![]() 目前,主流的血液DNA提取方法有磁珠法和硅膠膜離心柱法,這兩種方法各有利弊。磁珠法可以針對大批量樣本的處理,滿足自動化工作的需要,但是提取核酸純度低,提取得率低;硅膠膜離心柱法提取的核酸純度高,提取效率高,對目標(biāo)基因或DNA含量較低的樣本提取,具有比較明顯的優(yōu)勢,但不易自動化操作。一般來說,科研用戶的樣本量不會太多,首要的還是提高核酸純度和提取效率,因而科研用戶主要還是選擇離心柱法。大型醫(yī)療機構(gòu)樣本量較多,一般都會選擇自動化的磁珠法。但一些樣本量不太多的臨床醫(yī)院或檢測機構(gòu),出于方便和準(zhǔn)確診斷的要求,還是會選擇離心柱法。特別地,對一些低豐度樣本的檢測,最好不要用磁珠法,最好選擇離心柱法,否則可能會導(dǎo)致假陰性結(jié)果。就離心柱法來說,目前使用較多的還是商品化試劑盒,面對眾多的品牌,如何選擇適合自己實驗的提取試劑呢?
二、血液核酸提取的純度要高。一般通過測定OD260/OD280比值來估計核酸純度。一般DNA 溶液OD260/OD280比值應(yīng)在1.6--1.8之間,如果提取的DNA溶液OD260/OD280比值小于1.6,通常說明有蛋白質(zhì)或酚、多糖等的污染。如果提取的DNA溶液OD260/OD280>1.9,則表明有RNA污染。不同品牌的試劑盒提取的DNA純度略有差別,Biog的血液核酸提取純度比Qiagen略低,可以直接應(yīng)用于PCR、qPCR、病毒檢測、分子雜交等。Qiagen的純度略高,除了以上應(yīng)用,還可用于對純度要求略高的實驗,如細(xì)胞轉(zhuǎn)染等。但是一般來講,目前的血液DNA提取主要應(yīng)用于基因檢測、PCR、qPCR、分子雜交等,國產(chǎn)試劑盒Biog都能滿足要求。 三、產(chǎn)品價格。價格也是選購產(chǎn)品的重要考量因素。對于絕大多數(shù)實驗如PCR、qPCR、基因檢測、分子雜交等,國產(chǎn)試劑盒都能滿足質(zhì)量要求。與國外知名品牌相比,國產(chǎn)試劑盒的價格較為便宜,如Biog,價格還不到國外品牌價格的30%,性價比較高。因而,對于以上實驗建議選用Biog等國產(chǎn)試劑盒。一些經(jīng)費不是很多的課題研究或樣本量較大的臨床檢測項目,特別適合選用國產(chǎn)試劑盒。有些研究對提取DNA的純度要求相對較高,如細(xì)胞轉(zhuǎn)染等,可考慮選用Qiagen等國外知名品牌。 綜合看來,與國外知名品牌相比,國產(chǎn)試劑盒在血液DNA提取純度上略有不足,但不影響大多數(shù)實驗,特別是下游需要PCR擴(kuò)增的實驗和分子雜交類實驗。在提取得率上,國內(nèi)試劑盒與國外品牌差別不大,而在價格方面,國產(chǎn)試劑盒具有比較明顯的優(yōu)勢。如果經(jīng)費充足,DNA純度要求較高,可考慮選擇Qiagen等國外知名品牌。如果經(jīng)費不多或下游做PCR、qPCR、分子雜交等實驗,可考慮選擇性價比較高的Biog等國產(chǎn)品牌。 |
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