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      【2017-24期】This Week in Extracellular Vesicles

       hzangs 2020-11-06

      1.  MLKL, the Protein that Mediates Necroptosis, Also Regulates Endosomal Trafficking and Extracellular Vesicle Generation. 調(diào)控細(xì)胞壞死的MLKL基因促進(jìn)外泌體的產(chǎn)生,促進(jìn)細(xì)胞生存。 [Immunity] IF=24.08  PMID:28666573

      摘要:假蛋白酶混合譜系激酶結(jié)構(gòu)域(MLKL)在蛋白激酶RIPK3磷酸化后的激活會(huì)觸發(fā)壞死性凋亡,這是一種程序性細(xì)胞死亡形式,其中細(xì)胞膜破裂造成細(xì)胞內(nèi)成分的釋放。我們研究發(fā)現(xiàn)MLKL還與內(nèi)體相關(guān)并控制內(nèi)吞蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn),從而增強(qiáng)受體和配體的降解,調(diào)節(jié)其誘導(dǎo)的信號(hào)并促進(jìn)細(xì)胞外囊泡的產(chǎn)生。這種作用存在兩個(gè)不同的狀態(tài):獨(dú)立于RIPK3的組成型和由RIPK3觸發(fā)的增強(qiáng)的,后一種狀態(tài)下MLKL與內(nèi)體的關(guān)聯(lián)回增強(qiáng),MLKL會(huì)結(jié)合運(yùn)輸所需的內(nèi)體分選復(fù)合物(ESCRT),并與它們一起進(jìn)入囊泡,脫離細(xì)胞。我們認(rèn)為磷酸化MLKL在細(xì)胞外囊泡中的釋放是作為細(xì)胞自身限制這種蛋白質(zhì)誘導(dǎo)壞死活性的機(jī)制。

      PS:這是一篇涉及到細(xì)胞外囊泡分選機(jī)制的文章,文章報(bào)道了MLKL可以被內(nèi)體分選蛋白復(fù)合體結(jié)合進(jìn)入囊泡中,脫離細(xì)胞。很不錯(cuò)的一篇文章,值得大家讀一讀。

      2. Extracellular vesicles are independent metabolic units with asparaginase activity. 細(xì)胞外囊泡是一個(gè)獨(dú)立的代謝單元,能夠發(fā)揮天冬酰胺酶活性。 [Nat Chem Biol] IF=12.71  PMID:28671681

      摘要:細(xì)胞外囊泡(EVs)是涉及細(xì)胞與微環(huán)境之間和更廣泛范圍內(nèi)的生物活性分子交換的具膜納米顆粒。 盡管已經(jīng)有研究表明細(xì)胞可以通過EV傳播代謝酶,但是關(guān)于它們的內(nèi)EVs中的代謝活性仍然有待闡明。 因此,本文中我們?cè)u(píng)估了神經(jīng)干/祖細(xì)胞(NSC)來源的EVs消耗和產(chǎn)生代謝物的能力。 我們的代謝組學(xué)和功能分析顯示,EVs具有L-內(nèi)酰胺酶活性,這一活性是通過攜帶的天冬酰胺酶樣蛋白1(Asrgl1)實(shí)現(xiàn)的。 最重要的是,我們的數(shù)據(jù)顯示Asrgl1活性對(duì)天冬酰胺具有酶活性,而對(duì)谷氨酰胺沒有酶活性。 我們發(fā)現(xiàn)鼠和人類NSC產(chǎn)生的EVs均會(huì)運(yùn)輸Asrgl1。 我們的研究結(jié)果首次表明,NSC EVs能夠作為獨(dú)立的代謝單位,能夠修改微環(huán)境中關(guān)鍵營養(yǎng)物質(zhì)的濃度,并有可能影響其微環(huán)境的生理學(xué)。

      PS:囊泡作為生物活性成分的運(yùn)輸者,大量的paper報(bào)道集中在囊泡傳遞信號(hào)分子方面,而本文則重點(diǎn)介紹了囊泡作為一個(gè)獨(dú)立的代謝單位發(fā)揮代謝作用。這可能是之前的研究忽視的一點(diǎn),大量的酶類可能會(huì)被釋放到細(xì)胞外發(fā)揮功能,相信這方面會(huì)有更多的報(bào)道,我們拭目以待。

