從有機(jī)分子到細(xì)胞生命。我們知道,生命的兩大基石是蛋白質(zhì)和核酸。雖然我們前面兩節(jié)課,并沒(méi)有解決地球上蛋白質(zhì)和核酸的起源問(wèn)題。但我們現(xiàn)在不得不假設(shè)一下,說(shuō)好了啊,只是假設(shè)。假設(shè)在原始地球條件下,這兩大物質(zhì)已經(jīng)形成了。但很明顯,這兩種生物大分子單獨(dú)存在的時(shí)候并不會(huì)表現(xiàn)任何生命現(xiàn)象,而我們平時(shí)看到的大分子的生命現(xiàn)象,是因?yàn)樗鼈冃纬闪硕喾肿芋w系。那么,現(xiàn)在很直接的問(wèn)題就是:生物大分子是如何組裝成多分子體系呢?它們需要在什么條件下才能組裝呢?所以,這是生物大分子合成后,緊接著要解答的問(wèn)題。目前有兩個(gè)經(jīng)典的實(shí)驗(yàn)?zāi)P鸵苍S可以給我們提供一些思路。 第一個(gè)呢,是前蘇聯(lián)生物化學(xué)家奧巴林所提出的團(tuán)聚體模型。他認(rèn)為呀,原始海洋中的生物大分子要想繼續(xù)演化成生命,必須組成一個(gè)體系,并形成一個(gè)分界或者一個(gè)膜與周圍環(huán)境分開,這才有可能維持一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的環(huán)境條件進(jìn)一步發(fā)生演變。他就思考這個(gè)問(wèn)題,想到了將蛋白質(zhì)溶液與核酸溶液混合起來(lái),構(gòu)成了一種多分子體系。然后他就在顯微鏡下觀察,果然就看到了團(tuán)聚體小滴,與水之間有明顯的界限,這張圖就是他觀察到的團(tuán)聚體小滴的照片。接著,他又混合了更多的溶液來(lái)進(jìn)行觀察,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)與糖類、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)與核酸,都可能形成團(tuán)聚體。所以,奧巴林就認(rèn)為,這些團(tuán)聚體能表現(xiàn)某些生命現(xiàn)象,當(dāng)然就可以作為生物模型來(lái)進(jìn)行研究啦。但是,奧巴林所制造的這種團(tuán)聚體,有一個(gè)很明顯的悖論,他用的原料是白明膠和阿拉伯膠,大家可能知道,這是現(xiàn)代生物體所產(chǎn)生的物質(zhì)啊,有了生命之后,產(chǎn)生這樣的現(xiàn)象并奇怪呀。也就是說(shuō),最終呀,這個(gè)實(shí)驗(yàn)觀察其實(shí)是缺乏說(shuō)服力的。 第二個(gè),就是美國(guó)科學(xué)家??怂固岢龅念惖鞍孜⑶蝮w模型。1959,??怂挂?0種天然氨基酸為原料,模擬原始地球的干熱條件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。他之所以用20種天然氨基酸為原料,就是為了讓這種物質(zhì)的生化機(jī)能與蛋白質(zhì)接近,但是呢又不能是生物合成的蛋白質(zhì),所以,我們這里暫且稱這個(gè)為類蛋白吧。為了模擬原始地球的干熱條件,他就將各種氨基酸按一定比例混合,在干燥無(wú)氧條件下加熱到160℃~170℃,最后他得到了分子量很高的類蛋白微球聚合物,然后再這些物質(zhì)放到很稀的鹽水中加熱,使其溶解,冷卻后溶液變成了白色渾濁狀,這就是就他在顯微鏡下觀察類蛋白微球體時(shí)拍攝的照片。 然后,??怂咕蛯?duì)此又做了很多實(shí)驗(yàn)。他發(fā)現(xiàn),當(dāng)類蛋白微球體加壓的時(shí)候呀,會(huì)發(fā)生類似細(xì)胞分裂的現(xiàn)象。當(dāng)改變類蛋白微球體懸液的酸堿度的時(shí)候,可以表現(xiàn)出雙層膜的特征。微球體懸液放置一段時(shí)間后,還可以看到出芽的現(xiàn)象。把芽分離出來(lái),置于飽和的類蛋白溶液中,并從37℃冷卻到25℃,芽還可以生長(zhǎng),變成第二代微球,第二代微球也會(huì)和第一代微球那樣具有能分裂,出芽,長(zhǎng)大等類似生物的現(xiàn)象。所以,通過(guò)上面所介紹的這兩個(gè)模型呀,說(shuō)明了生物大分子是可以自動(dòng)聚集起來(lái)的,并形成獨(dú)立的多分子體系。 