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      碧云天講堂:Western Blot全面解決方案第一講——樣品制備

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-04-13


      Western Blot 又稱為蛋白質(zhì)印跡,是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的基于抗原抗體之間特異免疫反應(yīng)的一種定量或定性檢測蛋白的實驗方法。 

      其基本原理為:聚丙烯酰胺凝膠電泳將不同分子量的蛋白質(zhì)樣品分離,分離后的蛋白被轉(zhuǎn)移到固相支撐物(雜交膜)上,一抗特異性識別目標蛋白,通過HRP、AP、生物素、地高辛或者熒光探針等標記的二抗識別一抗,最終通過顯色、熒光或者化學(xué)發(fā)光等方法將目標蛋白可視化,從而對目標蛋白進行定性和定量分析。

      Western Blot實驗原理示意圖

      良好的開始是成功的一半,充分裂解并保存良好的優(yōu)質(zhì)的蛋白樣品對 Western Blot 實驗至關(guān)重要。下面我們將從蛋白樣品制備的方法和試劑選擇上給大家一些建議。

      一 .

      了解目標蛋白

      目標蛋白因其物種來源和組織特異性的不同,在種類和性質(zhì)上有很大差異,因此并沒有一種制備方法可以適用于所有蛋白的提取。這就需要我們進行全面的分析后才能選擇最合適的蛋白制備方法。

      首先要了解:樣品是來自什么物種?目標蛋白定位在哪種組織或細胞器?是可溶蛋白還是不可溶蛋白?是高豐度蛋白還是低豐度蛋白?在制備時需要保持蛋白的天然活性,還是需要變性蛋白?

      其次要知道:哪種方法或試劑能夠防止蛋白降解、聚集、沉淀、變性、去修飾?哪種方法能夠去除高豐度蛋白干擾,富集低豐度蛋白?哪種能去除核酸、多糖、脂肪等雜質(zhì)?哪種方法能在有限的實驗條件下,簡便快速地獲得高純度且完整性好的蛋白?

      比如說,有些蛋白只在特定的細胞或細胞器中以較低豐度分布,這時候可能需要分離特定的細胞或細胞器,以達到獲得的蛋白樣品可滿足WB檢測的下限;還有的蛋白在常規(guī)裂解液中易聚集或沉淀,尤其是一些多次跨膜的蛋白或核內(nèi)蛋白,這種情況下就需要大家查閱參考文獻來了解目標蛋白的性質(zhì)和常用的提取方法。

      對于特定組分的分離,可選用碧云天亞細胞組分分離試劑盒,相關(guān)產(chǎn)品如下:

      產(chǎn)品編號

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品包裝

      P0027

      細胞核蛋白與細胞漿蛋白抽提試劑盒

      50次

      P0028

      細胞核蛋白與細胞漿蛋白抽提試劑盒

      100次

      P0033

      細胞膜蛋白與細胞漿蛋白提取試劑盒

      100次

      C3601

      細胞線粒體分離試劑盒

      50-100次

      C3606

      組織線粒體分離試劑盒

      50-100次

      碧云天亞細胞組分分離試劑

      二 .

      裂解液的選擇

      蛋白樣品制備,首先要選擇合適的裂解液。一般裂解液包含以下幾個組分: 

      1. 緩沖系統(tǒng):裂解液pH過高或過低都可能使蛋白質(zhì)變性析出或水解,因此通常采用近似生理pH的buffer來作緩沖體系。Tris-HCl緩沖液因其緩沖能力強,不容易與其它離子形成不溶物,且與整個電泳系統(tǒng)兼容性好,因此是裂解的首選緩沖液。 

      2. 鹽離子濃度:通常大家習(xí)慣以生理鹽濃度作為裂解液的鹽離子濃度。在提胞漿蛋白等易溶組分時,也有通過低鹽而實現(xiàn)低滲,從而使細胞脹破以實現(xiàn)質(zhì)膜分離的,這種情況下一般使用不超過50mM的NaCl。當(dāng)鹽離子濃度過高時,部分蛋白可能會因鹽析而出現(xiàn)沉淀, 此外過高的離子濃度會導(dǎo)致泳道內(nèi)局部電流過大,容易跑出笑臉狀條帶。實際過程中即使有少數(shù)蛋白可能需要高鹽提取的,也會借助透析等方法除去可能產(chǎn)生干擾的鹽分,最終NaCl濃度一般不能高于500mM。 

