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      NGS 檢測及其應(yīng)用

       醫(yī)學(xué)abeycd 2021-07-30

      NGS 檢測:高通量測序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。

      Ngs檢測

        高通量測序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。更多內(nèi)容可關(guān)注盛景基因。

        Ngs基因檢測

        高通量測序經(jīng)過近十年來的迅猛發(fā)展,已經(jīng)深入到生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域,不僅有力地推動了基礎(chǔ)研究的發(fā)展,也在逐漸征服臨床應(yīng)用。

        與Sanger法為代表的傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有顯著的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。

        當(dāng)前主要的測序技術(shù)平臺

        1、solexa測序技術(shù)(即大家耳熟能詳?shù)膇llumina測序平臺);

        2、454測序技術(shù)(讀長長,但是準(zhǔn)確度較低,成本較高,即焦磷酸測序技術(shù),少量市場占有);

        3、solid測序技術(shù)(雙色編碼技術(shù),目前基本在市場上見不到了)

        Ngs基因檢測分類

        根據(jù)發(fā)展歷史、影響力、測序原理和技術(shù)不同等,主要有以下幾種:

      大規(guī)模平行簽名測序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、

      聚合酶克隆(Polony Sequencing)、

      454焦磷酸測序(454 pyrosequencing)、

      Illumina (Solexa) sequencing、

      ABI SOLiD sequencing、

      離子半導(dǎo)體測序(Ion semiconductor sequencing)、

      DNA 納米球測序 (DNA nanoball sequencing)等。

        高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(next generation sequencing)足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。

      1、高通量測序在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的應(yīng)用:

      包括疾病基因的篩查,大規(guī)模測病人和正常人的基因,通過基因比較,得出與疾病可能相關(guān)的基因,后續(xù)再診斷這一疾病,即可篩查病人是否有這些基因的突變。比如乳腺癌,現(xiàn)已有較成熟的基因篩查方法。

      高通量測序技術(shù)的誕生可以說是基因組學(xué)研究領(lǐng)域一個(gè)具有里程碑意義的事件。該技術(shù)使得核酸測序的單堿基成本與第一代測序技術(shù)相比急劇下降, 以人類基因組測序?yàn)槔? 上世紀(jì)末進(jìn)行的人類基因組計(jì)劃花費(fèi) 30 億美元解碼了人類生命密碼;

       而第二代測序使得人類基因組測序已進(jìn)入萬(美)元基因組時(shí)代。如此低廉的單堿基測序成本使得我們可以實(shí)施更多物種的基因組計(jì)劃從而解密更多生物物種的基因組遺傳密碼。同時(shí)在已完成基因組序列測定的物種中, 對該物種的其他品種進(jìn)行大規(guī)模地全基因組重測序也成為了可能。

      2、古基因組學(xué)的應(yīng)用:

      對于已經(jīng)滅絕的生物,可通過考古獲得的動物毛發(fā)、骨骼對該物種測序,還可通過樣品中微生物基因組分析,判斷該物種當(dāng)時(shí)的生活環(huán)境。

      如猛犸象線粒體基因組的測序,發(fā)現(xiàn)猛犸象基因復(fù)雜度低,存在高度不穩(wěn)定性,可能這導(dǎo)致了該物種適應(yīng)環(huán)境能力低,在一部分程度上導(dǎo)致了該物種的滅絕。

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