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      一文讀懂凋亡執(zhí)行蛋白Caspase家族那些事

       ypgao 2019-11-01

      背景介紹

      盡管凋亡過程的詳細機制尚不完全清楚,但是已經(jīng)確定Caspase即半胱氨酸蛋白酶在凋亡執(zhí)行過程中起著至關(guān)重要的作用,而且細胞凋亡的過程實際上是Caspase被活化并發(fā)生凋亡蛋白酶的級聯(lián)反應(yīng),Caspase家族蛋白存在于胞漿中,它們同源性很高,結(jié)構(gòu)相似,均含有一個半胱氨酸激活位點,特異地斷開天冬氨酸殘基后的肽鍵,目前被發(fā)現(xiàn)的Caspases有14種,它們參與調(diào)節(jié)多種生物學(xué)過程,與細胞凋亡密切相關(guān),此外還參與細胞的生長、分化、增殖和運動。

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      Caspases家族

      哺乳動物Caspase家族蛋白根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能,可以分為三大類(圖1):

      第一類:促凋亡Caspases

      主要包括Caspase-2,8,9,10,3,6,7。它們以級聯(lián)放大的方式對胞內(nèi)蛋白進行高效切割,最終導(dǎo)致細胞凋亡。它們被分為兩派,其中Caspase 2,8,9,10參與細胞凋亡的起始(啟動者,initiators);Caspase 3,6,7參與細胞凋亡執(zhí)行(效應(yīng)者,effectors)。

      第二類:促炎性Caspases

      主要包括Caspase-1,4,5,11,12,13。在先天性免疫應(yīng)答激活期間,促炎性Caspases介導(dǎo)特異性細胞因子(cytokines)的成熟,如Pro-IL-1β和Pro-IL-18,形成有活性的IL-1β和IL-18;但也可能參與一種稱為pyroptosis(焦亡)的細胞死亡形式。

      第三類:角化細胞分化

      圖1:Caspase家族圖譜。圖片來源于網(wǎng)絡(luò)

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      Caspases活化

      細胞中合成的Caspases以無活性的酶原狀態(tài)存在,經(jīng)過活化后方能執(zhí)行剪切功能。Caspase的活化是有順序的多步水解的過程,Caspase分子各異,但是它們活化的過程相似。需在兩個亞基的連接區(qū)的天冬氨酸位點進行切割,結(jié)果產(chǎn)生了由兩個亞基組成的異二聚體,再由兩個二聚體形成有活性的四聚體。通常N-末端的肽在活化時也被除去,但對于Caspase-9是否去除N-末端肽對活性無影響。

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      凋亡執(zhí)行

      Caspase 3和7具有相近的底物和抑制劑特異性,它們異源活化后降解PARP,DFF-45(DNA fragmentation factor-45),導(dǎo)致DNA修復(fù)的抑制并啟動DNA的降解。而Caspase-6的底物是lamin A(詳情請點擊往期推文:爆款產(chǎn)品-明星分子Lamin A/C重組兔單抗)和keratin 18,它們的降解導(dǎo)致核纖層和細胞骨架的崩解。

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      細胞凋亡的檢測方法

      細胞凋亡與壞死是兩種完全不同的細胞死亡形式,根據(jù)死亡細胞在形態(tài)學(xué)、生物化學(xué)和分子生物學(xué)上的差別,可以將二者區(qū)別開來。

      細胞凋亡的檢測方法有很多,下面介紹幾種常用的測定方法

      方法一:形態(tài)學(xué)檢測

      以顯微鏡觀察細胞甚至是亞細胞層面的形態(tài)變化和形態(tài)學(xué)特征,而具體的顯微鏡技術(shù)以及其所檢測的凋亡形態(tài)學(xué)特征見下圖(圖2):

      圖2:顯微鏡技術(shù)及其檢測的凋亡相關(guān)形態(tài)學(xué)特征。圖片來源于網(wǎng)絡(luò)

      方法二:流式細胞術(shù)檢測(FCM,  Annexin V-PI雙染色實驗)

      在正常細胞中,磷脂酰絲氨酸(PS)只分布于細胞膜磷脂雙分子層內(nèi)側(cè),細胞處于凋亡早期時,PS發(fā)生外翻出現(xiàn)在細胞外側(cè),Annexin V作為一種磷脂結(jié)合蛋白,可與PS高度親和,因而Annexin V是檢測細胞早期凋亡的靈敏指標(biāo)。PI是一種核酸染料,它不能透過完整的細胞膜,但在凋亡晚期和死細胞中,PI可透過細胞膜與細胞核結(jié)合。Annexin V和PI配合使用,可以將凋亡早期細胞和晚期細胞以及死細胞區(qū)分開來。

      Annexin V-PI雙染實驗可將細胞分為四種類型(圖3

      圖3:Annexin V-PI雙染色實驗

      B3象限:Annexin V陰性且PI陰性(雙陰性細胞):活細胞;

      B4象限:Annexin V陽性且PI陰性:早期凋亡細胞;

      B2象限:Annexin V陽性且PI陽性(雙陽性細胞):晚期凋亡細胞;

      B1象限:Annexin V陰性且PI陽性:壞死細胞。

      3.核酸電泳檢測(DNA片段檢測法)

      細胞凋亡時DNA會發(fā)生片段化,形成200bp的整數(shù)倍;而壞死細胞時DNA發(fā)生無規(guī)則斷裂。因而在凝膠電泳中,如果出現(xiàn)這種顯著特征的電泳條帶,就可以判斷細胞發(fā)生了凋亡。

      圖4:DNA片段凝膠電泳

      4. mRNA水平的檢測

      科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了很多在細胞凋亡時表達異常的基因,檢測這些特異基因的表達水平也成為檢測細胞凋亡的一種常用方法。據(jù)報道,F(xiàn)as 蛋白結(jié)合受體后能誘導(dǎo)癌細胞中的細胞毒性T細胞(Cytotoxic T cells)等靶細胞。Bcl-2 和Bcl-xL作為抗凋亡的調(diào)節(jié)物,它們的表達水平比例決定了細胞是凋亡還是存活。因而可以用qPCR技術(shù)(詳情請點擊往期推文:新款通用型qPCR mix,專治各種不服 & 新品上市--Genious 2X SYBR Green Fast qPCR Mix)來檢測Fas, Bax 和 Bcl-xL基因的 mRNA表達水平來進行細胞凋亡的檢測。

      5. 細胞色素C的定位檢測

      細胞色素C(Cytochrome C)作為一種信號物質(zhì),在細胞凋亡中發(fā)揮著重要的作用。正常情況下,它存在于線粒體內(nèi)膜和外膜之間的腔中,凋亡信號刺激使其從線粒體釋放至細胞漿,結(jié)合Apaf-1(Apoptotic protease activating factor-1)后啟動Caspase級聯(lián)反應(yīng)。因而可以通過組化或熒光方法檢測Cytochrome C定位來判斷細胞凋亡。

      6. 凋亡明星分子檢測

      通常以Western Blot檢測凋亡通路明星蛋白,如Caspase家族蛋白,Caspase 8,Caspase 6,和Caspase 3的前體和剪接體,以及Caspase 3的底物PARP分子;又如Bcl-2家族蛋白,抑制凋亡的Bcl-2和促進凋亡的Bax,在以Western Blot檢測Bcl-2和Bax的表達量后,通過Bcl-2/Bax的比值,可表征細胞凋亡的程度。

      圖5:ABclonal第四代重組兔單抗制備流程

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