20種基本氨基酸中,雜環(huán)氨基酸有3種:色氨酸、組氨酸和脯氨酸。色氨酸和組氨酸都含有芳雜環(huán),但色氨酸含有苯環(huán),有很強(qiáng)的紫外吸收,所以放在芳香族氨基酸中講過(guò)了。所以今天介紹剩下的兩個(gè)雜環(huán)氨基酸:組氨酸(histidine,His)和脯氨酸(proline,Pro)。 ![]() 組氨酸的英文名histidine來(lái)自于德語(yǔ)histidin。histo在希臘語(yǔ)中是組織的意思。histo也是拉丁語(yǔ)前綴,組織或網(wǎng)的意思。很多histo開(kāi)頭的醫(yī)學(xué)生物單詞,都翻譯成“組”,例如組胺histamine,組蛋白histone,免疫組化immunohistochemistry。所以中文譯為組氨酸是順理成章的。 組氨酸可以脫羧形成組胺,組胺具有促進(jìn)平滑肌舒張、微血管擴(kuò)張、胃酸分泌等作用。所以組氨酸可以降低血壓,臨床上用于心絞痛、心功能不全等疾病的治療;也可以引起支氣管哮喘、丘疹等過(guò)敏反應(yīng),臨床用抗組胺藥物治療過(guò)敏。 ![]() 組胺 組氨酸雖然也屬于芳香族氨基酸,但它對(duì)蛋白質(zhì)在280納米的紫外吸收沒(méi)有明顯貢獻(xiàn)。因?yàn)檫溥虻奈辗逶?span style="Times New Roman39;,serif">209.1nm,在280nm有吸收,但強(qiáng)度較弱。不過(guò),如果是高濃度的組氨酸或咪唑,對(duì)紫外吸收還是有影響的。在用鎳柱純化融合蛋白的時(shí)候可以注意一下。 組氨酸的側(cè)鏈含有咪唑基,在中性條件下帶正電荷,所以是堿性氨基酸。不過(guò)它的堿性較弱,等電點(diǎn)是7.59。這是一個(gè)非常有用的特性。比如說(shuō),這使組氨酸在血液中具有較強(qiáng)的緩沖能力。組氨酸在生理?xiàng)l件下是否帶電,與周圍內(nèi)環(huán)境有很大關(guān)系。所以組氨酸經(jīng)常出現(xiàn)在酶的活性中心,起一般酸堿催化作用。咪唑基提供質(zhì)子和接受質(zhì)子的速度都很快,所以也經(jīng)常用來(lái)構(gòu)成質(zhì)子傳遞鏈。 ![]() 碳酸酐酶中的His64協(xié)助水分子解離,促進(jìn)催化過(guò)程 除了參與催化,組氨酸還能與鐵等金屬離子配位。比如血紅素與肌紅蛋白或血紅蛋白的連接,就是通過(guò)組氨酸與鐵形成配位鍵。組氨酸能與鐵或其他金屬離子形成配位化合物,還可以促進(jìn)鐵的吸收,因而可用于防治貧血。 ![]() 脯氨酸是在白明膠中首先發(fā)現(xiàn)的,學(xué)名為Pyrrolidone Carboxylic Acid(吡咯烷酮羧酸),簡(jiǎn)稱為“Proline”。中文譯為“脯氨酸”是因?yàn)榘酌髂z是用動(dòng)物皮膚、肌腱等結(jié)締組織中的膠原蛋白熬制得到的部分水解產(chǎn)物,“脯”就是肉干的意思。 脯氨酸的結(jié)構(gòu)也是很特別的。一方面,它不像色氨酸和組氨酸那樣屬于芳雜環(huán),它屬于脂肪族,所以是脂雜環(huán)。另一方面,它是基本氨基酸中唯一的亞氨基酸。換句話說(shuō),其它氨基酸都是伯胺,只有它是仲胺(氮原子與兩個(gè)碳原子相連)。這種不同使它具有一些特性,比如不參加轉(zhuǎn)氨,限制肽鏈構(gòu)象等。 ![]() 膠原蛋白的三股螺旋構(gòu)象需要脯氨酸 脯氨酸的特殊構(gòu)象對(duì)于膠原蛋白的三股螺旋是必需的,但對(duì)于a-螺旋卻是破壞者。因?yàn)楦彼岬牡优c側(cè)鏈形成了環(huán),所以Cα-N鍵不能自由旋轉(zhuǎn),無(wú)法達(dá)到a-螺旋構(gòu)象要求的二面角。因此,a-螺旋延伸到脯氨酸就會(huì)終止。這與甘氨酸的過(guò)度自由旋轉(zhuǎn)恰好是兩個(gè)極端。另外,脯氨酸在合成蛋白質(zhì)的時(shí)候,有時(shí)還會(huì)需要一個(gè)肽基脯氨酰順?lè)串悩?gòu)酶(PPI)的輔助。這個(gè)酶表達(dá)量非常恒定,是一個(gè)檢測(cè)基因表達(dá)量的良好內(nèi)參。 最后說(shuō)一下記憶氨基酸單字母符號(hào)的方法。首先有11個(gè)氨基酸用的就是首字母,不用特別記憶。剩下的就是首字母被占用的9個(gè),其中精氨酸(Arg)和酪氨酸(Tyr)還可以用第二個(gè)字母(R和Y,與其發(fā)音也有關(guān)系),天冬酰胺(Asn)用了第三個(gè)字母(N),其它基本就是按字母順序往下排。但是,B已經(jīng)用來(lái)代表Asx,即Asp或Asn;Z代表Glx,即Glu或Gln。所以給天冬氨酸用了D(據(jù)說(shuō)有asparDic之意),谷氨酸用了E,苯丙氨酸根據(jù)單詞發(fā)音選擇了F。剩下3個(gè)就硬記吧:谷氨酰胺用Q,賴氨酸用K(離L最近),色氨酸用W(據(jù)說(shuō)這個(gè)也跟發(fā)音有關(guān),還有一種說(shuō)法是含有double ring,而W是double u)。 |
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來(lái)自: lcy1971 > 《蛋白質(zhì)》