      3. 變性劑:常用的變性劑有兩類,一類是以尿素或硫脲為代表的變性劑,另一類則是各種表面活性劑(俗稱去垢劑)。變性劑的作用主要是為了使蛋白變性溶解,在膜蛋白和包涵體蛋白提取時經(jīng)常會加入尿素助溶。 

      4. 蛋白酶、去修飾酶抑制劑:組織或細胞內(nèi)通常含有大量的蛋白酶和去修飾酶,由于細胞在裂解過程中會釋放出多種內(nèi)源性的蛋白酶、磷酸酶、去乙?;傅?,容易導(dǎo)致目標蛋白降解或去修飾,從而影響后續(xù)的蛋白檢測。所以在裂解時還需加入一些酶抑制劑。

      常見的蛋白酶抑制劑有:PMSF、Aprotinin、Leupeptin、 Pepstatin,AEBSF-HCl等,其中PMSF對多種不同活性中心的蛋白酶都有極好的抑制作用而且效率高,因此基本是必加的試劑

      另外,做磷酸化蛋白的Western blot時,還需要加入磷酸酶抑制劑,避免磷酸化形式的蛋白發(fā)生去磷酸化。類似地,檢測乙酰化蛋白的時候還需要加入去乙?;敢种苿?nbsp;

      碧云天生產(chǎn)多種多樣的蛋白樣品制備用酶抑制劑產(chǎn)品,以下是碧云天不同類型的蛋白酶、磷酸酶、去乙?;敢种苿┗旌衔?/strong>:

      產(chǎn)品編號

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品包裝

      P1005

      蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 100X)

      1ml

      P1006

      蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 100X)

      5ml

      P1008

      蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

      1ml

      P1009

      蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

      5ml

      P1010

      蛋白酶抑制劑混合物(哺乳動物樣品抽提用, 100X)

      1ml

      P1011

      蛋白酶抑制劑混合物(哺乳動物樣品抽提用, 100X)

      5ml

      P1015

      蛋白酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 100X)

      1ml

      P1016

      蛋白酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 100X)

      5ml

      P1020

      蛋白酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 100X)

      1ml

      P1021

      蛋白酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 100X)

      5ml

      P1025

      蛋白酶抑制劑混合物(細菌抽提用, 100X)

      1ml

      P1026

      蛋白酶抑制劑混合物(細菌抽提用, 100X)

      5ml

      P1030

      蛋白酶抑制劑混合物(His-Tag蛋白純化用, 100X)

      1ml

      P1031

      蛋白酶抑制劑混合物(His-Tag蛋白純化用, 100X)

      5ml

      P1045

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 50X)

      各2ml

      P1046

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 50X)

      各10ml

      P1048

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

      各1ml

      P1049

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

      各5ml

      P1050

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(哺乳動物樣品抽提用, 50X)

      各2ml

      P1051

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(哺乳動物樣品抽提用, 50X)

      各10ml

      P1055

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 50X)

      各2ml

      P1056

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 50X)

      各10ml

      P1060

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 50X)

      各2ml

      P1061

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 50X)

      各10ml

      P1065

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(細菌抽提用, 50X)

      各2ml

      P1066

      蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(細菌抽提用, 50X)

      各10ml

      P1081

      磷酸酶抑制劑混合物A (50X)

      2ml

      P1082

      磷酸酶抑制劑混合物A (50X)

      10ml

      P1086

      磷酸酶抑制劑混合物B (50X)

      2ml

      P1087

      磷酸酶抑制劑混合物B (50X)

      10ml

      P1091

      磷酸酶抑制劑混合物C (50X)

      2ml

      P1092

      磷酸酶抑制劑混合物C (50X)

      10ml

      P1096

      磷酸酶抑制劑混合物D (50X)

      2ml

      P1097

      磷酸酶抑制劑混合物D (50X)

      10ml

      P1112

      去乙酰化酶抑制劑混合物(100X)

      1ml

      P1113

      去乙?;敢种苿┗旌衔?100X)

      5ml

      ST506

      PMSF (100mM)

      10ml

      不同類型的蛋白酶、磷酸酶、去乙酰化酶抑制劑混合物

      5. 還原劑:許多蛋白天然條件下存在二硫鍵而形成多個分子的聚合體,另有少數(shù)蛋白在制樣的過程中也會自發(fā)形成二硫鍵,在裂解液中引入還原劑可以有效地還原二硫鍵,常用的還原劑有B-巰基乙醇,DTT等。常見的上樣緩沖液中會含有DTT。

      裂解液的選擇至關(guān)重要,碧云天生產(chǎn)適用于多種組織和細胞的裂解液,以下是碧云天裂解液相關(guān)產(chǎn)品與比較:

      向右滑動查看

      三 .

