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單細胞測序在腫瘤、發(fā)育生物學、免疫學、神經科學、大規(guī)模細胞圖譜構建、細胞亞群細化&稀有細胞類型鑒定等領域有重要應用，是目前研究的焦點。 腫瘤 2019.10.7 研究小組使用類器官技術和單細胞RNA測序研究膀胱癌 西班牙國家癌癥研究中心（CNIO）的帕科·雷爾（Paco Real）領導的上皮癌變研究小組的科學家已經使用創(chuàng)新的類器官技術來實現(xiàn)小鼠尿路上皮細胞穩(wěn)定，長期培養(yǎng)。隨后，他們通過對單個細胞的RNA進行測序來表征類器官，并鑒定出少量的干細胞（增殖細胞），這些細胞產生了類器官，目前尚無法研究。這將開創(chuàng)泌尿系統(tǒng)疾病研究的新紀元。該研究發(fā)表在《自然通訊》雜志上。 DOI：10.1038 / s41467-019-12307-1 2018.11.30 研究人員使用優(yōu)化的單細胞多組學測序來更好地了解結腸癌腫瘤的異質性 與中國多個機構有聯(lián)系的一組研究人員發(fā)現(xiàn)，使用優(yōu)化的單細胞多組學測序可以更好地揭示結腸癌腫瘤的異質性。該小組在《科學》雜志上發(fā)表的論文中描述了他們了解結直腸癌進展的獨特方法。 研究人員指出，大多數大腸癌進展的遺傳研究都涉及基因表達。他們建議需要更多的研究來了解結直腸腫瘤如何轉移。為此，他們開發(fā)了一種測序方法，可同時分析單個細胞中的拷貝數變異，甲基化和基因表達-該方法將單細胞測序數據與來自染色體構象，表觀遺傳數據和腫瘤細胞其他特征的信息結合在一起。 DOI：10.1126 / science.aao3791 2018.11.28 單細胞測序揭示了為什么癌癥會在特定細胞類型中形成 一項稱為單細胞RNA測序的革命性新技術使研究人員能夠研究單個細胞中的基因表達，從而消除了污染的細胞樣品和取平均值的問題。伊利諾伊大學芝加哥分校的研究人員組裝了一個Drop-seq儀器，以分離發(fā)育中的果蠅的眼睛細胞，實驗室將其用作模型系統(tǒng)。然后，他們能夠研究眼睛中成千上萬個不同細胞中RB基因突變引起的基因表達變化，而不是具有正常RB基因拷貝的細胞中的基因表達。他們的結果發(fā)表在《自然通訊》上。這是一項真正的革命性技術，有望為癌癥的起源以及某些癌癥為何起源于某些細胞類型而非其他癌癥提供新的認識。 DOI：10.1038 / s41467-018-07540-z 2018.11.28 單細胞測序揭示了為什么特定細胞類型會形成癌癥 一項稱為單細胞RNA測序的革命性新技術使研究人員能夠研究單個細胞中的基因表達，從而消除了污染的細胞樣品和取平均值的問題。Frolov的實驗室采用了一種稱為Drop-seq的技術，該技術可使研究人員分離單細胞并對其進行基因測序。Drop-seq可以同時對數千個單個細胞進行測序。他們的結果發(fā)表在《自然通訊》上。 DOI：10.1038 / s41467-018-07540-z 2017.3.30 單細胞RNA測序揭示兩種主要類型腦腫瘤的詳細組成 對兩種腦腫瘤亞型的詳細分析顯示，它們可能起源于相同類型的神經祖細胞，并通過基因突變模式和其微環(huán)境的組成加以區(qū)分。由麻省總醫(yī)院（MGH）和麻省理工學院和哈佛大學博德研究所的研究人員領導的一項研究結果將于3月31日出版的《科學》雜志上發(fā)表。 DOI：10.1126 / science.aai8478 發(fā)育生物學 2020.5.13 深入了解腸道激素 干細胞與發(fā)育生物學研究所的研究人員對腸道中產生人類激素的細胞進行了深入的描述。結果發(fā)表在科學雜志《細胞》上在5月13日。研究人員開發(fā)了一個廣泛的工具箱，可以研究實驗室中生長的稱為類器官的小腸內人類激素產生細胞。這些發(fā)現(xiàn)為治療2型糖尿病和肥胖癥等疾病提供了潛在的新途徑。研究人員首次使用稱為單細胞測序的技術描述了在不同類型的人類腸內分泌細胞中有活性的所有基因。基于這些數據，他們創(chuàng)建了迄今為止對人類腸內分泌細胞不同亞型最深刻見解的地圖集。該圖集揭示了對腸內分泌細胞功能至關重要的基因的活性。 