原文作者：Jeffrey M. Perkel

像參考文獻(xiàn)管理軟件這種實(shí)用性工具都能讓用戶(hù)產(chǎn)生很大的反響。拿醫(yī)生Ben Goldacre的例子來(lái)說(shuō)，他在自己的推特上提到過(guò)至少五次Paperpile（一種與谷歌文檔高度集成的訂閱型文獻(xiàn)管理器），稱(chēng)贊它“太棒了”“妙極了，史上最佳”“好用到讓人不·敢·相·信”。Goldacre是英國(guó)牛津大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心數(shù)據(jù)實(shí)驗(yàn)室的主任，他解釋說(shuō)：“Paperpile不會(huì)讓我經(jīng)常因?yàn)槌鲭x憤怒而想給自己的臉上來(lái)那么一拳，我還是第一次用到這樣的文獻(xiàn)管理器。它杰出而完美?！?/p>

繪圖：The Project Twins

這是因?yàn)镻aperpile與Goldacre團(tuán)隊(duì)的工作流程非常契合。參考文獻(xiàn)管理軟件，又稱(chēng)引文管理器，可以執(zhí)行一系列互相關(guān)聯(lián)的功能：檢索文獻(xiàn)、儲(chǔ)存與整理論文及其補(bǔ)充材料的PDF文件、生成參考文獻(xiàn)、培養(yǎng)合作關(guān)系。該類(lèi)軟件的數(shù)量有幾十種之多，如EndNote、Mendeley Reference Manager、ReadCube Papers、RefWorks、Sciwheel和Zotero。（ReadCube Papers是由Digital Science提供支持的，Digital Science是《自然》出版商施普林格·自然的大股東霍爾茨布林克出版集團(tuán)旗下的一員。）

Goldacre團(tuán)隊(duì)用谷歌文檔合作撰寫(xiě)文章，因此對(duì)他而言，Paperpile與谷歌之間的無(wú)縫銜接讓他把選擇的天平傾向了這款軟件。而對(duì)于研究微生物組如何影響妊娠的博士生Emily Wissel來(lái)說(shuō)，較之其它選項(xiàng)，Zotero免費(fèi)、開(kāi)源的特性使她對(duì)其青眼有加。

為了在她美國(guó)埃默里大學(xué)的博士項(xiàng)目中取得進(jìn)展，Wissel需要通過(guò)系里要求的資格考試，那時(shí)她在引文方面遇到了困難。她之前用的一直都是谷歌學(xué)術(shù)搜索，但它只能導(dǎo)出少數(shù)幾種參考文獻(xiàn)的引用格式，而她的考試則要用到一種谷歌學(xué)術(shù)不支持的格式。Wissel沒(méi)有時(shí)間去學(xué)習(xí)使用新的軟件了，因此，她求助于在線(xiàn)參考文獻(xiàn)生成器，并且“盡可能地少引用，以減輕自己的痛苦”。數(shù)周以后，在一位大學(xué)圖書(shū)館員的建議下，她開(kāi)始用Zotero在一份網(wǎng)絡(luò)雜志里插入引文，當(dāng)時(shí)她在推特上有感而發(fā)：“我為何時(shí)至今日才開(kāi)始使用引文管理器？？”

Michael Francavilla是美國(guó)費(fèi)城兒童醫(yī)院放射科的一名兒科醫(yī)生，他把文獻(xiàn)管理器當(dāng)作電子大腦——用它儲(chǔ)存自己從經(jīng)手的病例中學(xué)到的東西，還能保存可用來(lái)與病人和實(shí)習(xí)醫(yī)生共享的圖像化信息?！坝谢驔](méi)有這樣的軟件簡(jiǎn)直是天差地別?！彼f(shuō)。

