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大家好，我是ANGUS，近期有部分?jǐn)?shù)據(jù)庫使用者反映數(shù)據(jù)庫安裝報(bào)錯(cuò)，主要是以下情況。 導(dǎo)致該報(bào)錯(cuò)的原因主要是mimiciii schema未建立，現(xiàn)MIMIC官網(wǎng)也已同步更新糾正了該錯(cuò)誤。 知道了問題的原因，那么解決的辦法就是在mimic庫下建立mimiciii schema即可。 代碼如下： CREATE SCHEMA mimiciii; 那么基于之前的設(shè)置： ⑴26個(gè)CSV文件所在目錄：E:TEMP ⑵4個(gè)SQL批處理文件所在目錄： E:PostgreSQL_s 那么我們完整的建庫代碼如下： DROP DATABASE IF EXISTS mimic; CREATE DATABASE mimic OWNER postgres; c mimic; CREATE SCHEMA mimiciii; setsearch_path to mimiciii; i E:/PostgreSQL_s/postgres_create_tables.sql setON_ERROR_STOP 1 set mimic_data_dir 'E:/TEMP' i E:/PostgreSQL_s/postgres_load_data.sql i E:/PostgreSQL_s/postgres_add_indexes.sql i E:/PostgreSQL_s/postgres_checks.sql 這里再交代一下本人在醫(yī)學(xué)方公眾號(hào)群中解答的問題原則： ⑴嚴(yán)格按照公眾號(hào)執(zhí)行代碼出現(xiàn)問題的歡迎咨詢。代碼執(zhí)行是一個(gè)很細(xì)致的過程，有的時(shí)候落了一個(gè)字母，或少了一個(gè)引號(hào)都會(huì)導(dǎo)致報(bào)錯(cuò)，歡迎各位偷懶直接復(fù)制公眾號(hào)的代碼以避免不必要的麻煩。咨詢時(shí)請(qǐng)將整個(gè)報(bào)錯(cuò)窗口截下來發(fā)至群里。 ⑵自行改sql文件代碼報(bào)錯(cuò)的不要來找我； ⑶電腦兼容報(bào)錯(cuò)的，如開啟軟件后系統(tǒng)提示兼容性錯(cuò)誤的，請(qǐng)自行查找報(bào)錯(cuò)原因，排查沖突進(jìn)程； ⑷有問題請(qǐng)多在公眾號(hào)群里問，請(qǐng)千萬千萬不要來加我微信，微信是作者的私人生活圈，如非必要請(qǐng)不要來騷擾了，謝謝諒解。 謝謝大家對(duì)醫(yī)學(xué)方及mimic數(shù)據(jù)庫的關(guān)注和支持，接下來我們繼續(xù)正題。 在上一個(gè)專題我們了解了有關(guān)病人人口學(xué)信息及院內(nèi)周轉(zhuǎn)信息的6張大表，今天我們要繼續(xù)了解在監(jiān)護(hù)室住院期間我們所采集的各類信息。 今天主要介紹以下8張表格： CAREGIVERS CHARTEVENTS DATETIMEEVENTS INPUTEVENTS_CV INPUTEVENTS_MV NOTEEVENTS OUTPUTEVENTS PROCEDUREEVENTS_MV 1 CAREGIVERS——護(hù)理人員信息 該表格包括以下信息（與前一專題重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符，類似于單位里的員工碼一樣的存在 LABEL：主要為頭銜縮寫，如MD表示醫(yī)學(xué)博士，RN表示注冊(cè)護(hù)士等 DEION：對(duì)LABEL的進(jìn)一步解釋，說明該護(hù)理人員的類別
2 CHARTEVENTS——病人觀察記錄數(shù)據(jù) 該表格包括以下信息（與前面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) ICUSTAY_ID：ICU病案號(hào) ITEMID：項(xiàng)目標(biāo)志符 CHARTTIME：記錄時(shí)間 STORETIME：錄入數(shù)據(jù)上傳至信息系統(tǒng)及確認(rèn)時(shí)間 CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符 VALUE：ITEMID對(duì)應(yīng)項(xiàng)目值 VALUENUM： 如果VALUE值是數(shù)值型，則顯示為VALUE相同的值； 如果VALUE值不是數(shù)值型，則顯示NULL； 如果VALUE的ITEMID對(duì)應(yīng)于評(píng)分項(xiàng)目，則VALUE包含項(xiàng)目名稱及分值，而VALUENUM只包含分值 VALUEUOM：VALUE值如有單位，則顯示其單位，否則為NULL WARNING：Metavision數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。提示是否數(shù)值觸發(fā)了警報(bào) ERROR：Metavision數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。提示測(cè)量記錄過程是否發(fā)生錯(cuò)誤 RESULTSTATUS：CareVue數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。表示測(cè)量記錄類型，有以下2種 Manual表示手動(dòng) Automatic表示自動(dòng) STOPPED：CareVue數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。表示測(cè)量記錄是否被終止