DOI：10.1016 / j.cell.2020.04.036 2019.8.22 研究人員使用單細胞測序來更好地了解人類胚胎植入 中國多個機構的一組研究人員使用單細胞測序技術來了解子宮植入過程中有關人類胚胎的更多信息。該小組在《自然》雜志上發(fā)表的論文中描述了從植入前，植入中和植入后對數千個人類胚胎細胞進行測序的過程，以及他們從中學到的知識。 DOI：10.1038 / s41586-019-1500-0 神經科學 2018.6.29 使用新的單細胞測序技術揭示復雜的大腦回路 希望之城的子公司轉化基因組學研究所的研究人員與硅谷的一家名為Circuit Therapeutics Inc.的初創(chuàng)公司結合在一起，在大腦內部深深地觀察了一種稱為紋狀體的結構，該結構負責控制人的運動方式，但也有助于大腦的決策和動作的啟動。通過使用單細胞RNA測序，該小組重新定義了對MSN細胞工作方式的先前了解，并將其添加到先前使用較舊技術通過研究大量紋狀體組織分析基因表達而發(fā)現(xiàn)的MSN標記基因列表中。該研究發(fā)表在《細胞神經科學前沿》雜志中。 DOI：10.3389 / fncel.2018.00159 免疫學 2017.3.30 研究人員使用單細胞測序來了解細胞如何老化 歐洲生物信息學研究所（EMBL-EBI），劍橋大學，惠康信托基金會桑格研究所和英國癌癥研究中心英國劍橋研究所（CRUK-CI）的研究人員闡明了關于免疫系統(tǒng)為什么會隨著年齡增長而減弱的長期爭論。他們的發(fā)現(xiàn)發(fā)表在《科學》（Science）雜志上，表明與較年輕的免疫細胞相比，較老的組織中的免疫細胞缺乏協(xié)調性，并且基因表達的變異性更大。跨學科研究為更深入探索不同類型細胞衰老的機制鋪平了道路。它還說明了單細胞測序的潛力，可以使人們對細胞的發(fā)育和活性有更深入的了解。 DOI: 10.1126/science.aah4115 2016.3.7 免疫學符合單細胞測序 惠康基因組園區(qū)單細胞基因組學中心的研究可能會改變我們看待基因表達和免疫反應的方式。新方法TraCeR 在《自然方法》上發(fā)表，為研究免疫應答、疫苗接種、癌癥和自身免疫性提供了強大的工具。 DOI：10.1038 / nmeth.3800 2016.2.15 通過單細胞RNA測序發(fā)現(xiàn)了ILC免疫細胞的新亞組 在發(fā)表于“ 自然免疫學 ”雜志上的一項新研究中，對相對新發(fā)現(xiàn)的一組稱為ILC的免疫細胞進行了詳細的研究。通過分析單個扁桃體細胞中的基因表達，瑞典Karolinska研究所的科學家發(fā)現(xiàn)了三個以前未知的ILC亞組，并揭示了這些細胞如何在人體中發(fā)揮作用。 DOI：10.1038 / ni.3368 大規(guī)模細胞圖譜構建 2016.11.10 單細胞測序對正在發(fā)育的小鼠心臟進行普查 哈佛大學醫(yī)學院領導的研究人員從小鼠胚胎發(fā)育的七個不同階段對心臟細胞進行了采樣。他們使用最新的單細胞RNA測序技術，將細胞分為三個已知類別：心肌細胞或心肌細胞；形成血管的內皮細胞；和成纖維細胞將一切結合在一起-并觀察其遺傳活性隨時間變化。該結果發(fā)表在《發(fā)育細胞》上，有助于闡明每個時間段心臟各部分中存在哪些細胞類型，并揭示先前未知的細胞類型。研究人員還描述了具有導致人類先天性心臟缺陷的基因突變的小鼠中特定細胞類型的錯誤。 DOI：10.1016 / j.devcel.2016.10.001 細胞亞型細化 2018.7.18 單細胞RNA測序產生新的視網膜神經節(jié)細胞亞型 康涅狄格大學健康中心（UConn Health）和杰克遜實驗室（JAX）的研究人員已經鑒定出40種亞型的視網膜神經節(jié)細胞（RGC）以及區(qū)分它們的遺傳標記和轉錄因子。他們的研究發(fā)表在《自然通訊》上，為生物學中的一個大問題提供了新的精確度：什么構成細胞類型或亞型？ DOI：10.1038 / s41467-018-05134-3 |
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