近年來(lái),靶向測(cè)序憑借成本低、數(shù)據(jù)利用率高、組合靈活等優(yōu)勢(shì),在臨床的疾病輔助診斷、治療以及腫瘤基因檢測(cè)中發(fā)揮出積極的作用。 突變基因測(cè)序 病原體/環(huán)境 微生物鑒定 科學(xué)研究 從上面的比較可以看出,使用擴(kuò)增子建庫(kù)富集目的DNA的方法在多個(gè)方面顯著優(yōu)于雜交捕獲方式,特別是在起始量低,用時(shí)較短和成本較低方面。 1、標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增子建庫(kù)流程 標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增子建庫(kù)流程為在完整模板的基礎(chǔ)上投入多重?cái)U(kuò)增的Panel進(jìn)行多重?cái)U(kuò)增,隨后將得到的擴(kuò)增子進(jìn)行引物消化,消化掉多余的引物二聚體以及兩端引物本身的部分序列,獲得平末端的結(jié)構(gòu),與接頭連接后形成完整文庫(kù)。 2、兩步法擴(kuò)增子建庫(kù)流程 圖2. 兩步法擴(kuò)增子建庫(kù)流程。 兩輪擴(kuò)增的方法原理是在基因組基礎(chǔ)上,投入的多重?cái)U(kuò)增的引物帶有一定的修飾,經(jīng)過(guò)第一輪多重?cái)U(kuò)增之后,序列兩端帶有一段接頭序列,第二輪擴(kuò)增將Index添加上去,經(jīng)過(guò)兩輪擴(kuò)增形成完整文庫(kù)。 3、多重PCR產(chǎn)物擴(kuò)增子建庫(kù)流程 圖3. 多重PCR產(chǎn)物擴(kuò)增子建庫(kù)流程。 多重PCR產(chǎn)物擴(kuò)增子建庫(kù)原理是在待測(cè)基因組上投入無(wú)修飾的多重?cái)U(kuò)增引物進(jìn)行多重PCR,產(chǎn)物經(jīng)過(guò)純化后,進(jìn)行常規(guī)DNA建庫(kù)。 Vazyme推出多重?cái)U(kuò)增子建庫(kù)試劑盒升級(jí)產(chǎn)品——VAHTS?AmpSeq Library Prep Kit V3(Vazyme #NA210),產(chǎn)出與均一性雙向起飛! 1. 文庫(kù)產(chǎn)出高 圖4. 不同起始投入量和Panel條件下文庫(kù)產(chǎn)出。 在不同起始投入量下(1ng、10ng、100ng),Vazyme #NA210均能高效建庫(kù),且同類產(chǎn)品相比,文庫(kù)產(chǎn)量更高。 2. 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量高 (1)更高的測(cè)序覆蓋度 圖5. 不同起始投入量和Panel條件下文庫(kù)的測(cè)序覆蓋度。 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量方面,Vazyme #NA210在不同起始量和Panel條件下覆蓋度均高于同類產(chǎn)品。 ![]() (2)更優(yōu)的測(cè)序均一性 ![]() ![]() |
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來(lái)自: 劉得光3p6n6zqq > 《NGS技術(shù)》