疾病相關(guān)基因有哪些，查這幾個網(wǎng)站就夠了！

昵稱69125444 2020-04-13

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疾病已知的相關(guān)基因到底有哪些？一篇篇去讀綜述和文獻實在耗時耗力！今天小編為大家介紹幾個在線數(shù)據(jù)庫，輕松幫您查基因！

Phenopedia數(shù)據(jù)庫

網(wǎng)址：https://phgkb./PHGKB/startPagePhenoPedia.action

簡介：Phenopedia數(shù)據(jù)庫基于疾病關(guān)聯(lián)研究文章，進行基因關(guān)鍵詞的頻次統(tǒng)計。

參考文獻：Wei Yu, Melinda Clyne, Muin J. Khoury and Marta Gwinn. Phenopedia and Genopedia: Disease-centered and Gene-centered Views of the Evolving Knowledge of Human Genetic Associations. Bioinformatics, doi:10.1093/bioinformatics/btp618.

查詢頁面（輸入疾病名稱）

結(jié)果頁面：基因按搜索到的關(guān)聯(lián)研究文章數(shù)目排序，基因列表可以下載，點擊數(shù)字可以鏈接pubmed相應(yīng)文章

Disgenet數(shù)據(jù)庫

網(wǎng)址：https://www./search

簡介：基于文獻和數(shù)據(jù)庫挖掘，對疾病相關(guān)基因進行檢索，涉及到罕見變異和復(fù)雜多態(tài)關(guān)聯(lián)的多個數(shù)據(jù)庫。

參考文獻：Pi?ero et al., 2016 , Pi?ero et al., 2015 , Bauer-Mehren et al., 2011 and Bauer-Mehrenet al., 2010 .

查詢頁面：輸入疾病名稱

結(jié)果頁面

點擊第一個summary可以查詢相關(guān)基因的詳細信息（包括基因的注釋和相關(guān)文獻等）

PolySearch2數(shù)據(jù)庫

網(wǎng)址：http://polysearch.cs./polysearch

簡介：PolySearch 2.0 (PolySearch .ca)是一個在線文本挖掘系統(tǒng)，用于識別人類疾病、基因、蛋白質(zhì)、藥物、代謝物、毒素、代謝途徑、器官、組織、亞細胞細胞器、積極健康效應(yīng)、消極健康效應(yīng)、藥物作用、GO terms、網(wǎng)格術(shù)語、ICD-10醫(yī)學(xué)編碼、生物分類法和化學(xué)分類法之間的關(guān)系。PolySearch 2.0支持廣義的“給定X，查找所有相關(guān)的Y”查詢，其中X和Y可以從上述生物醫(yī)學(xué)實體中選擇。

參考文獻：Liu Y., Liang Y., Wishart D.S. (2015) PolySearch 2.0: A significantly improved text-mining system for discovering associations between human diseases, genes, drugs, metabolites, toxins, and more. Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(Web Server Issue):W535-42.

查詢頁面(設(shè)定查找高血壓相關(guān)的所有基因和蛋白) （當然可以參考簡介查詢其他更多的內(nèi)容）

結(jié)果頁面（依據(jù)ZSCORE打分排序，Hits可以查看具體的文獻相關(guān)內(nèi)容，Details可以查詢基因的具體信息）

KEGG Disease數(shù)據(jù)庫

網(wǎng)址：https://www./kegg/disease/

簡介：在KEGG中，疾病被視為分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的擾動狀態(tài)。疾病的遺傳，環(huán)境因素以及藥物，被認為是這個系統(tǒng)的擾動。不同類型的疾病，包括單基因(單基因)疾病、多因素疾病和傳染病，都是通過積累這些擾動及其相互作用而得到統(tǒng)一調(diào)控的。

查詢頁面：輸入疾病名稱