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      中國(guó)腸癌防控新突破:血液多基因甲基化檢測(cè)可實(shí)現(xiàn)結(jié)直腸癌早篩和復(fù)發(fā)預(yù)測(cè) | Gastroenterol...

       劉得光3p6n6zqq 2021-10-28
      近日,國(guó)際胃腸疾病領(lǐng)域頂級(jí)期刊《Gastroenterology》(IF 22.7)發(fā)表了由上海鹍遠(yuǎn)生物技術(shù)有限公司(以下簡(jiǎn)稱“鹍遠(yuǎn)生物”)聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院、復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院、廣州市第一人民醫(yī)院、南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院、四川大學(xué)華西醫(yī)院大連大學(xué)附屬新華醫(yī)院的重磅科研成果:“A multi-locus blood-based assay targeting circulating tumor DNA methylation enables early detection and early relapse prediction of colorectal cancer(血液多基因甲基化檢測(cè)可實(shí)現(xiàn)結(jié)直腸癌早篩和復(fù)發(fā)預(yù)測(cè))”。 

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      文章發(fā)表在Gastroenterology

      該研究系國(guó)內(nèi)團(tuán)隊(duì)第一次系統(tǒng)展示多基因甲基化檢測(cè)方法(ColonAiQ,常艾克)從標(biāo)志物篩選、優(yōu)化到驗(yàn)證的完整過程。常艾克檢測(cè)結(jié)直腸癌平均AUC:0.93,結(jié)直腸癌和進(jìn)展期腺瘤平均AUC:0.84,結(jié)直腸癌(Ⅰ-Ⅳ期)的綜合靈敏度為86%(149/173),對(duì)照組健康人群的檢測(cè)特異性為92%(125/136)。這是中國(guó)團(tuán)隊(duì)首次在全球范圍內(nèi)實(shí)現(xiàn)結(jié)直腸癌篩查及復(fù)發(fā)預(yù)測(cè)技術(shù)手段合二為一。常艾克亦是全球第一款具備結(jié)直腸癌早期篩查和術(shù)后監(jiān)測(cè)復(fù)合功能的產(chǎn)品。

      據(jù)世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)(IARC)發(fā)布的2020年全球最新癌癥負(fù)擔(dān)數(shù)據(jù)顯示,世界范圍內(nèi),結(jié)直腸癌已成為第三大常見癌癥;2020年全世界有超過193萬人被新確診為結(jié)直腸癌,發(fā)病率位居所有癌種第三位;超過93萬人死于結(jié)直腸癌,死亡率位居所有癌種第二位。2020年,中國(guó)有超過55萬人新患結(jié)直腸癌,結(jié)直腸癌發(fā)病率躍居國(guó)內(nèi)所有癌種第二位,超過28萬人死于結(jié)直腸癌;多數(shù)結(jié)直腸癌患者在確診時(shí)已屬于中晚期。因而,早篩、早診對(duì)于結(jié)直腸癌整體防控尤為重要。

      就結(jié)直腸癌早篩而言,盡管腸鏡檢查被認(rèn)為是結(jié)直腸癌診斷的金標(biāo)準(zhǔn),但受制于腸鏡的依從性和可及性,更多的患者傾向于基于血液的無創(chuàng)檢查方式[2]。另外,準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)腫瘤復(fù)發(fā),將有助于優(yōu)化輔助治療方案;合理安排術(shù)后監(jiān)測(cè)隨訪,及早發(fā)現(xiàn)腫瘤復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移,及時(shí)地干預(yù)治療仍有可能使復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移癌患者重新獲得治愈機(jī)會(huì),延長(zhǎng)生存期。因此,精準(zhǔn)的復(fù)發(fā)預(yù)測(cè)和動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)仍是結(jié)直腸癌診治中亟需解決的需求[3]。

      在該研究中,研究團(tuán)隊(duì)基于基因甲基化異常與癌癥發(fā)生的相關(guān)性,探討了血液樣本ctDNA甲基化對(duì)結(jié)直腸癌及腺瘤的篩查診斷以及預(yù)測(cè)腫瘤術(shù)后復(fù)發(fā)的性能。結(jié)果顯示,多基因甲基化有望成為解決臨床上結(jié)直腸癌的早篩和復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)問題的新型“腫瘤標(biāo)志物”。 

