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      皇帝尿糖——細(xì)胞因子與SNP之間的隱秘勾連

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-07-11

      皇帝的疾病史,一定程度上決定了歷史中的宮幃政治走向。我們亦可將其抽離出來,作為專門的病理學(xué)主題加以研究。糖尿病,當(dāng)今時(shí)代的常見病之一,在中國古代,往往由鐘鳴鼎食之家的皇親國戚所罹患。如漢高祖劉邦、漢武帝劉徹等,都曾飽受這份“甜蜜負(fù)擔(dān)”的困擾。

      1921年,加拿大科學(xué)家班廷以狗為實(shí)驗(yàn)動(dòng)物進(jìn)行研究(據(jù)傳,由于經(jīng)費(fèi)不足,當(dāng)時(shí)街上的流浪狗經(jīng)常神秘失蹤),初步揭示了糖尿病與胰島素之間的關(guān)聯(lián),并榮獲了諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。之后,產(chǎn)業(yè)界通過生物工程技術(shù),逐步實(shí)現(xiàn)了胰島素的體外表達(dá)生產(chǎn),解決了產(chǎn)量、純度和價(jià)格問題。而學(xué)術(shù)界則在一直孜孜探索糖尿病背后的詳細(xì)發(fā)病機(jī)理。得益于分子生物學(xué)技術(shù)的突飛猛進(jìn),很多糖尿病相關(guān)的基因已被鎖定,而二代測(cè)序技術(shù)的通量及深度,又進(jìn)一步將胰島素分泌調(diào)控相關(guān)的 SNP 一一解析。今天,我們就來分享一篇文章,講述胰島素分泌調(diào)控與單核苷酸多態(tài)性 SNP 之間的關(guān)系。

      文章發(fā)表在《NatureGenetics》:作者先通過 GWAS 分析,發(fā)現(xiàn)了 PAM 基因(酰胺化單加氧酶)上與正常人存在差異的兩個(gè)等位基因 SNP,rs78408340 和 rs35658696。隨后通過電化學(xué)發(fā)光 MSD 技術(shù)測(cè)定了對(duì)應(yīng)的胰島素含量,揭示了其功能表型。發(fā)現(xiàn) rs78408340 的錯(cuò)義會(huì)影響 PAM 的功能:正常情況下,PAM 定位于高爾基體。而發(fā)生錯(cuò)義后,PAM 則會(huì)定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,PAM 蛋白的正確折疊將被干擾,最終阻礙了胰島素的正常分泌。當(dāng) PAM 被基因沉默后,與對(duì)照組相比,β-cell 在高糖條件(攝食之后)下分泌的胰島素顯著下降。這說明 PAM 基因的 rs78408340SNP 參與調(diào)節(jié)了胰腺 β-cell 的胰島素分泌。

      PAM是如何影響 β-cell 胰島素的分泌呢?

      研究者發(fā)現(xiàn)了 PAM 的下游效應(yīng)蛋白 CgA(嗜鉻粒蛋白),CgA 是 PAM 的作用底物,PAM 被沉默后,CgA-Gly 的表達(dá)量明顯上升進(jìn)而導(dǎo)致 β-cell 分泌胰島素的含量下降。

      文章要點(diǎn)提煉

      1. 細(xì)胞因子檢測(cè) +GWAS-SNP 分析,能完整揭示基因型與表型之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系;

      2. PAM 參與 β-cell 的分泌途徑,調(diào)節(jié)胰島素的分泌;

      3. 單個(gè) SNP 會(huì)導(dǎo)致 PAM 功能的變化,影響胰島素的分泌;

      無獨(dú)有偶,《Cell》上也有一篇文章采取了相似的研究思路,探索了 FOXO3 基因的 SNP 與 TGF-β 通路細(xì)胞因子分泌調(diào)控間的關(guān)系。發(fā)現(xiàn)攜帶 rs12212067 的 SNP 影響了單核細(xì)胞細(xì)胞因子的分泌,在降低 TNFα 表達(dá)的同時(shí),促進(jìn)了抑炎因子 IL-10 的釋放。

      很多 SNP 并無顯著可見的功能,文章通過基因型加表型分析,發(fā)現(xiàn)了單個(gè) SNP 與糖尿病之間隱藏至深的勾連,也算從眾多碌碌無為、無甚明顯功能的 SNP 之中脫穎而出,實(shí)現(xiàn)了其人生價(jià)值。但生物的適應(yīng)性本就是基因與環(huán)境的匹配磨合。一定生活環(huán)境下的劣勢(shì)基因,換個(gè)時(shí)代,換個(gè)地域,可能反具備生存優(yōu)勢(shì)??v觀整個(gè)人類歷史,悠悠漫長,衣食無憂僅是近100年,甚至近幾十年的事,漫長的食物不足甚至饑荒年代,對(duì)攜帶 SNPrs78408340 的人群,通過減少胰島素的分泌,相對(duì)其他個(gè)體,也許更適應(yīng)彼時(shí)的代謝需求。與此類似,基因突變導(dǎo)致的鐮刀型紅細(xì)胞貧血癥影響了紅細(xì)胞的攜氧功能,卻在瘧疾肆虐的非洲地區(qū)巧妙地減少了瘧原蟲的侵襲。

      SNP,福兮,禍兮?誰又能說得清……不過,倘因糖尿病而早逝的古人活在當(dāng)代,至少能向天再借幾十年。

      諾禾致源提供 MSD 細(xì)胞因子檢測(cè) +GWAS-SNP 分析服務(wù),其中與代謝炎癥相關(guān)的細(xì)胞因子見下表,包括人、鼠、兔子、犬齒類、非人類靈長類動(dòng)物。

      如果您有檢測(cè)需求,請(qǐng)與天津諾禾致源當(dāng)?shù)劁N售聯(lián)系。MSD 完整因子列表請(qǐng)向pid@novogene.com索取。

      聯(lián)系方式:pid@novogene.com

      參考文獻(xiàn)

      [1] Soren K. Thomsen,Anne Raimondo, Benoit Hastoy, et al. Type2 diabetes risk alleles in PAM impact insulin release from human pancreaticβ-cells[J]. Nature Genetics, 2018, 50:1122–1131.

      [2] Lee J , Espéli,Marion, Anderson C , et al. Human SNPLinks Differential Outcomes in Inflammatory and Infectious Disease to aFOXO3-Regulated Pathway[J]. Cell, 2013, 155(1):57-69.

      免疫定量事業(yè)部   李軍輝、 宋   美 | 文案

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