      蛋白樣品制備操作

      使用裂解液對細胞/組織進行裂解,以釋放蛋白質(zhì)等細胞成分

      3.1、細胞蛋白樣品制備

      懸浮細胞:可直接離心收集,并用PBS等洗滌1-2次去除培養(yǎng)液中的血清和雜質(zhì)便可以裂解。

      貼壁細胞:吸凈培養(yǎng)液后,直接加入裂解液裂解,或者在吸凈培養(yǎng)液后用PBS等洗滌1-2次后,加入裂解液裂解,收集細胞裂解液時可以根據(jù)具體情況使用細胞鏟和細胞刮進行適當(dāng)?shù)妮o助。也可以在胰酶消化后參考懸浮細胞的方式裂解,但很多蛋白都可以被胰酶消化,并在WB檢測時可能會檢測到消化出來的短片段。根據(jù)實驗需要,也可用細胞刮或細胞鏟刮下或鏟下細胞,或用移液器吸取PBS將細胞從容器壁上吹打下來,再像懸浮細胞那樣洗滌后再裂解。

      不管是懸浮細胞,還是貼壁細胞,裂解操作都是相同的:加完裂解液后,將細胞置于冰上,使其充分裂解。對于裂解不充分的細胞也可以再進行冰浴超聲。裂解之后離心取上清進行后續(xù)的蛋白濃度測定,加上樣緩沖液煮沸等操作。

      貼壁細胞通常推薦吸除培養(yǎng)液后直接加入裂解液裂解,因為此時細胞基本上是單層的,可以充分接觸裂解液,裂解更快快速和充分。

      有一些研究人員喜歡使用1XSDS-PAGE上樣緩沖液直接裂解細胞。這樣操作的優(yōu)勢是快速便捷,缺點是后續(xù)不方便測定蛋白濃度以校準每個上樣孔的蛋白量。

      3.2、組織蛋白樣品制備

      組織蛋白提取則相對較復(fù)雜,首先應(yīng)設(shè)法除去血液、脂肪等非目標組織。在制備脾臟、心臟和胎盤等富含血液的組織時,尤其要洗凈血液,防止后續(xù)因內(nèi)源IgG產(chǎn)生干擾。可用PBS或生理鹽水(加PMSF)洗滌2-3次去除組織中血液。也可以根據(jù)具體的實驗需要,在小鼠等實驗動物心臟用生理鹽水等灌流至肝臟和四肢顏色發(fā)白時,再采集特定的組織樣品。采集好的組織樣品可以立即進行后續(xù)的處理,也可以在低溫冷凍保存待后續(xù)處理。

      取好的組織樣品需要進行破碎處理,否則難以裂解充分處理。實驗室常用的破碎方法有勻漿法、研磨法等。最常見的比較便捷的方法是按照一定比例加入裂解液,用玻璃勻漿器或者適當(dāng)?shù)碾妱觿驖{設(shè)備進行勻漿處理;最穩(wěn)妥可靠的方法是把組織樣品液氮冷凍后再研缽內(nèi)研磨成粉末,然后再加入裂解液裂解。組織樣品充分裂解后,離心取上清進行后續(xù)操作。

      勻漿法和液氮研磨法


      四 .

      操作過程中的注意事項

      注意事項

      防止降解  

      前面已提到,一些組織和細胞內(nèi)經(jīng)常含有蛋白酶,在提取蛋白的過程中,有可能剪切目標蛋白,所以我們可以從以下幾個方面來盡量避免蛋白被降解:

      1、使用蛋白酶抑制劑抑制細胞或組織中釋放的蛋白酶活性。

      2、低溫操作。提取蛋白時,避開蛋白酶的最適活性溫度。所有的步驟都可在低溫下完成,所有的試劑都需預(yù)冷,以降低蛋白酶活性,防止蛋白降解。

      3、加快提取速度,一次不要處理過多的樣品

      避免雜質(zhì)的干擾 

      電在蛋白提取中經(jīng)常可能會混入一些雜質(zhì),后期影響電泳分離效果,常見雜質(zhì)有: 