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      圖1.研究設(shè)計(jì)。

      首先,研究人員對(duì)于常艾克標(biāo)志物進(jìn)行了嚴(yán)謹(jǐn)?shù)暮Y選。研究人員在過往PanSeer研究中篩選出的595個(gè)癌癥相關(guān)基因組區(qū)域的基礎(chǔ)上[1](圖1),進(jìn)一步對(duì)組織樣本進(jìn)行甲基化分析,篩選出前150個(gè)差異甲基化區(qū)域 (DMRs)(圖2A)。考慮到簡(jiǎn)化多重qPCR 檢測(cè)方法在臨床上的適用性,研究人員進(jìn)一步縮小甲基化標(biāo)志物的范圍,最終選擇出6種在組織和血漿中具有更高檢測(cè)能力的標(biāo)志物,用于多位點(diǎn)血液檢測(cè),并命名為常艾克(圖2C和2D)。 

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      圖2.模型中甲基化標(biāo)志物的篩選。

      接下來,在常艾克標(biāo)志物驗(yàn)證階段,研究團(tuán)隊(duì)在507個(gè)血漿樣本中對(duì)鎖定的常艾克模型進(jìn)行盲法驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)該模型能夠檢測(cè)出86%的受檢結(jié)直腸癌患者(173例),在結(jié)腸鏡陰性對(duì)照(136例)中的特異性為92%;并且常艾克的敏感性隨著結(jié)直腸癌的疾病分期進(jìn)展和腫瘤大小的增加而升高(圖2E和2F)。

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      表1.ColonAiQ 在驗(yàn)證結(jié)腸癌早期檢測(cè)中的表現(xiàn)。 

      隨后,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)常艾克與其他非侵入性篩查方法進(jìn)行了比較,相比其他非侵入性篩查方法如糞便隱血試驗(yàn)(FIT)、癌胚抗原(CEA)以及Septin9單位點(diǎn)基因甲基化,常艾克具有顯著優(yōu)越性。在142名接受常艾克和糞便隱血試驗(yàn)(FIT)的受試者中,常艾克在所有腸癌疾病階段的表現(xiàn)均優(yōu)于FIT(88.3% vs 59.7%),尤其是在 Ⅰ期(85.7% vs 28.6%,圖 3D);與CEA相比,常艾克同樣顯著優(yōu)于CEA,兩者對(duì)早期(Ⅰ/Ⅱ) 腸癌病例的檢出率分別為80%-92% 和17%-47%(圖3E);與 Septin9相比,6種標(biāo)志物的組合可以比單獨(dú)的標(biāo)志物捕獲更全面的腫瘤表觀遺傳異質(zhì)性(圖 2G)。

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      圖3. 模型的建立和驗(yàn)證。
      對(duì)于常艾克在結(jié)直腸癌預(yù)后監(jiān)測(cè)中應(yīng)用潛力,研究團(tuán)隊(duì)也進(jìn)行了探索。在所有結(jié)直腸癌患者中,有39名患者在手術(shù)切除腫瘤前1-2天和術(shù)后17-34天提供了血樣。術(shù)前常艾克檢測(cè)陽性的33例患者中,有7例(2例II期,5例III期)在術(shù)后42至238天出現(xiàn)腫瘤復(fù)發(fā)(中位數(shù)117天)。研究人員觀察到復(fù)發(fā)組和非復(fù)發(fā)組術(shù)后樣本的常艾克評(píng)分存在顯著差異 (p=0.00017)(圖 3F)。相應(yīng)的數(shù)據(jù)表明常艾克在預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌的早期復(fù)發(fā)方面具有明確的識(shí)別能力,后續(xù)多中心擴(kuò)大驗(yàn)證正在進(jìn)行中。

      該研究通訊作者

      復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院周平紅教授表示:

      結(jié)直腸癌的早篩、早診是結(jié)直腸癌防控的重點(diǎn)工作;雖然腸鏡是腸癌診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但受限于我國(guó)腸鏡的整體普及率及依從性,目前我國(guó)腸癌篩查策略仍然比較“基礎(chǔ)”。在這個(gè)多中心研究中,我們納入了相對(duì)較多的早癌以及癌前病變樣本,因?yàn)樵绨┖桶┣安∽儾攀呛Y查的重點(diǎn)、難點(diǎn)。從目前結(jié)果看,常艾克結(jié)直腸癌的篩查性能優(yōu)異,令人滿意;而且血液樣本相對(duì)方便,更有利于提高腸癌臨床篩查的依從性。 

