新型冠狀病毒已感染超過75000人，并傳播到20多個國家。 尚不清楚該病毒的進化速度以及該病毒與肺中其他微生物的相互作用方式。有研究人員對8例患者、25例社區(qū)獲得性肺炎患者及20例健康人員的支氣管肺泡灌洗液進行了轉錄組測序。在感染新型冠狀病毒的患者中，宿主內部變異的中位數(shù)為1-4，不同樣本中的變異范圍為0到51。 基因上的變異體分布與群體數(shù)據(jù)（110個序列）中觀察到的相似。然而，在人群中觀察到的宿主內部變體很少為多態(tài)性，這暗示了病毒傳播過程中的瓶頸或純化選擇，或者是當前多態(tài)性數(shù)據(jù)所代表的有限多樣性的結果。盡管目前的證據(jù)不支持宿主內變異體在人與人之間的傳播，但也不應忽視這一風險。新型冠狀病毒感染患者中的微生物群與CAP中的微生物群相似，要么是由病原體主導，要么是口腔和上呼吸道共生細菌水平升高。新型冠狀病毒在感染后會在體內進化，這可能會影響其毒力、傳染性和可傳播性。盡管宿主內變異體如何在人群中傳播尚不清楚，但有必要加強對人群中病毒進化和相關臨床變化的監(jiān)測。

以上內容僅供內部學習交流，特別感謝Zijie Shen等學者的研究報告《Genomic diversity of SARS-Cov-2 in Coronavirus Disease 2019 patients》。