      1、器材污染  在提取蛋白時盡可能使用潔凈器具,防止樣本被污染。尤其在處理組織樣本時,一些反復(fù)用的器具如勻漿器、研磨杵、研缽等需保持干凈。 

      2、核酸或脂類的干擾 核酸和脂類都可能與蛋白質(zhì)結(jié)合,如果制備的樣品中含有大量的脂類或核酸,則有可能影響目的蛋白泳動速率,或者可能形成大的復(fù)合物而不能進入濃縮膠。核酸通??梢酝ㄟ^超聲處理或者使用1ml注射器(帶針頭)反復(fù)抽吸的方法打斷成小片段。在制備脂肪組織或者脂肪肝組織樣品時,在制樣后低溫離心或?qū)悠贩胖糜诘蜏兀蟛糠钟椭瑫≡谝好娌⒑芸赡芙Y(jié)凍,此時設(shè)法去除油脂或者吸取相應(yīng)的水相液體即可有效減小脂類的干擾。

      五 .

      蛋白濃度測定

      蛋白提取完成后,可以用BCA法或Bradford法測定濃度,以確保上樣量穩(wěn)定可控,也可以通過SDS-PAGE后考馬斯亮藍法染膠或者在轉(zhuǎn)膜后通過麗春紅染色等判斷每個孔的上樣量是否一致,以及蛋白是否裂解充分、有無降解等。

      為了保證每個泳道的上樣量一致,經(jīng)常需要將高濃度的樣品調(diào)低濃度或減少用量,或?qū)⒌蜐舛鹊臉颖緷饪s或加大用量。調(diào)低樣本濃度一般可直接用裂解液稀釋。濃縮樣本則建議進行超濾操作,以保證操作前后離子濃度變化不大。

      碧云天蛋白濃度測定相關(guān)產(chǎn)品

      產(chǎn)品編號

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品包裝

      P0006

      Bradford蛋白濃度測定試劑盒

      1000次

      P0006C

      Bradford蛋白濃度測定試劑盒(去垢劑兼容型)

      800次

      P0007

      蛋白標準(5mg/ml BSA)

      1ml

      P0009

      BCA蛋白濃度測定試劑盒(增強型)

      5000次

      P0010

      BCA蛋白濃度測定試劑盒(增強型)

      500次

      P0010S

      BCA蛋白濃度測定試劑盒(增強型)

      200次

      P0011

      BCA蛋白濃度測定試劑盒

      5000次

      P0012

      BCA蛋白濃度測定試劑盒

      500次

      P0012S

      BCA蛋白濃度測定試劑盒

      200次

      P0017

      考馬斯亮藍快速染色液

      250ml

      P0017A

      考馬斯亮藍染色試劑盒(常規(guī)法)

      1盒

      P0017B

      考馬斯亮藍染色液(常規(guī)法)

      250ml

      P0017C

      考馬斯亮藍染色脫色液(常規(guī)法)

      500ml

      P0017F

      BeyoBlue?考馬斯亮藍超快染色液

      250ml

      P0017S

      快速銀染試劑盒

      25次

      ST030

      Coomassie brilliant blue G250

      5g

      ST031

      Coomassie brilliant blue R250

      5g

      P0022

      麗春紅染色液

      120ml

      蛋白濃度分析測定相關(guān)產(chǎn)品

      樣品制備的要點我們就介紹到這里最后附上一個大神總結(jié)的口訣

      免疫印跡七步走,蛋白提取是重頭。

      緩沖體系要得當(dāng),中性略堿是主流。

      離子濃度莫極端,鉀鹽切記謹慎投。

      尿素硫脲有奇效,去垢劑需更深究。

      防止降解頗重要,抑制劑要正確謀。

      PMSF作用廣,EDTA性價優(yōu)。

      切莫漏加還原劑,巰基分子破二硫。

      RIPA buffer是首選,特殊提取細運籌。

      裂解細胞無他巧,勿借胰酶把懶偷。

      組織裂解先除血,千方百計研磨透。

      全程低溫要把握,快速操作記心頭。

      避免雜質(zhì)生干擾,勿引蛋白核酸油。

      提完濃度要測準,跑膠染色見良莠。

      常帶內(nèi)參顯嚴謹,結(jié)果明朗不發(fā)愁。

      勤學(xué)苦練基本功,他日名聲傳五洲。

      非常感謝您對碧云天的關(guān)注和支持,

      碧云天愿與您攜手

      為中國生命科學(xué)事業(yè)的騰飛貢獻一份力量!

      電話:400-1683301,800-8283301  

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