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      結(jié)直腸癌靶向測序揭示APC基因的潛在預后功能

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-05-14

      近期,發(fā)表在Nature Communications 上的一項新研究結(jié)果揭示,多種基因突變會影響結(jié)直腸癌患者的生存與預后。

      莫非特癌癥研究中心、吉布斯癌癥中心等機構(gòu)的研究人員對500份結(jié)直腸癌樣本進行靶向panel測序,重點關(guān)注1300多個已知或者疑似具有致癌性的基因,進一步結(jié)合病人的生存信息后,鑒定出17個潛在致癌基因,這些基因突變的頻率與癌癥基因組圖譜(TCCA)報道的結(jié)直腸癌(CRC)腫瘤突變頻率接近。

      其中,APC基因突變對結(jié)直腸癌的預后作用尤其明顯。研究人員根據(jù)突變模式,提出了應用于CRC的APC分類系統(tǒng),其中包含了5種突變類型。

      作者在文章寫道:“我們已經(jīng)開發(fā)出一套應用于CRC預后的五類多基因突變分類系統(tǒng),其中APC基因起到了關(guān)鍵作用。我們認為除了已知的用于癌癥分類預測的BRAF、KRAS和TP53基因外,APC基因突變評估在常規(guī)的臨床癌癥預測中也非常有用。而且最終將幫助我們通過識別高風險與低風險群體,提升選取合適治療方案的效率?!?/p>

      該研究通過深圳華大的SureSelect靶向捕獲和Illumina GAIIx測序,從468個CRC樣本的1321個基因中搜尋相關(guān)的預后突變信息。同時按照Bethesda panel指南對樣本進行微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)分析。

      該研究發(fā)現(xiàn)對高不穩(wěn)定性(MSI-high)的腫瘤組織而言預后一般會較好,13%的樣本符合分析結(jié)果。這一發(fā)現(xiàn)與已有研究結(jié)果一致。但如果高不穩(wěn)定性的腫瘤中同時含有BRAF突變,會導致存活率降低。

      在微衛(wèi)星穩(wěn)定的腫瘤組織(MSS)中,研究人員發(fā)現(xiàn)了3個基因與癌癥轉(zhuǎn)移顯著相關(guān):APC、TP53和KRAS。同時含有這三種基因突變的腫瘤一般都屬于惡性腫瘤。該研究中,超過1/5的CRC樣本都發(fā)生了轉(zhuǎn)移。如果病人同時含有2個APC突變,KRAS基因突變和TP53基因突變,那么一般很難獲得較好的治療。另外,研究人員還表示,對僅含有一個APC突變的腫瘤病人而言,無論是APC突變單獨存在還是和KRAS或者TP53基因突變同時存在,會比不含有APC基因突變的病人存活時間更長。

      作者表示:“我們認識到APC基因的預后功能,將幫助我們進行更加詳細的突變分析以及更大樣本規(guī)模的研究?!?/p>

      參考文獻:A multigene mutation classification of 468 colorectal cancers reveals a prognostic role for APC. Nature Communications 7, Article number:11743 doi:10.1038/ncomms11743.

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