’” 。移營景線。但到公元1662年（清康熙元年、明永歷十六年）四月，他又抵勐臘，遣官入車禮（西雙版納）借兵，企圖東山再起。五月，禮部侍郎江國泰說服暹羅（泰國）與定國聯(lián)姻，幫助象馬，恢復(fù)云南 。蜀人馬九功也從古剌返回，云南已集四千人，愿為掎角之勢 。正當(dāng)李定國欲圖大舉，不幸軍中瘟疫流行，人馬病死甚多。李定國修表告天，祈求說道：“如果大勢已去，希望老天讓我李定國一人去死，不要再連累軍民?！?/p>

六月十一日，李定國正逢四十二歲生日，突然發(fā)病，接著又傳來永歷帝于四月初八被吳三桂絞殺的消息。李定國慟哭并命人為永歷帝發(fā)喪，全軍將士穿白衣 ，李定國披發(fā)徒跣，號誦搶地，兩目皆血淚，大哭道：“我對不起大明，也對不起皇帝，我該怎么面對天下。“ 六月二十七日夜，李定國死于勐臘，臨終前還囑咐兒子及部下：“寧可死到荒郊野外，也不可投降?！?/p>

李定國死后，部下有數(shù)千人不降，聚于阿瓦河?xùn)|百里，稱為“桂家” 。勐臘各族人民亦奉李定國為神，過晉王墓均膜拜。并于后山復(fù)建“漢王廟”，每年春節(jié)進(jìn)行隆重祭祀 。