蛋白質(zhì)差異性分析能夠極大地推動發(fā)現(xiàn)新的生物標志物，提升生物標志物鑒定的精準度，對臨床疾病分析具有重要價值。百泰派克能夠基于統(tǒng)計學數(shù)據(jù)提供更精準的蛋白質(zhì)差異分析，以發(fā)現(xiàn)在不同生理狀態(tài)下和不同組織中的蛋白質(zhì)水平表現(xiàn)的顯著差異。在差異表達蛋白統(tǒng)計過程中，將FC≥1.3(或≤1/1.3)作為差異蛋白的統(tǒng)計標準。FC≥1.3的蛋白認為是上調(diào)（up-regulation），F(xiàn)C≤1/1.3的蛋白認為是下調(diào)（down-regulation）。差異表達蛋白數(shù)目統(tǒng)計如下表：

差異表達蛋白數(shù)目統(tǒng)計表

1.韋恩圖

通過韋恩圖可以清晰看出兩組差異組合之間的共有和特有差異表達蛋白數(shù)量：

圖1 差異表達蛋白韋恩圖

2.火山圖

通過火山圖（Volcano Plot）可以快速地查看蛋白在兩個（組）樣品中表達水平的差異，以及差異的統(tǒng)計學顯著性。

圖2 差異表達蛋白火山圖

注：差異表達火山圖中的每一個點表示一個蛋白，橫坐標表示某一個蛋白在兩樣品中表達量差異倍數(shù)的對數(shù)值；縱坐標表示t檢驗p value。橫坐標絕對值越大，說明表達量在兩樣品間的表達量倍數(shù)差異越大；縱坐標值越大，表明差異表達越顯著，篩選得到的差異表達基因越可靠。圖中綠色的點代表差異表達下調(diào)蛋白，紅色的點代表差異表達上調(diào)蛋白，黑色表示非差異表達蛋白。