      3. The potential of endurance exercise-derived exosomes to treat metabolic diseases. 耐力運(yùn)動(dòng)誘導(dǎo)產(chǎn)生的外泌體具有治療代謝疾病的潛力。 [Nat Rev Endocrinol] IF=15.43 PMID:27230949

      摘要:已知耐力運(yùn)動(dòng)介導(dǎo)的多系統(tǒng)適應(yīng)性可減輕代謝相關(guān)疾病,如肥胖和2型糖尿?。═2DM)。然而,耐力運(yùn)動(dòng)促進(jìn)器官之間交叉通訊和整塑代謝作用的潛在分子機(jī)制仍不清楚。運(yùn)動(dòng)誘導(dǎo)骨骼肌和其他器官(統(tǒng)稱為“exerkine”)釋放的肽和核酸涉及這些系統(tǒng)反應(yīng)。兩種細(xì)胞外囊泡,外泌體和微囊泡已被證明含有參與各種生理和病理過程的蛋白質(zhì)和核酸。具體來說,外泌體已經(jīng)表現(xiàn)出能夠促進(jìn)細(xì)胞和組織之間的肽,微RNA,mRNA和線粒體DNA的交換。有趣的是,細(xì)胞外囊泡響應(yīng)耐力運(yùn)動(dòng),循環(huán)細(xì)胞外囊泡含量以強(qiáng)度依賴性方式增加。我們認(rèn)為運(yùn)動(dòng)對(duì)全身的益處是由外泌體和/或微泡以自分泌,旁分泌和/或內(nèi)分泌的方式起作用的。此外,我們認(rèn)為exerkine來源的天然或修飾的外泌體和/或微囊泡將在治療肥胖和T2DM方面具有治療效用。

      PS:之前向大家介紹過運(yùn)動(dòng)會(huì)帶來血漿外泌體含量的提升,這篇綜述則匯總了運(yùn)動(dòng)誘導(dǎo)囊泡增加,同時(shí)這些囊泡對(duì)身體產(chǎn)生益處的報(bào)道,同時(shí)認(rèn)為這些囊泡可能在代謝類疾病的治療中發(fā)揮功能。

      4. Rapid Isolation and Detection of Exosomes and Associated Biomarkers from Plasma. 快速分離檢測(cè)血漿中外泌體用于生物標(biāo)志物檢測(cè)。 [ACS Nano] IF=33 PMID:28671449

      摘要:在循環(huán)中的外泌體是重要的癌癥相關(guān)RNA和蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物的重要來源,它被給予希望用于早期檢測(cè),液體活檢和及時(shí)護(hù)理診斷應(yīng)用。然而,由于其體積?。?0-150nm)和密度低,所以從血漿中分離外泌體比較困難。目前常用的分離方法耗時(shí)耗力,不太可能轉(zhuǎn)化為診斷應(yīng)用程序。為了解決這個(gè)問題,我們開發(fā)了交流電動(dòng)(ACE)微陣列芯片裝置用來從未稀釋的人血漿樣品中快速分離和純化成膠質(zhì)細(xì)胞瘤外泌體。 ACE裝置指需要較少的血漿樣品(30-50μL),能夠在15分鐘內(nèi)將外泌體集中到ACE微電極周圍的高場(chǎng)區(qū)域,簡(jiǎn)單的緩沖洗滌可以去除大量的血液成分,使外泌體濃縮在微電極上。整個(gè)分離過程和芯片上的熒光分析在不到30分鐘內(nèi)即可完成,隨后可以在芯片上進(jìn)行外泌體蛋白免疫熒光檢測(cè),并為RT-PCR分析提供可靠的mRNA。這些結(jié)果證明了ACE設(shè)備能夠簡(jiǎn)化外泌體分離和純化過程,顯著減少了處理步驟和所需的時(shí)間。

      PS:利用類似電泳的方法富集外泌體,值得關(guān)注和學(xué)習(xí)一下哦,微流控芯片一直是外泌體純化方法中最有希望進(jìn)入臨床檢測(cè)的系統(tǒng),從事檢驗(yàn)工作的朋友可以關(guān)注一下這篇文章。

      5. Field-Free Isolation of Exosomes from Extracellular Vesicles by Microfluidic Viscoelastic Flows. 利用微流體粘彈性流動(dòng)建立電場(chǎng)磁場(chǎng)非依賴性的方法從細(xì)胞外囊泡中純化外泌體。 [ACS Nano] IF=13.33  PMID:28679045

