BIO 隨著 SCI 發(fā)文量的箭式增長,簡單細胞功能實驗像增殖、遷移、侵襲、克隆形成能力越來越難以滿足 SCI 期刊編輯爸爸的刁鉆胃口。如果你也飽受創(chuàng)新性不足、機制研究不深入的拒稿理由之苦,下面小竅門或許能讓你的文章從一眾平庸文章中脫穎而出。 竅門源自一個神奇的細胞表型——上皮細胞間質(zhì)轉(zhuǎn)化,簡稱 EMT 。EMT 簡單來說就是上皮細胞轉(zhuǎn)化為間質(zhì)型細胞的過程。一般來說,這種轉(zhuǎn)化有助于細胞在胚胎中的遷移。 但癌細胞一旦發(fā)生這種轉(zhuǎn)化可就要命了,因為人類的大部分癌癥主要先累及的是器官的上皮細胞層,通常情況下它們并不具備運動能力,只要這種癌細胞老老實實待著不動,我們就有一萬種方法對付它。 可發(fā)生 EMT的癌細胞由于粘附能力顯著減弱,非常容易隨著體液循環(huán)跑到別處作威作福,這就是癌癥的轉(zhuǎn)移。因此EMT作為癌癥研究的一個重要方向,有助于我們理解癌細胞侵襲和轉(zhuǎn)移機制。 細胞 EMT 轉(zhuǎn)化過程示意圖 最常用證明 EMT 的辦法是觀察形態(tài)或 WB、qPCR 檢測細胞 E-cadherin,N-cadherin,Vimentin 等 EMT marker 蛋白表達量變化。 不同環(huán)境下上皮和間質(zhì)細胞形態(tài)示意圖 WanG, Liu Y, Zhu J, et al. 2019 然而科學研究是基于循證的相關性研究,優(yōu)秀的研究和平庸的研究區(qū)別在于相關性強弱。咱們好不容易用 WB,qPCR 檢測到了 EMT 標志物的變化,編輯一句你只證明了部分相關性,瞬間心就涼了半截(似乎感受到了編輯爸爸的無情嘲諷)。 這時候最好的方法就是把更有力的證據(jù)甩到編輯臉上——不但證明EMT標志物表達增加,還要證明增加的標志物確實和細胞 EMT 表型直接相關。把細胞 EMT 的蹤跡更生動、漂亮地呈現(xiàn)出來??稍趺醋瞿??除了細胞形態(tài)變化和 marker 含量變化,有沒有方法能更直觀地表現(xiàn)細胞的 EMT 過程呢? 辦法當然有,還很多。 首先我們可以用細胞免疫熒光染色,更直接地展示 EMT marker的變化。這類研究可以總結(jié)為靶基因 A 表達變化導致位于細胞位置 B 的 marker C含量變化,說明某個 EMT 相關細胞功能 D 改變。 Mei Xua,Siying Wangb, Yongchao Wang, et al.2018 細胞間粘附減弱可以造成癌細胞脫離原生位點發(fā)生癌轉(zhuǎn)移,因此屬于細胞 EMT 的關鍵標志之一。 在這個例子里分別對兩組細胞中的 EMT marker E-cadherin進行了綠色免疫熒光染色。 圖中結(jié)果表明 p38D179(靶基因A)過表達導致細胞邊界處(即白色箭頭,細胞位置B)E-cadherin(marker C)免疫熒光減弱,說明 p38D179 與由 E-cadherin 介導的細胞間粘附減弱(EMT 相關細胞功能 D 改變)密切相關,p38D179 過表達誘導了細胞 EMT 過程。 怎么樣,這樣是不是比簡單的檢測 EMT marker 含量變化要直觀多了。 當然,在這個模型基礎上,我們還可以增加一些花樣,比如增加一個亞細胞結(jié)構(gòu)變量 E,使論據(jù)更加豐富。 細胞亞細胞結(jié)構(gòu)及標志物 細胞 EMT 的重要標志是運動能力顯著增強,而表型的背后離不開細胞骨架的大力支持。細胞骨架是胞內(nèi)由蛋白質(zhì)搭建的骨架網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),主要成分是微管、微絲和中間纖維,作用于細胞形態(tài)維持、物質(zhì)運輸和運動。 微管、微絲和中間纖維等結(jié)構(gòu)在細胞運動中的作用示意 因此我們也可以將之前的模型改為:靶基因A表達變化導致位于細胞位置 B 的 marker C 含量變化,說明 marker C表征的亞細胞結(jié)構(gòu)E改變,導致某個 EMT 相關細胞功能 D 改變。 Murali A, Shin J, Yurugi H, etal. 2017 舉栗來說,上圖分別對兩組細胞中組成細胞偽足的蛋白α-actin進行了綠色免疫熒光染色。 圖中 XIAP(靶基因 A )沉默導致細胞邊界處(細胞位置 B) α-actin (marker C)免疫熒光增強,說明由 α-actin 組成的細胞偽足數(shù)目增多(亞細胞結(jié)構(gòu)變量E),從而證明 XIAP 可以增強細胞運動能力( EMT 相關細胞功能 D 改變),XIAP 的沉默誘導了細胞 EMT 過程。 依賴于偽足的細胞運動示意圖 類似的亞細胞結(jié)構(gòu)變量E還有很多,比如和細胞 EMT 息息相關的細胞骨架三件套:微絲、微管、中間絲。東方不亮西方亮,總有一款適合你。 最后,除了簡單的亞細胞結(jié)構(gòu)數(shù)目變化,巧妙地免疫熒光實驗設計還能生動地展現(xiàn)其組織方式變化對 EMT 過程的影響。 Davidson G, Dono R, Zeller R.2001 在這個例子里分別對兩組細胞中微絲組成相關蛋白 synaptopodin 和黏著斑相關蛋白 paxilin 分別進行綠色和紅色熒光染色。 圖中基因(靶基因 A )突變導致細胞質(zhì)中(細胞位置 B )的微絲由正常的極性分布,變成了不規(guī)則的放射狀分布。由 synaptopodin(marker C1)表征的微絲(亞細胞結(jié)構(gòu)變量E1)結(jié)構(gòu)能夠正常聚集并終止在由 paxillin (marker C2)表征的黏著斑(亞細胞結(jié)構(gòu)變量 E2)上,卻難以觸及細胞邊界,因此無法有效促進細胞運動( EMT 相關細胞功能 D 改變)。因此在這個例子里,基因突變通過影響微絲的自組織從而抑制了細胞的 EMT 過程。 你看,到這里我們對 EMT 過程的解讀是不是更新穎、更細致了。 總而言之,除了細胞粘附和運動能力等主要的 EMT 相關表型,對于神奇的細胞表型 EMT,我們能探索的還很多。借助細胞免疫熒光實驗,我們能夠直觀地展現(xiàn)細胞EMT過程中內(nèi)在相關因素的變化,從而豐富論據(jù),讓論點無懈可擊。 歡迎大家留言討論,大家想看什么方向的文章也可以留言。 PLUS: 合生基因對外提供包含細胞免疫熒光實驗在內(nèi)的醫(yī)學腫瘤學基礎科研服務項目。 |
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