剛才說(shuō)到了膜,那么膜起源這個(gè)過(guò)程,首先是脂肪酸膜的出現(xiàn),這樣,構(gòu)成生命的化學(xué)物質(zhì)就可以被捕捉到膜內(nèi),并孕育出更復(fù)雜的生命活動(dòng)。但問(wèn)題是,膜系統(tǒng)這樣復(fù)雜的結(jié)構(gòu),如何才能獲取自我復(fù)制和繁殖的能力,從而允許演化的發(fā)生呢?德國(guó)馬普研究所一幫科學(xué)家,就研究了這種化學(xué)活性液滴,也就是”化學(xué)物質(zhì)在周圍液體和液滴內(nèi)反復(fù)進(jìn)出”的物理行為,發(fā)現(xiàn)這些液滴生長(zhǎng)到細(xì)胞大小后就會(huì)自動(dòng)發(fā)生分裂。咦,這種行為似乎與我們的常識(shí)不一致吧。大家在觀察水中油滴融合的時(shí)候,也許油滴只會(huì)變得越來(lái)越大,但并不會(huì)發(fā)生分裂。他們的這個(gè)研究結(jié)果,發(fā)表在2016 年 12 月的Nature Physics上,有興趣的可以看一看。這篇論文用化學(xué)活性液滴的生長(zhǎng)、分裂行為來(lái)解釋細(xì)胞繁殖,大家看,是不是為我們描繪了又一個(gè)生命起源的可能圖景。 現(xiàn)在的大多教科書中都說(shuō):所謂細(xì)胞,就是出現(xiàn)膜結(jié)構(gòu),可區(qū)分出外部和內(nèi)部。所以膜起源就非常重要。我們這里看一個(gè)膜起源假說(shuō),這個(gè)學(xué)說(shuō)認(rèn)為:膜結(jié)構(gòu)和分隔化的形成是生命功能實(shí)現(xiàn)的必要條件,這樣的過(guò)程發(fā)生在3538億年前。這個(gè)假說(shuō)還認(rèn)為,原始的第一個(gè)細(xì)胞必須具備以下幾個(gè)基本性質(zhì):(1)有類似質(zhì)膜的生物膜;(2)有能完成自我復(fù)制和自發(fā)整合的生命大分子物質(zhì)體系;(3)具有內(nèi)在的物質(zhì)代謝、能量代謝和信息交流的基本性能。 這一張圖是我們熟悉的中心法則,我們知道如今的生命形式建立了從DNA到RNA,再到蛋白質(zhì)的秩序,生命的主宰物質(zhì)就是核酸和蛋白質(zhì)。同樣,生物大分子起源的研究是解開生命起源奧秘的鑰匙,那么核酸與蛋白質(zhì)究竟是哪個(gè)先發(fā)生的呢?排列組合一下,那只有三種情況:核酸先、蛋白質(zhì)先、二者同時(shí)。但核酸先發(fā)生的可能性要大一些,因?yàn)楹怂岬臉?gòu)成成分相對(duì)來(lái)說(shuō)比較簡(jiǎn)單,聚合較容易一些。后來(lái),RNA催化活性的發(fā)現(xiàn),就解決了先有多聚核苷酸,還是先有多肽鏈的兩難困境,表明最初的生化系統(tǒng)是集中在RNA上,這就是著名的RNA世界假說(shuō)。 該假說(shuō)認(rèn)為,在生命起源的某個(gè)時(shí)期,生命體僅僅由一種高分子化合物RNA組成,沒(méi)有蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)酶。而遺傳信息的傳遞是RNA的復(fù)制,其復(fù)制機(jī)理與當(dāng)今DNA復(fù)制機(jī)理相似,而作為生物催化劑的蛋白質(zhì),因?yàn)樾枰蚓幋a,所以那個(gè)時(shí)候還不存在。那么這個(gè)時(shí)候的催化反應(yīng)只好由具備催化活性的RNA分子,也就是核酶來(lái)代勞了。此時(shí),RNA是唯一的遺傳物質(zhì),是生命的源頭。 說(shuō)到從原始生命體到真正細(xì)胞形態(tài)生命的這道鴻溝,我們不得不提及一下元古宙時(shí)期的藍(lán)細(xì)菌繁盛時(shí)代。以前的教科書認(rèn)為藍(lán)細(xì)菌繁盛時(shí)代是從25億年到7億年前,但美國(guó)加州大學(xué)1989年的一項(xiàng)工作,將這個(gè)年限提前到了35億年前。我們知道,藍(lán)細(xì)菌是一種很奇特的生物,它能像植物一樣進(jìn)行光合作用,但卻是原核生物,因此在進(jìn)化生物學(xué)上有著非常重要的意義。尤其值得關(guān)注的是,這漫長(zhǎng)的藍(lán)細(xì)菌繁盛,造成了地球環(huán)境的重大變化:首先,藍(lán)菌光合作用釋放氧氣改變了地球大氣成分,同時(shí)由于藍(lán)細(xì)菌活動(dòng)引起的碳酸鹽沉積,大氣中的CO2含量逐步下降,為真核生物及多細(xì)胞生物起源創(chuàng)造了條件;其次,海洋物理化學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,像這個(gè)鈣、鎂離子的濃度就開始下降,這當(dāng)然就引起了pH值的相應(yīng)改變;另外,地球表面平均溫度下降,這部分是因?yàn)榇髿釩O2濃度下降所導(dǎo)致的,我們能理解。