      摘要:幾乎所有哺乳動(dòng)物細(xì)胞都會(huì)分泌的外泌體,它可以攜帶活性分子,被認(rèn)為是鑒定許多包括癌癥在內(nèi)的疾病潛在生物標(biāo)志物。 然而,由于外泌體的體積很?。?0-200nm),因此分離含有不同大小的各種細(xì)胞外泡(EV)的復(fù)合培養(yǎng)基時(shí)尤其是在小樣本體積中存在巨大的挑戰(zhàn)。 在這里,我們提出一種基于粘彈性的微流體系統(tǒng),以連續(xù),大小依賴和無標(biāo)記的方式從細(xì)胞培養(yǎng)基或血清直接分離外泌體。 使用少量生物相容性聚合物作為介質(zhì)中的添加劑來控制施加在EV上的粘彈性,我們能夠?qū)崿F(xiàn)外泌體的高純度(> 90%)和回收率(> 80%)的分離。本文所提出的技術(shù)可以作為多功能平臺(tái),以促進(jìn)不同生化應(yīng)用中的外泌體分析。

      PS:給予微流控芯片的有一種外泌體分離方法。

      6. Extracellular Vesicle Biology in the Pathogenesis of Lung Disease. 細(xì)胞外囊泡生物學(xué)與肺疾病病理。 [Am J Respir Crit Care Med] IF=20 PMID:28678586

      摘要:隨著我們對(duì)肺部疾病的了解不斷深入,我們認(rèn)識(shí)到促進(jìn)細(xì)胞/環(huán)境通信導(dǎo)致疾病發(fā)展的機(jī)制是十分復(fù)雜的。 2008年,研究人員首先發(fā)現(xiàn)了循環(huán)系統(tǒng)中完整的無細(xì)胞微小RNA中的一部分是位于被稱為細(xì)胞外囊泡(EVs)的脂質(zhì)包封的微泡內(nèi)。在這一發(fā)現(xiàn)前后,研究人員確定了EVs可能會(huì)促進(jìn)人類疾病和調(diào)整機(jī)體動(dòng)態(tài)平衡。EVs的膜結(jié)構(gòu)能夠保護(hù)包括蛋白質(zhì),miRNA和mRNA在內(nèi)的內(nèi)容物免于降解,E這些內(nèi)容物可以反映疾病發(fā)生的發(fā)病機(jī)制,并且可以在細(xì)胞之間發(fā)揮通信作用,改變受體細(xì)胞的功能。此外,已經(jīng)有報(bào)道在包括血,尿,痰和支氣管肺泡灌洗液等體液中檢測(cè)到EV。肺部在環(huán)境刺激和疾病發(fā)生發(fā)展過程中細(xì)胞釋放EV在疾病中增加了細(xì)胞間通訊的復(fù)雜性。雖然大多數(shù)涉及EVs的人類生物學(xué)研究實(shí)在癌癥中進(jìn)行,但是我們已經(jīng)看到在其他病理生理?xiàng)l件下基于EV的研究報(bào)道。 EV介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)在肺內(nèi)細(xì)胞間傳播促進(jìn)疾病發(fā)展將環(huán)境應(yīng)激因子與肺免疫反應(yīng)聯(lián)系起來。

      PS:這是一篇綜述文章,主要介紹了細(xì)胞外囊泡與肺部疾病之間的關(guān)系。

      7. Pathogenesis of pancreatic cancer exosome-induced lipolysis in adipose tissue. 胰腺癌細(xì)胞來源的外泌體誘導(dǎo)脂肪組織的脂肪分解的病理機(jī)制。 [Gut] IF= 14.92  PMID:26061593