Francavilla在2018年發(fā)表的一篇綜述（M. L. Francavilla Pediatr. Radiol. 48, 1393–1398; 2018）里，列舉了在選擇文獻(xiàn)管理器時(shí)應(yīng)考慮的一些基本指標(biāo)（各文獻(xiàn)管理器測(cè)評(píng)匯總詳見(jiàn)附表）。這些變量包括：花費(fèi)、云存儲(chǔ)的限制、操作系統(tǒng)兼容性以及對(duì)PDF文件添加注釋的支持。

一般來(lái)說(shuō)，文獻(xiàn)管理器是擁有對(duì)應(yīng)網(wǎng)絡(luò)界面的桌面應(yīng)用程序，它允許研究者遠(yuǎn)程訪(fǎng)問(wèn)自己的個(gè)人“學(xué)術(shù)文獻(xiàn)庫(kù)”，即經(jīng)過(guò)整理的參考文獻(xiàn)及其PDF文件的列表。此外，用戶(hù)還能通過(guò)瀏覽器插件輕松地從期刊頁(yè)面或其它的網(wǎng)上來(lái)源導(dǎo)入?yún)⒖嘉墨I(xiàn)。有些文獻(xiàn)管理器（包括Paperpile、RefWorks和Sciwheel）是完全基于網(wǎng)絡(luò)的，這意味著用戶(hù)不需要安裝或云同步。它們之中的大多數(shù)都提供移動(dòng)端應(yīng)用程序，讓用戶(hù)可以在自己的智能手機(jī)或平板電腦上閱讀及添加文獻(xiàn)。

Juliana Soares Lima是巴西塞阿拉聯(lián)邦大學(xué)的一名參考咨詢(xún)圖書(shū)館員，她還是Mendeley的軟件顧問(wèn)，即志愿為Mendeley文獻(xiàn)管理器從事地方推廣的工作。Lima在使用其移動(dòng)應(yīng)用的時(shí)候發(fā)現(xiàn)，它可以便捷地保存自己在推特上找到的文獻(xiàn)，這對(duì)她的博士論文有所助益（其它文獻(xiàn)管理器也有此功能）?！霸撥浖兄谧粉檶W(xué)界新近發(fā)表且經(jīng)過(guò)整理的文獻(xiàn)?！彼f(shuō)。

大多數(shù)文獻(xiàn)管理器都允許用戶(hù)使用文件夾與標(biāo)簽來(lái)管理自己的文獻(xiàn)庫(kù)，它們還能通過(guò)作者名、關(guān)鍵詞、正文和注解進(jìn)行檢索。內(nèi)置的PDF查看器讓用戶(hù)可以瀏覽文件，并以突出顯示關(guān)鍵段落及做筆記的方式對(duì)它們做注釋。外部搜索功能則可以讓用戶(hù)從PubMed或谷歌學(xué)術(shù)之類(lèi)的地方導(dǎo)入文章，或者拿Mendeley來(lái)說(shuō)，它自己就擁有一個(gè)超過(guò)1億篇論文的專(zhuān)門(mén)目錄。ReadCube Papers提供一項(xiàng)名為“增強(qiáng)式PDF”的體驗(yàn)，它用補(bǔ)充材料和超鏈接來(lái)對(duì)PDF文件進(jìn)行完善。

一些文獻(xiàn)管理工具會(huì)根據(jù)用戶(hù)文獻(xiàn)庫(kù)中已有的內(nèi)容，來(lái)向用戶(hù)推薦他們可能感興趣的論文。Sciwheel可以在檢索中標(biāo)記出被一項(xiàng)叫作Faculty Opinions的評(píng)級(jí)服務(wù)推薦過(guò)的文章，還能根據(jù)作者正在寫(xiě)的文本提出建議。RefWorks則是與一個(gè)名為L(zhǎng)eganto的文獻(xiàn)推薦工具集成在一起，Leganto能讓用戶(hù)將編制好的閱讀清單直接導(dǎo)入到RefWorks的文獻(xiàn)庫(kù)中。Zotero提供的插件是通過(guò)開(kāi)放獲取數(shù)據(jù)庫(kù)Unpaywall來(lái)查找PDF文件的，Zotero還與博客“撤稿觀(guān)察”（Retraction Watch）合作，因而能標(biāo)記已被撤稿的論文；ReadCube也有此功能。根據(jù)艾利貝斯集團(tuán)（Ex Libris）產(chǎn)品經(jīng)理Shalhevet Bar-Asher的說(shuō)法，RefWorks正在添加對(duì)Unpaywall的集成。艾利貝斯集團(tuán)是RefWorks的開(kāi)發(fā)者，總部位于以色列耶路撒冷。

