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       醫(yī)科研 2021-01-25

        

      歡迎來到醫(yī)科研,這里是白介素2的讀書筆記,跟我一起聊臨床與科研的故事, 生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘,R語言,TCGA、GEO, SEER數(shù)據(jù)挖掘。



      文獻1: Cancer cells exploit an orphan RNA to drive metastatic progression

      1. 腫瘤 Vs. 正常 (細胞系+組織+動物模型組織)small RNA-seq篩選 oncRNA 200+

      2. 高轉(zhuǎn)移細胞系 Vs. 低轉(zhuǎn)移細胞系篩選到最顯著的T3p,  細胞系驗證, TCGA驗證

      3. 細胞+動物體內(nèi)外功能驗證

      4. 結(jié)合蛋白-T3p-miRNA-下游靶基因

      5. 外泌體smRNA-seq驗證

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      7. T3p的預(yù)后診斷價值

      8. 啟示: 外泌體分泌的non-coding RNA(除miRNA外)對腫瘤轉(zhuǎn)移的影響。

      文獻2:Loss of XIST in Breast Cancer Activates MSN-c-Metand Reprograms Microglia via Exosomal miRNA to

      Promote Brain Metastasis

      1. 篩選差異lncRNA并多數(shù)據(jù)集驗證,找到XIST

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      2. 體內(nèi)外功能試驗驗證XIST對腦轉(zhuǎn)移的影響

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      1. Mammary-specific knockout of XIST促進腦轉(zhuǎn)移

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      1. XIST敲除對細胞功能的影響-EMT和細胞干性

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      1. XIST低表達與轉(zhuǎn)移相關(guān)的通路調(diào)節(jié)

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      1. XIST低表達分泌外泌體miRNA誘導(dǎo)腫瘤微環(huán)境

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      文獻3:Hypoxic exosomes facilitate bladder tumor growth and development through transferring long non-coding RNA-UCA1

      1. 缺氧外泌體介導(dǎo)的細胞功能影響

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      1. 腫瘤細胞攝取外泌體

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      2. lncRNA在腫瘤細胞外泌體中的表達情況

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      1. 體外驗證外泌體lncRNA表達對細胞功能的影響

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      1. 動物實驗驗證外泌體lncRNA對成瘤的影響

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      1. lncRNA的預(yù)后診斷作用

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      1. 啟示外泌體分泌lncRNA也能參與腫瘤微環(huán)境塑造交流


      本期內(nèi)容就到這里,我是白介素2,下期再見,點擊下方框框留言。

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