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ceRNA是真核生物體內(nèi)存在的一種具有相同miRNA反應(yīng)結(jié)合元件的多個(gè)RNA分子競(jìng)爭(zhēng)性的與miRNA結(jié)合，從而形成的一種相互調(diào)節(jié)機(jī)制。

由于miRNA調(diào)控的RNA（可以是mRNA、lncRNA或者circRNA）非常的多，而一個(gè)RNA又受多個(gè)miRNA調(diào)控，這就使得ceRNA調(diào)控在細(xì)胞內(nèi)非常的普遍。

今天給大家介紹通過(guò)starbase這個(gè)超好用的數(shù)據(jù)庫(kù)工具尋找ceRNA。網(wǎng)址還是http://starbase./ 哦！

通過(guò)這個(gè)工具，可以搜索mRNA-mRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)，lncRNA與lncRNA或mRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)，假基因pseudogene與lncRNA或mRNA的網(wǎng)絡(luò)。

與前面兩期介紹的左邊的過(guò)濾欄不一樣，尋找ceRNA機(jī)制主要篩選條件是包含的miRNA數(shù)目、p或FDR值，然后就是在TCGA中的數(shù)據(jù)支持情況。

需要說(shuō)明的是，盡管在starbase中ceRNA網(wǎng)絡(luò)有3種尋找形式，但展示結(jié)果的界面一樣，使用和查看的方法也就一樣了。

以“HOTAIR”為例，看看lncRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)如何。

如果你現(xiàn)在手上有正在做的基因，如果想看看有沒(méi)有ceRNA機(jī)制可以挖掘，可以試試這個(gè)功能。輸入基因，然后在結(jié)果內(nèi)再搜索！

點(diǎn)擊“HitMiRnum”可以查看包含的miRNA家族及其包含的具體miRNA。

點(diǎn)擊“Pan-Cancer”可以查看該ceRNA在TCGA 32個(gè)腫瘤中的相關(guān)性情況，并可查看

關(guān)于如何使用starBase這個(gè)工具尋找潛在的ceRNA機(jī)制就介紹到這里了，如果你對(duì)如何做實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，以及更深入的研究方法感到困惑，歡迎加入解螺旋40周體系化課程，讓解螺旋助你一臂之力！

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