      摘要:在胰腺癌(PC)出現(xiàn)臨床表現(xiàn)前幾個(gè)月發(fā)生的新發(fā)糖尿病和伴隨的體重減輕似乎是腫瘤分泌產(chǎn)物引起的伴隨作用。我們最近的研究結(jié)果表明,外泌體攜帶的腎上腺髓質(zhì)素(AM)在PC的糖尿病發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。脂肪組織的脂肪分解可能解釋PC早期發(fā)病過程中的體重下降。我們假設(shè)誘導(dǎo)脂肪分解的信號(hào)是由PC釋放的外泌體攜帶而來的,并且引起相應(yīng)伴隨作用。因此,在這項(xiàng)研究中,我們研究了PC分泌的外泌體是否能夠在脂肪細(xì)胞中誘導(dǎo)脂肪分解,并探討AM在PC外泌體中作為這種脂肪分解的介質(zhì)的作用。我們分離和表征了患者來源的細(xì)胞系釋放的外泌體和患有PC與非PC對(duì)照的患者血漿來源外泌體。將分化的鼠(3T3-L1)和人類脂肪細(xì)胞暴露于這些外泌體之下,使用甘油測(cè)定和蛋白質(zhì)印跡來檢測(cè)脂肪的分解。 Duolink測(cè)定用于研究用外泌體處理的脂肪細(xì)胞中的AM與腎上腺髓質(zhì)素受體(ADMR)相互作用。在鼠和人體脂肪細(xì)胞中,我們發(fā)現(xiàn)AM和PC-外泌體都會(huì)促進(jìn)脂肪分解。這一過程可以被ADMR阻斷。 AM與脂肪細(xì)胞上的受體相互作用,活化p38和ERK1 / 2,并通過磷酸化激素敏感性脂肪酶促進(jìn)脂肪分解。 PKH67-標(biāo)記的PC-外泌體很容易內(nèi)化到脂肪細(xì)胞,并涉及caveolin 和巨胞飲作用增強(qiáng)。PC分泌的外泌體在皮下脂肪組織中誘導(dǎo)脂解; 外泌體中的 AM是這種效應(yīng)的信號(hào)傳遞分子。

      PS:胰腺癌外泌體攜帶的分子調(diào)控脂肪細(xì)胞中脂肪的降解,從而解釋了胰腺癌發(fā)病前期出現(xiàn)的體重下降現(xiàn)象。

      8. Remote control of BBB: A tale of exosomes and microRNA. 對(duì)血腦屏障的遠(yuǎn)程控制:外泌體與microRNA的故事。 [Cell Res] IF=14.81  PMID:28674430

      摘要:外泌體介導(dǎo)的細(xì)胞間通訊已成為人類健康和疾病的新興研究領(lǐng)域。 Cell Research最近發(fā)表的一項(xiàng)研究報(bào)告指出,斑馬魚神經(jīng)元可通過分泌外泌體攜帶miR-132來遠(yuǎn)程調(diào)節(jié)血腦屏障完整性。

      PS:這是一篇評(píng)論性文章。主要針對(duì)的是前段時(shí)間由中科院上海生科院神經(jīng)所的老師發(fā)表在cell research上的一篇關(guān)于斑馬魚神經(jīng)元細(xì)胞釋放外泌體攜帶miR-132調(diào)控血腦屏障完整性的報(bào)道。該文章的思路很清晰,研究的內(nèi)容也相對(duì)比較完整和透徹,值得大家學(xué)習(xí)和借鑒。

      9. Extracellular vesicles in gastrointestinal cancer in conjunction with microbiota: On the border of Kingdoms. 腸胃腫瘤中細(xì)胞外囊泡與微生物共同作用:在身體王國與微生物王國邊界上的故事。 [Biochim Biophys Acta] IF=5.37  PMID:28669749

      摘要:后生動(dòng)物細(xì)胞產(chǎn)生細(xì)胞外泡(EV)是以及原核生物產(chǎn)生菌體外膜泡是生物的普遍特征。這些膜泡結(jié)構(gòu)具有攜帶蛋白質(zhì)的磷脂膜,包裹著DNA和不同類型的RNA,并作為信息快遞大量參與對(duì)靶細(xì)胞的細(xì)胞間通信。在過去十年中,由于研究技術(shù)方法的發(fā)展,研究者對(duì)EV的興趣愈發(fā)濃厚,對(duì)其在各種病理學(xué)中的作用進(jìn)行了廣泛的研究。本研究的重點(diǎn)是結(jié)合GI微生物群和炎性疾病評(píng)估EV對(duì)胃腸道(GI)癌癥的作用。我們還討論了近期關(guān)于EVs及其內(nèi)容作為胃癌早期診斷生物標(biāo)志物的前景。菌體外膜泡也涉及GI慢性炎性疾病的發(fā)病機(jī)制,然而,菌體外膜泡在腫瘤發(fā)生中的可能作用仍然被低估。我們認(rèn)為來自真核細(xì)胞以及來自不同微生物,真菌,寄生物種和胃腸道中被食用植物的EV都可以作為細(xì)胞內(nèi)和物種間通訊的介質(zhì),這些通訊過程特別促進(jìn)了腫瘤細(xì)胞存活和多藥物耐受??傊覀冋J(rèn)為通過EV蛋白質(zhì)組(可從公共數(shù)據(jù)庫獲得)與已知的微生物腸道細(xì)菌蛋白質(zhì)序列比對(duì)分析可用于鑒定進(jìn)化保守蛋白序列之間抗原模擬。使用這種方法我們確定了擬桿菌屬(Bacteroides spp)具有激活環(huán)的假性激酶與PDGFRα的同源性,提供了概念驗(yàn)證。我們推測(cè),“模擬”PDGFRα的微生物假性激酶的存在可能與真正的PDGFRα有關(guān)系,其在結(jié)直腸癌發(fā)生中作用有待進(jìn)一步研究。

