Haalthy導(dǎo)讀

靶向治療前需要進(jìn)行基因檢測，查找突變的基因，從而選擇合適的藥物。但是在基因檢測報(bào)告上，不僅僅有基因突變的類型，還有一項(xiàng)重要的參考項(xiàng)目：突變豐度。

基因突變豐度是什么呢？豐度值的高低有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)嗎？豐度值高好還是低好呢？想知道這些問題，一起看下今天的文章吧。

基因突變豐度是什么？

拿到一份基因檢測的報(bào)告，我們常?？梢钥吹揭豁?xiàng)參考數(shù)值：豐度，這個數(shù)據(jù)令很多病友不解，“豐度”究竟是什么呢？以肺癌中最常見的EGFR突變?yōu)槔?/p>

“豐度”可以簡要理解為EGFR突變頻率占總的DNA中的濃度，也有學(xué)者將豐度定義為EGFR突變和野生型拷貝的比值，目前沒有明確的定義。

為什么不同的患者突變豐度不同？

不同的患者基因檢測的突變豐度會有很大的差異，這種差異主要與腫瘤異質(zhì)性相關(guān)，過去我們認(rèn)為同一個體中腫瘤細(xì)胞是相同的，基因相同、空間結(jié)構(gòu)也相同；然而，隨著檢測技術(shù)逐漸精準(zhǔn)化，我們才發(fā)現(xiàn)同一份樣本組織中，腫瘤細(xì)胞的基因、蛋白等各個結(jié)構(gòu)并不一致。

這種特征更通俗而言，可以用一句古語表達(dá)“一母生九子，九子各不同”，原來定居的腫瘤細(xì)胞不斷演變出不同的后代。同一部位腫瘤會產(chǎn)生不同的基因表達(dá)，不同部位的腫瘤表達(dá)又有可能出現(xiàn)新的改變，不同人之間又會有區(qū)別，從宏觀上看是人和人不同，微觀上看腫瘤和腫瘤也不同。

也就造成了不同的患者即使具有相同的基因突變，彼此之間突變的豐度也會有所不同，進(jìn)而表現(xiàn)為對于同一種藥物的反應(yīng)也不同。

高、低豐度判斷標(biāo)準(zhǔn)

早期，豐度高低的定義與基因檢測方法敏感性有關(guān)，如直接測序法需要EGFR突變頻率達(dá)到20%-30%才能發(fā)現(xiàn)，而ARMS檢測只需要EGFR突變頻率達(dá)到1%即可檢測到。只要檢測到突變即為高豐度。但這種定義過于籠統(tǒng)化，不具有區(qū)分性。

但目前對于基因檢測的豐度高低值判斷仍舊沒有統(tǒng)一的區(qū)間標(biāo)準(zhǔn)。不同的測序方法、不同的檢測公司會有不同的數(shù)值設(shè)定。

基因突變豐度高可能提示TKI治療效果好

有中國學(xué)者發(fā)現(xiàn)EGFR突變豐度可以預(yù)測EGFR- TKI治療晚期非小細(xì)胞肺癌的療效。研究選取了100個樣本，其中有51例EGFR突變患者豐度較高，18例EGFR突變患者豐度較低，31例患者攜帶野生型EGFR。

將這100例患者同時進(jìn)行直接DNA測序和ARMS檢測，

兩種方法檢測均為陽性則為EGFR突變高豐度;

ARMS檢測陽性、直接DNA測序?yàn)殛幮詣t為低豐度;

二者均為陰性則為攜帶野生型EGFR。

所有患者均接受吉非替尼治療，檢測標(biāo)本腫瘤細(xì)胞超過50%。分析了EGFR突變豐度與吉非替尼治療臨床療效的關(guān)系結(jié)果如圖所示：

圖一：EGFR突變豐度高、EGFR突變豐度低和EGFR野生型三者比較

中位無進(jìn)展生存期（mPFS）

11.3個月 vs 6.9個月 vs 2.1個月；

客觀緩解率（ORR）

62.7% vs 44.4% vs 16.1%；

總生存期（OS）

15.9 個月 vs 10.9個月 vs 8.7個月

由此得出，基線相對EGFR突變豐度可以預(yù)測TKI 獲益程度。突變豐度越高，也就越有可能獲益。

對于該研究的三個延展性問題

結(jié)果有差異

由于腫瘤異質(zhì)性、基因檢測的方法、獲取的標(biāo)本、研究者關(guān)于豐度的定義等因素并不統(tǒng)一，因此不同試驗(yàn)會得出不同的結(jié)論。

如，有研究者用同樣的方法，結(jié)果發(fā)現(xiàn)高低豐度患者對TKI反應(yīng)沒有顯著不同，直接測序和ARMS法檢測突變結(jié)果不同的患者和相同的患者，PFS分別是13.4和10.9個月，沒有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，可能與該試驗(yàn)的標(biāo)本選擇有關(guān)。

總之，EGFR基因突變豐度高可能提示EGFR-TKI治療效果好，但二者之間不存在必然關(guān)系。

豐度動態(tài)變化也可以反應(yīng)TKI治療效果

有研究顯示：血漿中EGFR突變快速降低可能預(yù)示更好的TKI反應(yīng)。FASTACT-2研究顯示第3周期時血漿EGFR突變依舊陽性可能預(yù)示較差的臨床結(jié)局。

其他基因突變豐度是否具有相同的結(jié)論

目前，沒有資料顯示其他基因突變豐度對于靶向治療效果的研究，因此，能否將同樣的結(jié)論類比到其他的基因突變豐度，尚待考量。

以上是肺騰助手為病友們整理的基因檢測突變豐度的小知識，希望對大家有幫助！

參考資料：

[1].https:///doi/pdfdirect/10.1200/JCO.2010.33.3757

[2].邵宜,鐘殿勝 .EGFR突變豐度的檢測及其臨床意義[J].中國肺癌雜志,2017,20(8):578-582