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      GraphPad prism --生存分析和ROC 曲線操作步驟解析!

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-07-19
      一、生存分析

       軟件操作:

      1.選擇所需圖表樣式

      2.輸入數(shù)據(jù),完善表格

       實(shí)例分析 

      某實(shí)驗(yàn)室中記錄了 15 只注射 10μg/ml 大腸桿菌的小鼠與 18 只 20μg/ml  大腸桿菌的小鼠的生存時間(d),試分析兩種濃度的生存率。

      1.輸入數(shù)據(jù)

      輸入組別與各組對應(yīng)樣本數(shù)據(jù)

      2.查看結(jié)果

      ①選擇頁面左側(cè) Graphs 的附屬選項(xiàng) Data 1;

      ②選擇所需圖形樣式;

      ③.選擇 Fraction,表示 Y 軸累計(jì)生存率為 0 到 1;選擇 Percents,表示 Y 軸累計(jì)生存率為 0~100%,兩者含義相同,任選其一皆可。此處選 Percents;

      ④點(diǎn)擊確認(rèn)。

      3.結(jié)果圖

      1)結(jié)果圖1

      ①點(diǎn)擊菜單欄中 change 模塊中的第一行第二個圖標(biāo),根據(jù)需求編輯橫縱坐標(biāo)。

      ②點(diǎn)擊菜單欄中 Write 模塊中的第二行第一個圖標(biāo),根據(jù)需求在圖表中編輯文字。

      2)結(jié)果圖2

      ①點(diǎn)擊菜單欄 change 模塊中的第一行第二個圖標(biāo)

      ②選擇第三個對話框:Y aixs

      ③在 Additional ticks and grid lines 項(xiàng)中,填入 AY =50,選中 Line 選項(xiàng),點(diǎn)擊 Details 按鈕進(jìn)入下一頁面。

      3)結(jié)果圖3

      二、ROC 曲線

       原理及意義 

      ①受試者工作特征曲線:

      receiver operating characteristic curve,ROC 曲線,又稱為感受性曲線(sensitivity curve)

      ②ROC 分析:

      一般分為自變量和因變量;自變量(檢驗(yàn)項(xiàng)目)一般為連續(xù)性變量,因變量(金標(biāo)準(zhǔn))一般為二分類變量。

      ③ROC 曲線圖片:

      采用真陽性率和假陽性率出圖;

      Y:真陽性率 (Sen) ,X:假陽性率 (1-Spe) ;坐標(biāo)軸上的率值由 0~1。

      ④ROC 主要作用:

      判斷指標(biāo)對疾病的診斷作用; ROC 曲線下面積 (AUC) 越大,診斷價值越高(靈敏度、特異度)

       軟件操作

      1.打開軟件,選擇左側(cè) New Table & Graph 中的Column 選項(xiàng);

      2.點(diǎn)擊選擇右側(cè)Enter/import data  項(xiàng)中的Ener replicate values,stacked into columns選項(xiàng)。

      3.輸入數(shù)據(jù),完善表格

       實(shí)例分析 

      現(xiàn)有經(jīng)過金標(biāo)準(zhǔn)診斷的18名正常人及18名患者的某項(xiàng)指標(biāo)檢驗(yàn)結(jié)果。試?yán)L制ROC曲線。

      1.輸入數(shù)據(jù),完善表格

      輸入組別與各組對應(yīng)樣本數(shù)據(jù)

      2.查看結(jié)果

      3.結(jié)果圖

      ①點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹中的Graphs 項(xiàng),選擇 ROC curve 項(xiàng).

      ②點(diǎn)擊菜單欄中 Change 模塊中的第一行第三個圖標(biāo),編輯線條;點(diǎn)擊第一行第二個圖標(biāo),編輯橫縱坐標(biāo)軸起始值.

      4.圖表自定義

      ①編輯線條:1.點(diǎn)擊選擇需要改動的線條

      ②對線條顏色,線條上點(diǎn)的大小,作出調(diào)整

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