      PS:文章的內(nèi)容可能不是很嚴(yán)謹(jǐn),獲得的結(jié)果可能不是十分可靠,但是文章的思路值得我們學(xué)習(xí)和思考。文章作者重點(diǎn)研究了胃腸系統(tǒng)囊泡攜帶的蛋白質(zhì)與細(xì)菌攜帶的蛋白質(zhì)的同源性,將其中相似度高的同源蛋白進(jìn)行分析,并提出合理猜測(cè)認(rèn)為這些相似的同源蛋白在胃腸癌癥的發(fā)展中可能存在功能和作用。

      10. Neutrophil-Derived Exosomes: A New Mechanism Contributing to Airway Smooth Muscle Remodeling. 中性粒細(xì)胞來源的外泌體:調(diào)控呼吸道平滑肌重塑的新機(jī)制。 [Am J Respir Cell Mol Biol] IF=13.20 PMID:27105177

      PS:這篇文章涉及到免疫細(xì)胞來源的外泌體對(duì)呼吸道平滑肌細(xì)胞的影響,專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的朋友可以關(guān)注一下。

      11. Adipocyte-derived exosomes promote lung cancer metastasis by increasing MMP9 activity via transferring MMP3 to lung cancer cells. 脂肪細(xì)胞來源外泌體通過傳遞MMP3到肺癌細(xì)胞促進(jìn)其MMP9的活性,最終促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。 [Oncotarget] IF=5.01  PMID:28674209

      PS:腫瘤基質(zhì)細(xì)胞的成分相對(duì)比較復(fù)雜,主要包括成纖維細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、間充質(zhì)干細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等,其中脂肪細(xì)胞是腫瘤基質(zhì)細(xì)胞中研究報(bào)道比較少的組分,這篇文章則關(guān)注到了脂肪細(xì)胞,同時(shí)研究的是脂肪細(xì)胞來源的外泌體所攜帶的蛋白成分具有的功能,值得大家了解和借鑒一下。

      另:Methods Mol Biol 最近發(fā)表了數(shù)篇新的細(xì)胞外囊泡領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)技術(shù)方法。需要的朋友不要錯(cuò)過哦。

      • Plasma Biomarker Identification and Quantification by Microparticle Proteomics.通過細(xì)胞外囊泡蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定和定量血漿中的生物標(biāo)志物。Methods Mol Biol. PMID: 28674905

      • Surface Profiling of Extracellular Vesicles from Plasma or Ascites Fluid Using DotScan Antibody Microarrays.利用抗體芯片分析血漿或腹水來源的細(xì)胞外囊泡表面蛋白成分。Methods Mol Biol. PMID: 28674892

      • Proteomics Analysis of Circulating Serum Exosomes.血液循環(huán)系統(tǒng)中外泌體的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。Methods Mol Biol. PMID: 28674889

      • Simultaneous Enrichment of Plasma Extracellular Vesicles and Glycoproteome for Studying Disease Biomarkers.同時(shí)富集血漿中的細(xì)胞外囊泡和糖蛋白組用于分析疾病的生物標(biāo)志物。Methods Mol Biol. PMID: 28674887

      • Targeted Approach for Proteomic Analysis of a Hidden Membrane Protein.隱性膜蛋白的組學(xué)分析辦法和靶向策略。Methods Mol Biol. PMID: 28674884

      • Proteomic Analysis of Blood Extracellular Vesicles in Cardiovascular Disease by LC-MS/MS Analysis.通過液相色譜-質(zhì)譜連用分析心血管疾病患者血液中細(xì)胞外囊泡的蛋白質(zhì)組學(xué)信息。Methods Mol Biol. PMID: 28674883

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