文獻(xiàn)管理器主要是組織管理工具，但對(duì)許多用戶(hù)而言，它們真正不可或缺的功能與組織管理無(wú)關(guān)。

例如，文獻(xiàn)管理器與文字處理軟件的集成，能讓用戶(hù)在寫(xiě)作的過(guò)程中查找引文并將其插入到文檔里；此外，只需輕點(diǎn)鼠標(biāo)，用戶(hù)就能以數(shù)千種期刊格式中的任意一種建立參考文獻(xiàn)列表并排版。如果沒(méi)有這樣的工具，即便只是小幅度的修改都可能讓文稿變得一團(tuán)糟，更不用說(shuō)為不同的期刊修改論文格式了。“那真有可能像噩夢(mèng)一樣?！睘醺蛇_(dá)Busitema大學(xué)的生物化學(xué)家Yahaya Gavamukulya如是說(shuō)。

Gillian Neff是美國(guó)費(fèi)城科睿唯安（Clarivate）負(fù)責(zé)EndNote桌面版的產(chǎn)品經(jīng)理，據(jù)她說(shuō)，該軟件自從1993年開(kāi)始就提供微軟Word的插件了。很多其它產(chǎn)品也紛紛效法：Paperpile、Sciwheel、Zotero、ReadCube Papers和RefWorks全部支持谷歌文檔，其中后兩者和Mendeley文獻(xiàn)管理器還支持網(wǎng)頁(yè)版的Word。Sciwheel則正在開(kāi)發(fā)這項(xiàng)功能。

Barbara Rochen Renner是美國(guó)北卡羅來(lái)納大學(xué)教堂山分校的圖書(shū)館員，她認(rèn)為文獻(xiàn)管理器為團(tuán)隊(duì)工作提供的支持正變得越來(lái)越重要?！拔乙欢〞?huì)強(qiáng)烈建議研究者好好考慮某件產(chǎn)品在他們所做的、預(yù)期要做的、或是希望做的那類(lèi)協(xié)作上，能提供多大的幫助?！?/p>

通常，文獻(xiàn)管理器允許研究者將自己的整個(gè)文獻(xiàn)庫(kù)或者其中一部分與同行共享，這在他們以團(tuán)隊(duì)或共享知識(shí)庫(kù)的形式共同撰寫(xiě)論文的時(shí)候可以派上用場(chǎng)。盧森堡大學(xué)的Sean Takats自2006年開(kāi)始就負(fù)責(zé)Zotero的開(kāi)發(fā)工作，據(jù)他介紹，截至今年五月，Zotero的用戶(hù)已經(jīng)創(chuàng)建了大約200萬(wàn)個(gè)公共和私人群組。像PDF文件這樣的附件共享一般來(lái)說(shuō)是為私人團(tuán)隊(duì)保留的功能，這類(lèi)群組的大小可以從Mendeley的25人到Sciwheel的150人，而Paperpile、RefWorks和Zotero的群組大小則沒(méi)有上限。