      該研究第一作者及共同通訊作者

      復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院蔡國(guó)響教授表示:

      目前結(jié)直腸癌無創(chuàng)篩查,多采用糞便隱血檢測(cè)或流行病學(xué)量表調(diào)查,上海地區(qū)也是全國(guó)較早開展大規(guī)模結(jié)直腸癌無創(chuàng)篩查的城市。從本研究結(jié)果看,血液樣本多基因甲基化檢測(cè)有望作為結(jié)直腸癌篩查策略中的重要補(bǔ)充部分。另外我們通過這個(gè)研究還看到了血液樣本ctDNA甲基化在腸癌術(shù)后復(fù)發(fā)預(yù)測(cè)中的潛力,這在其他研究中鮮有報(bào)道。目前的結(jié)果令人振奮,這會(huì)給臨床醫(yī)生在評(píng)估結(jié)直腸癌術(shù)后復(fù)發(fā)多一個(gè)重要的工具手段;同時(shí)也再次提示“DNA甲基化生物標(biāo)志物”在結(jié)直腸癌早篩、早診、復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)等全流程管理中的應(yīng)用價(jià)值。 

      該研究共同通訊作者

      鹍遠(yuǎn)生物聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席技術(shù)官劉蕊博士表示:
      該研究首先系統(tǒng)地展示了甲基化基因分子靶標(biāo)從篩選、評(píng)價(jià)驗(yàn)證到臨床轉(zhuǎn)化的邏輯過程。我們建立了一套系統(tǒng)完整的癌癥標(biāo)志物的篩選,可以延展到不同癌種不同臨床問題的相關(guān)標(biāo)志物開發(fā)。在我們最終篩選出的六個(gè)位點(diǎn)中,有些交叉在已知的,有明確腸癌相關(guān)性的標(biāo)志物。這也從側(cè)面證明了我們的篩選體系的正確性,高效性,同時(shí)可以發(fā)現(xiàn)創(chuàng)新性靶點(diǎn)的能力。其次,這個(gè)研究的重點(diǎn)是臨床轉(zhuǎn)化,相比NGS等復(fù)雜繁瑣的分子檢測(cè)技術(shù),最后通過多重定量PCR方法學(xué)來實(shí)現(xiàn)相應(yīng)檢測(cè),充分考慮了臨床適宜性及國(guó)內(nèi)醫(yī)療實(shí)情,更具有商業(yè)轉(zhuǎn)化價(jià)值和便于落地基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)。最后,該研究也充分展示了血液檢測(cè)的臨床應(yīng)用延展性,不僅可以涵蓋癌癥的早期檢測(cè),而且可以有效地評(píng)估MRD,對(duì)早期復(fù)發(fā)有預(yù)判作用,并且可以有效地預(yù)后監(jiān)控,從而覆蓋癌癥病人的全流程管理。 

      鹍遠(yuǎn)生物聯(lián)合創(chuàng)始人、首席執(zhí)行官

      張江立先生表示:
      在鹍遠(yuǎn)的整個(gè)產(chǎn)品體系中,結(jié)直腸癌是非常重要的一個(gè)板塊,鹍遠(yuǎn)從成立之初就開始了結(jié)直腸癌篩查和術(shù)后監(jiān)測(cè)技術(shù)的研發(fā)。經(jīng)過不斷的探索,我們聚焦在血液樣本多基因甲基化檢測(cè)技術(shù)上。首先,血液樣本依從性很好,更符合我國(guó)目前腫瘤篩查的主要場(chǎng)景,如體檢中心、醫(yī)院、政府民生工程等。其次,血液樣本的擴(kuò)展性和普適性更好。我們的技術(shù)平臺(tái)可以支持我們從不同癌種中去篩查更多潛在有價(jià)值的甲基化標(biāo)志物;從而開發(fā)出更多的癌癥篩查產(chǎn)品。
      原文鏈接:
      Gastroenterology Paper DOI:https:///10.1053/j.gastro.2021.08.054
      參考文獻(xiàn):
      [1] Adler A, et al.  BMC Gastroenterol 2014;14:183.
      [2] Rutter MD, et al.  Gut 2020;69:201-223.
      [3] Chen X, Gole J, Gore A, et al.  Nat Commun 2020;11:3475.

      · END ·

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