3 DATETIMEEVENTS——病人操作相關(guān)日期時(shí)間信息 該表格包括以下信息（與上面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) ICUSTAY_ID：ICU病案號(hào) ITEMID：項(xiàng)目標(biāo)志符 CHARTTIME：記錄時(shí)間 STORETIME：錄入數(shù)據(jù)上傳至信息系統(tǒng)及確認(rèn)時(shí)間 CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符 VALUE：ITEMID對(duì)應(yīng)項(xiàng)目日期時(shí)間數(shù)據(jù) VALUEUOM：VALUE值類型，主要有2種類型 Date表示日期 Date and Time表示日期+時(shí)間 WARNING：Metavision數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。提示是否數(shù)值為警報(bào)值 ERROR：Metavision數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。提示測(cè)量記錄過程是否發(fā)生錯(cuò)誤 RESULTSTATUS：CareVue數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。表示測(cè)量記錄類型 STOPPED：CareVue數(shù)據(jù)系統(tǒng)專有。表示測(cè)量記錄是否被終止
4 INPUTEVENTS_CV——Philips CareVue系統(tǒng)入量數(shù)據(jù) 該表格包括以下信息（與上面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) ICUSTAY_ID：ICU病案號(hào) CHARTTIME：記錄時(shí)間 ITEMID：項(xiàng)目標(biāo)志符，CareVue常用藥物的ITEMID在30000-39999之間，而出入量項(xiàng)目的ITEMID在40000-49999之間 AMOUNT：前次記錄時(shí)間至現(xiàn)在的總?cè)肓?，大多是按每小時(shí)計(jì) AMOUNTUOM：入量單位 RATE：入量速率，如無則顯示NULL RATEUOM：速率單位，RATE為NULL時(shí)，該項(xiàng)也為NULL STORETIME：錄入數(shù)據(jù)上傳至信息系統(tǒng)及確認(rèn)時(shí)間 CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符 LINKORDERID：藥品組合標(biāo)志符 ORDERID：官網(wǎng)的說法是藥品組合標(biāo)志符，但與LINKORDERID又有所不同，它是LINKORDERID下的藥品組合給藥速率標(biāo)志符，每個(gè)ORDERID對(duì)應(yīng)一個(gè)給藥速率，每次給藥速率改變時(shí)即產(chǎn)生一個(gè)新的ORDERID，可用于追蹤給藥速率，所以將它理解為藥品組合給藥速率標(biāo)志符會(huì)更好理解 STOPPED：輸液是否中斷或續(xù)藥等 NEWBOTTLE：新液體準(zhǔn)備狀態(tài)。1表示已準(zhǔn)備新液體已化好就緒，NULL表示無 ORIGINALAMOUNT：藥品組合最初總量 ORIGINALAMOUNTUOM：藥品組合總量的單位 ORIGINALROUTE：最初給藥途徑，如經(jīng)口、靜脈等 ORIGINALRATE：最初給藥速率 ORIGINALRATEUOM：最初給藥速率單位 ORIGINALSITE：最初人體給藥部位，如左手、左腳等
5 INPUTEVENTS_MV—iMDSoft Metavision系統(tǒng)入量數(shù)據(jù) 該表格包括以下信息（與上面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) ICUSTAY_ID：ICU病案號(hào) STARTTIME：出入量活動(dòng)開始時(shí)間 ENDTIME：出入量活動(dòng)結(jié)束時(shí)間 ITEMID：項(xiàng)目標(biāo)志符，Metavision的ITEMID均大于220000 AMOUNT：從STARTTIME至ENDTIME的總?cè)肓?/p> AMOUNTUOM：入量單位 RATE：入量速率，如無則顯示NULL RATEUOM：速率單位，RATE為NULL時(shí)，該項(xiàng)也為NULL STORETIME：錄入數(shù)據(jù)上傳至信息系統(tǒng)及確認(rèn)時(shí)間 CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符 LINKORDERID：藥品組合標(biāo)志符 ORDERID：LINKORDERID下的藥品組合給藥速率標(biāo)志符 ORDERCATEGORYNAME：所給藥品一級(jí)分類目錄名 SECONDARYORDERCATEGORYNAME：所給藥品次級(jí)分類目錄名 ORDERCOMPONENTTYPEDEION：藥品在藥品組合中的作用 ORDERCATEGORYDEION：所給藥品類型，針劑、非針劑等等 PATIENTWEIGHT：患者體重，以千克計(jì) TOTALAMOUNT：輸注液體最初體積總量 TOTALAMOUNTUOM：輸注液體體積單位 ISOPENBAG：表示裝有溶液的輸液袋是否已打開 0表示未打開 1表示已打開 CONTINUEINNEXTDEPT：出科后是否續(xù)藥。