而同時(shí),我們知道,藍(lán)細(xì)菌繁盛時(shí)代所造成的環(huán)境改變,又是藍(lán)細(xì)菌自身衰落的主要原因。其實(shí)在生物進(jìn)化中,許多物種的出現(xiàn)與衰落都有類似的情況。 我們?cè)賮?lái)看一些化石證據(jù)。15億年前的細(xì)胞化石,其個(gè)體的直徑只有10微米,而14億年前的細(xì)胞化石,其個(gè)體直徑達(dá)到了60微米。這個(gè)證據(jù)就說(shuō)明,在地球上是先有原核細(xì)胞,再有真核細(xì)胞的。但是,真核細(xì)胞是不是真的來(lái)自原核細(xì)胞,或者說(shuō)怎樣來(lái)自原核細(xì)胞,這些問(wèn)題到現(xiàn)在為止還沒(méi)有一個(gè)滿意的答案。 那么,有關(guān)真核細(xì)胞的產(chǎn)生,現(xiàn)在有兩種爭(zhēng)論不休的說(shuō)法,一種是分化假說(shuō),或稱為膜進(jìn)化假說(shuō),另一種是共生起源假說(shuō)。分化假說(shuō)認(rèn)為,真核細(xì)胞器是由原生質(zhì)外膜向內(nèi)伸和核質(zhì)再分配而同時(shí)形成的,原核生物到真核生物是漸進(jìn)的、直接的進(jìn)化過(guò)程。但這里有一個(gè)問(wèn)題是,既然各種細(xì)胞器是同時(shí)形成的,那為何不同的細(xì)胞器生化特性又如此不同呢?而共生起源假說(shuō)則認(rèn)為,一種較大的細(xì)胞把另一種較小的細(xì)胞“吞吃”到細(xì)胞里面,但并不把小細(xì)胞消化掉,而是與其建立起一種互惠的共生關(guān)系,即大細(xì)胞利用小細(xì)胞的某種功能,從中得益,小細(xì)胞則利用大細(xì)胞提供的環(huán)境與食物,得以更好的生存。正如我們這張圖所展示的,線粒體可能來(lái)源于紫細(xì)菌,葉綠體可能來(lái)源于藍(lán)細(xì)菌。而且,現(xiàn)在越來(lái)越多的分子生物學(xué)證據(jù),還傾向于支持該學(xué)說(shuō)。但這個(gè)學(xué)說(shuō)也有一個(gè)問(wèn)題,無(wú)法解釋細(xì)胞核的起源;而且,根據(jù)內(nèi)共生學(xué)說(shuō),在代謝上占明顯優(yōu)勢(shì)的共生體要將大量遺傳信息轉(zhuǎn)移到宿主細(xì)胞上,這顯然很讓人費(fèi)解。 無(wú)論如何,我們知道真核生物在進(jìn)化有非常重要的意義。首先,真核細(xì)胞的形成,為生物的性分化和有性生殖打下了基礎(chǔ),也是推進(jìn)生物進(jìn)化的主要?jiǎng)恿?。在生物進(jìn)化的30億年中,無(wú)性生物時(shí)代占了近三分之二的時(shí)間,生命長(zhǎng)期處于單細(xì)胞階段,進(jìn)化極為緩慢。有性生殖出現(xiàn)后,個(gè)體不再是一成不變地拷貝親本的基因。在有性生殖下,每個(gè)個(gè)體都有兩套基因,通過(guò)基因重組產(chǎn)生新的遺傳變異成為可能,提高了物種的變異性,增大了變異量,進(jìn)化速度也就加快了。 其次,真核細(xì)胞的出現(xiàn),推動(dòng)了生物向多細(xì)胞化方向的發(fā)展。盡管從一些原核生物開始就有了多細(xì)胞化傾向,但原核細(xì)胞的遺傳系統(tǒng)根本就不足以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞間復(fù)雜的遺傳調(diào)控,所以不可能進(jìn)化到組織、器官的結(jié)構(gòu)水平,只是停留在細(xì)胞集群的等級(jí)上。只有真核細(xì)胞才有細(xì)胞分化的可能,發(fā)展出分化組織,產(chǎn)生能行使特殊功能的器官,使生物向更高級(jí)方向發(fā)展。 有關(guān)多細(xì)胞生物進(jìn)化的問(wèn)題,我們下一節(jié)課再討論,本節(jié)課到此結(jié)束。 |
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