Sciwheel的執(zhí)行董事Tiago Barros稱(chēng)，除了文獻(xiàn)庫(kù)共享，他們的軟件還包括了項(xiàng)目共享、論文共享以及稿件的版本控制這些功能。另外，根據(jù)ReadCube Papers和EndNote的公司代表們的說(shuō)法，他們的產(chǎn)品正著手開(kāi)發(fā)在參考文獻(xiàn)庫(kù)中加入主題討論的功能。因?yàn)樾鹿谝咔?，“?dāng)下正值每個(gè)人都需要齊心協(xié)力做研究的時(shí)刻，而且我們還得在無(wú)法比鄰而坐的情況下做到這一點(diǎn)?！盢eff說(shuō)道。

文獻(xiàn)管理器每項(xiàng)功能的重要性因人而異。2018年，Renner與他人合著的一篇論文（L. Murphree et al. Med. Ref. Serv. Q. 37, 219–233; 2018）顯示了不同用戶(hù)是如何對(duì)同一款軟件產(chǎn)生不同的功能需求的。舉例來(lái)說(shuō)，醫(yī)生比較重視的功能可能有通過(guò)移動(dòng)端的訪(fǎng)問(wèn)、以及在下班回家后也可以使用的參考文獻(xiàn)庫(kù)，而濕實(shí)驗(yàn)室的研究人員則更青睞團(tuán)隊(duì)寫(xiě)作、文獻(xiàn)推薦和程序的離線(xiàn)使用這些功能。

對(duì)Gavamukulya來(lái)說(shuō)，文獻(xiàn)管理器的選擇主要取決于花費(fèi)。在撰寫(xiě)碩士論文的時(shí)候，他試用過(guò)EndNote，但因?yàn)镸endeley能夠滿(mǎn)足他的需求，而且還是免費(fèi)的，他最終選擇了后者?！爸匾氖?，它集成有不同的文字處理器，而且用它從網(wǎng)上導(dǎo)入?yún)⒖嘉墨I(xiàn)也很容易?！盙avamukulya說(shuō)，他現(xiàn)在也是Mendeley的軟件顧問(wèn)。

Francavilla用的是Sciwheel——他所在的系里選用的文獻(xiàn)管理軟件。這是同時(shí)基于價(jià)格與實(shí)用性所做的決定：因?yàn)镾ciwheel是網(wǎng)頁(yè)式工具，團(tuán)隊(duì)成員無(wú)需安裝就可以隨時(shí)隨地使用它。不過(guò)他向其他人推薦的是Mendeley：它和Zotero一樣是免費(fèi)的，但還提供2GB的網(wǎng)絡(luò)存儲(chǔ)空間（Zotero將附件大小限制在300MB，用戶(hù)可以通過(guò)每年最少20美元的付費(fèi)來(lái)獲取額外的儲(chǔ)存空間）。

至于那些只想創(chuàng)建參考文獻(xiàn)列表的研究者，他們還有其它選擇：BibTeX用于以L(fǎng)aTeX排版系統(tǒng)生成的文檔，而基于GitHub的編寫(xiě)工具M(jìn)anubot則用于以格式化語(yǔ)言Markdown寫(xiě)出來(lái)的文件。

此外，還有在線(xiàn)參考文獻(xiàn)生成器。例如，免費(fèi)的網(wǎng)頁(yè)工具ZoteroBib可以讓用戶(hù)從將近一萬(wàn)種期刊格式里選取一種，來(lái)建立文獻(xiàn)列表并對(duì)其進(jìn)行排版，然后他們就可以把結(jié)果復(fù)制到剪貼板上或是直接發(fā)布在網(wǎng)上。

在選擇參考文獻(xiàn)管理工具時(shí)，請(qǐng)考慮你和你的合作伙伴的工作流程。需要考慮的其它因素還有易用性、客戶(hù)支持以及在不同軟件之間轉(zhuǎn)移資料的難易度。而Renner給出的建議是咨詢(xún)圖書(shū)館員。“如果你是新手，而且不是凡事都喜歡單干的那類(lèi)人，那么你大概想要了解你可以得到哪些支持、什么是免費(fèi)的，還有大部分實(shí)驗(yàn)室用的又是什么工具?！?/p>