這項(xiàng)僅出科時(shí)有意義。 0表示出科至新科室后不續(xù)藥 1則表示續(xù)藥 CANCELREASON：醫(yī)囑取消原因 STATUSDEION：輸液狀態(tài)，主要有以下幾種： Stopped表示停止液體輸注或液體輸注結(jié)束 FinishRunning表示液體已輸注結(jié)束 Rewritten表示對(duì)液體輸注記錄進(jìn)行修正 Changed表示對(duì)輸液參數(shù)進(jìn)行改動(dòng) Flushed表示一條液體通路已被沖管 COMMENTS_EDITEDBY：輸液醫(yī)囑修改標(biāo)記，顯示為操作者頭銜 COMMENTS_CANCELEDBY：輸液醫(yī)囑取消標(biāo)記，顯示為操作者頭銜 COMMENTS_DATE：COMMENTS_EDITEDBY和COMMENTS_CANCELEDBY發(fā)生的時(shí)間 ORIGINALAMOUNT：記錄時(shí)輸液袋內(nèi)剩余液體量 ORIGINALRATE：最初輸液速率
6 NOTEEVENTS——病人醫(yī)療文書資料 該表格包括以下信息（與上面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) CHARTTIME：記錄時(shí)間 CATEGORY：文書類別，包括出院錄，ECG報(bào)告，心超報(bào)告balabala… DEION：對(duì)CATEGORY的進(jìn)一步解釋，比如radiology類別下的MRATHORACICSPINE檢查報(bào)告 CGID：文書錄入醫(yī)護(hù)人員 ISERROR：錯(cuò)誤提醒。當(dāng)顯示為1時(shí)，表示此處被標(biāo)記為此處醫(yī)師認(rèn)為存在錯(cuò)誤，否則顯示為NULL TEXT：文書具體內(nèi)容
7 OUTPUTEVENTS——病人出量信息 該表格包括以下信息（與上面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) ICUSTAY_ID：ICU病案號(hào) CHARTTIME：記錄時(shí)間 ITEMID：項(xiàng)目標(biāo)志符 VALUE：自上次記錄時(shí)間到現(xiàn)在液體出量 VALUEUOM：出量單位 STORETIME：錄入數(shù)據(jù)上傳至信息系統(tǒng)及確認(rèn)時(shí)間 CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符 STOPPED：輸液是否中斷 NEWBOTTLE：新液體準(zhǔn)備狀態(tài) ISERROR：錯(cuò)誤提醒。
8 PROCEDUREEVENTS_MV—Metavision系統(tǒng)的操作信息 該表格包括以下信息（與上面重復(fù)的部分，我就介紹地簡(jiǎn)略一些） ROW_ID：行號(hào) SUBJECT_ID：住院號(hào) HADM_ID：病案號(hào) ICUSTAY_ID：ICU病案號(hào) STARTTIME：操作或手術(shù)開始時(shí)間 ENDTIME：操作或手術(shù)結(jié)束時(shí)間 ITEMID：項(xiàng)目標(biāo)志符 VALUE：ITEMID對(duì)應(yīng)項(xiàng)目值 VALUEUOM：VALUE值如有單位，則顯示其單位，否則為NULL LOCATION：通路部位，如無則顯示為NULL LOCATIONCATEGORY：LOCATION所屬目錄 STORETIME：錄入數(shù)據(jù)上傳至信息系統(tǒng)及確認(rèn)時(shí)間 CGID：護(hù)理人員標(biāo)志符 LINKORDERID：藥品組合標(biāo)志符 ORDERID：LINKORDERID下的藥品組合給藥速率標(biāo)志符 ORDERCATEGORYNAME：所給藥品一級(jí)分類目錄名 SECONDARYORDERCATEGORYNAME：所給藥品次級(jí)分類目錄名 ORDERCATEGORYDEION：所給藥品類型 ISOPENBAG：表示輸液袋是否已打開 CONTINUEINNEXTDEPT：出科后是否續(xù)藥。 CANCELREASON：醫(yī)囑取消原因 STATUSDEION：醫(yī)囑狀態(tài) COMMENTS_EDITEDBY：操作或手術(shù)修改標(biāo)記，顯示為操作者頭銜 COMMENTS_CANCELEDBY：操作或手術(shù)取消標(biāo)記，顯示為操作者頭銜 COMMENTS_DATE：COMMENTS_EDITEDBY和COMMENTS_CANCELEDBY發(fā)生的時(shí)間
那么到這里，第2部分的8張大表我們就介紹完了，下一期我們將繼續(xù)學(xué)習(xí)剩下的大表。 我是ANGUS，我們下一期再見。 “醫(yī)學(xué)方”始終致力于服務(wù)“醫(yī)學(xué)人”，將最前沿、最有價(jià)值的臨床、科研原創(chuàng)文章推送給各位臨床醫(yī)師、科研人員 |
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