前導(dǎo)肽,是信號(hào)肽的一種,長(zhǎng)度約20-80個(gè)氨基酸。 前導(dǎo)肽( leader peptide)又稱(chēng)轉(zhuǎn)運(yùn)肽(transit peptide)或?qū)蛐蛄?targeting sequence) ,位于成熟蛋白的N端,引導(dǎo)蛋白穿膜,并且在后來(lái)被剪切掉。 各種實(shí)驗(yàn)表明衰減作用需要負(fù)載色氨酸t(yī)RNA參與,這意味著前導(dǎo)序列的某些部分被翻譯了。分析前導(dǎo)序列發(fā)現(xiàn),它包括起始密碼子AUG和終止密碼子UGA;如果翻譯起始于AUG,應(yīng)該產(chǎn)生一個(gè)含有14個(gè)氨基酸的多肽。這個(gè)假設(shè)的多肽被稱(chēng)為前導(dǎo)肽。 前導(dǎo)肽通常是疏水的。由非電負(fù)性氨基酸構(gòu)成,中間夾有堿性氨基酸,而沒(méi)有酸性氨基酸,羥基氨基酸含量高(特別是Ser),易形成雙親a螺旋輪。不同的前導(dǎo)順序缺乏同源性,這意味著和識(shí)別有關(guān)的信號(hào)不是一極結(jié)構(gòu),而是二極三極結(jié)構(gòu),或這一區(qū)域產(chǎn)生的特點(diǎn)。有一種可能是此前導(dǎo)肽形成一種雙親螺旋,即帶電荷的基團(tuán)在螺旋的一側(cè),不帶電荷的在另一側(cè)。 前導(dǎo)肽含有作為細(xì)胞器蛋白定位所需的所有信息。導(dǎo)肽的這種能力可以通過(guò)構(gòu)建入工蛋白來(lái)檢驗(yàn)。將來(lái)自細(xì)胞器的導(dǎo)肽和位于胞液中的蛋白連接起來(lái)。具體方法是構(gòu)建融合基因(fusion gere)然后翻譯成融合蛋白。 蛋白質(zhì)分泌是生物界中極其普遍的現(xiàn)象。被分泌的蛋白質(zhì)在分泌出膜外時(shí)其肽鏈的N端有一段肽結(jié)構(gòu)。幾乎所有的分泌的蛋白都含有信號(hào)序列。信號(hào)序列一般有20~40氨基酸長(zhǎng),在跨膜運(yùn)輸過(guò)程中,最終被信號(hào)肽酶除去。對(duì)原核生物中已知的信號(hào)肽分析,可發(fā)現(xiàn)有三個(gè)保守特點(diǎn):(1)信號(hào)肽的N端有1~3個(gè)帶正電荷的氨基酸殘基;(2)N端的基本氨基酸后有一延伸的14~20個(gè)中性氨基酸部分,通常稱(chēng)作疏水中心(hydrophobic core);(3)信號(hào)肽切除部位附近的氨基酸有以下特點(diǎn),可以表示為A-X-B。B緊接著切除位點(diǎn)(processing site)??梢允茿la,Gly或Set;A可以是上述氨基酸,也可以是Leu,Val或Ile。除上述三個(gè)基本特點(diǎn)外,許多信號(hào)肽的疏水中心區(qū)含有1或2個(gè)。螺旋不穩(wěn)定的氨基酸殘基如Pro或Gly。 |
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